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天蓝色链霉菌调控蛋白SCO3008的功能研究

摘要第11-13页
Abstract第13-15页
第一章 研究背景第16-28页
    1.1 链霉菌第16-18页
        1.1.1 链霉菌简介第16页
        1.1.2 链霉菌的生活史第16-17页
        1.1.3 链霉菌的次级代谢产物第17-18页
    1.2 双组份信号转导系统第18-21页
        1.2.1 双组份信号转导系统简介第18-19页
        1.2.2 双组份信号转导系统的作用机制第19-20页
        1.2.3 天蓝色链霉菌孤儿基因简介第20-21页
    1.3 链霉菌中相关基因的简介第21-26页
        1.3.1 bld基因简介第21-22页
        1.3.2 wbl基因简介第22-25页
        1.3.3 chp、rdl基因简介第25-26页
    1.4 立题依据与研究内容第26-28页
第二章 实验材料和方法第28-60页
    2.1 实验材料第28-37页
        2.1.1 菌株和质粒第28-30页
        2.1.2 引物第30-33页
        2.1.3 培养基第33-36页
        2.1.4 抗生素浓度和使用浓度第36-37页
    2.2 实验方法第37-60页
        2.2.1 天蓝色链霉菌的菌种保藏及培养第37页
        2.2.2 天蓝色链霉菌总基因组DNA的提取第37-38页
        2.2.3 基因缺失突变株A3008的构建、筛选和验证第38-42页
        2.2.4 天蓝色链霉菌回补菌株△3008/pMS3008及其载体对照菌株△3008/pMS82的构建、筛选和验证第42-43页
        2.2.5 天蓝色链霉菌的表型分析第43-46页
        2.2.6 天蓝色链霉菌总RNA的提取第46-47页
        2.2.7 野生型M145与突变株△3008的转录组分析第47-48页
        2.2.8 His-3008融合蛋白表达与纯化第48-50页
        2.2.9 SDS-PAGE电泳和相关试剂第50-51页
        2.2.10 SCO3008的体外结合试验第51-52页
        2.2.11 Flag标签回补菌株的构建及染色质免疫共沉淀试验第52-56页
        2.2.12 DNA-Pull down试验第56-58页
        2.2.13 wblA的敲除与回补菌株构建与筛选第58-60页
第三章 实验结果与分析第60-98页
    3.1 SCO3008的保守性分析第60-61页
    3.2 基因缺失突变株△3008的构建第61-65页
        3.2.1 文库筛选sco3008阳性克隆第61页
        3.2.2 目的基因sco3008缺失突变cosmid的构建第61-64页
        3.2.3 突变株△3008的筛选及鉴定第64页
        3.2.4 突变株△3008的初步观察第64-65页
    3.3 回补菌株△3008/pMS3008、载体对照菌株△3008/pMS82的构建第65-68页
        3.3.1 回补菌株△3008/pMS3008的构建第65-66页
        3.3.2 回补菌株△3008/pMS3008的筛选和验证第66-68页
        3.3.3 载体对照菌株A3008/pMS82的构建、筛选和验证第68页
    3.4 M145、△3008和A3008/pMS3008的表型分析第68-72页
        3.4.1 M145、△3008和A3008/pMS3008的表型观察第68-71页
        3.4.2 M145、△3008和A3008/pMS3008 com的扫描电子显微镜观察第71-72页
    3.5 M145、△3008和A3008/pMS3008次级代谢产物合成分析第72-75页
        3.5.1 生长曲线测定第72页
        3.5.2 放线紫红素(Act)的相对含量测定第72-74页
        3.5.3 十一烷基灵菌红素(Red)的相对含量测定第74-75页
    3.6 M145与△3008的转录组分析第75-79页
    3.7 SCO3008蛋白的表达第79-81页
    3.8 Flag标签回补菌株的构建与检测第81-87页
        3.8.1 Flag-tag回补菌株的构建第81-84页
        3.8.2 Flag-tag互补菌株的表型观察第84-85页
        3.8.3 Flag-tag回补菌株的标签检测第85-87页
    3.9 染色质免疫共沉淀试验(Chromatin Immunoprecipitation sequence,ChIP-seq)第87-89页
        3.9.1 ChIP样品处理第87-88页
        3.9.2 ChIP-Seq分析SC03008的靶基因第88页
        3.9.3 ChIP -qPCR分析SC03008对靶基因的调控作用第88-89页
    3.10 DNA-Pull down分析SC03008对靶基因的调控作用第89-91页
    3.11 wblA的敲除与回补及表型分析第91-98页
        3.11.1 sco3579 (wblA)的敲除第91-93页
        3.11.2 回补菌株△wblA/pMS82-wblA的构建第93-95页
        3.11.3 M145、△wblA、△wblA/pMS82-wblA的表型分析第95-96页
        3.11.4 M145、△wblA、△3008的表型分析第96-98页
第四章 总结与展望第98-100页
    4.1 全文总结第98-99页
    4.2 研究展望第99-100页
附录第100-102页
参考文献第102-106页
致谢第106-107页
学位论文评阅及答辩情况表第107页

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