首页--生物科学论文--植物学论文--植物细胞遗传学论文--植物基因工程论文

盐芥TsNAC1转录因子及其在玉米中同源基因功能的研究

中文摘要第8-12页
Abstract第12-17页
符号说明第18-19页
第一章 文献综述第19-38页
    1.1 盐胁迫危害和植物耐盐机制第19-26页
        1.1.1 盐胁迫对植物的影响第19-20页
        1.1.2 植物抗/耐盐胁迫机制第20-25页
            1.1.2.1 渗透调节第21-22页
            1.1.2.2 光合作用调节第22-23页
            1.1.2.3 植物激素的调节第23-24页
            1.1.2.4 抗氧化系统调节第24-25页
        1.1.3 转录因子在植物响应盐胁迫中的作用第25-26页
    1.2 植物生长速率的调控第26-30页
        1.2.1 植物激素在细胞分裂和扩张的调控中起重要作用第27-28页
        1.2.2 植物细胞壁发育制约细胞的扩张速度第28-29页
        1.2.3 渗透胁迫对器官及细胞形态的影响第29-30页
    1.3 NAC转录因子的研究进展第30-33页
        1.3.1 NAC转录因子的结构特点第31-32页
        1.3.2 NAC转录因子的功能第32-33页
            1.3.2.1 NAC参与植物非生物胁迫响应第32页
            1.3.2.2 NAC转录因子影响植物生长发育第32-33页
            1.3.2.3 NAC转录因子的表达及活性调控第33页
    1.4 HD转录因子的研究进展第33-35页
        1.4.1 HD转录因子的结构特点第33页
        1.4.2 ZFHD转录因子功能的多样性第33-34页
        1.4.3 HD转录因子的二聚体形态第34-35页
    1.5 模式植物盐芥的研究现状第35-36页
    1.6 本论文的立题依据和研究目标第36-38页
第二章 盐芥TsNAC1转录因子的功能分析及下游调控网络的鉴定第38-73页
    2.1 材料与方法第38-51页
        2.1.1 材料第38-39页
            2.1.1.1 植物材料及培养条件第38页
            2.1.1.2 菌株和质粒载体第38-39页
            2.1.1.3 培养基及药品试剂第39页
        2.1.2 试验方法第39-51页
            2.1.2.1 转基因材料的鉴定第39页
            2.1.2.2 TsNAC1表达模式分析第39-41页
            2.1.2.3 转基因材料蛋白表达水平测定第41-42页
            2.1.2.4 转录激活能力测试载体的构建第42-43页
            2.1.2.5 ChIP和ChIP-qPCR第43-47页
            2.1.2.6 启动子结合实验载体的构建第47页
            2.1.2.7 Real-time RT-PCR分析TsNAC1下游在盐芥中的表达模式第47-48页
            2.1.2.8 EMSA第48-49页
            2.1.2.9 定点突变及TsNAC1结合基序的确定第49页
            2.1.2.10 酵母菌株的遗传转化第49-50页
            2.1.2.11 β-半乳糖酶活性的测定第50-51页
    2.2 实验结果与分析第51-67页
        2.2.1 转基因盐芥的筛选第51-52页
        2.2.2 TsNAC1的表达强度同植株的生长成反向相关第52-53页
        2.2.3 转基因株系细胞大小的统计第53-54页
        2.2.4 TsNAC1表达模式分析第54-56页
        2.2.5 TsNAC1转基因植株的抗逆性分析第56-57页
        2.2.6 转录因子TsNAC1转录激活能力的测定第57-59页
        2.2.7 TsNAC1识别TsVP1的盐响应130bp核心启动子序列第59页
        2.2.8 ChIP-Seq结果分析第59-63页
            2.2.8.1 TsNAC1抗体的特异性检测第59-60页
            2.2.8.2 ChIP效率的检测第60-61页
            2.2.8.3 ChIP-Seq分析报告第61-63页
        2.2.9 TsNAC1下游调控基因的鉴定第63-65页
            2.2.9.1 候选下游基因的表达模式第63-64页
            2.2.9.2 候选靶基因的ChIP-qPCR确定第64页
            2.2.9.3 酵母单杂交鉴定第64-65页
        2.2.10 TsNAC1识别CA(T/A)G核心序列第65-67页
            2.2.10.1 MEME-ChIP分析第65-66页
            2.2.10.2 EMSA验证第66-67页
            2.2.10.3 TsNAC1结合定点突变片段能力的酵母单杂交检测第67页
    2.3 讨论第67-73页
        2.3.1 TsNAC1参与植物的多种非生物胁迫过程第68-69页
        2.3.2 TsNAC1参与调节细胞的离子转运第69-70页
        2.3.3 TsNAC1的高表达限制细胞的扩张过程第70-71页
        2.3.4 TsNAC1对胚胎发育过程的调控第71-72页
        2.3.5 胁迫耐受性和生长延缓关系的探讨第72-73页
第三章 TsNAC1互作因子的鉴定及作用方式的分析第73-110页
    3.1 材料与方法第73-81页
        3.1.1 实验材料第73页
        3.1.2 实验方法第73-81页
            3.1.2.1 盐芥总蛋白及核蛋白的提取第73页
            3.1.2.2 免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation)第73页
            3.1.2.3 TsHD1的克隆和重组第73-74页
            3.1.2.4 体外分段互作载体的构建第74-75页
            3.1.2.5 酵母验证互作区段的质粒构建第75-76页
            3.1.2.6 Pull-down实验第76页
            3.1.2.7 农杆菌注射烟草叶片的瞬时表达第76-77页
            3.1.2.8 Native-PAGE第77页
            3.1.2.9 EMSA设计第77-78页
            3.1.2.10 酵母单杂交鉴定LSH1和TXT2启动子区的核心基序第78-79页
            3.1.2.11 植物过表达载体的构建第79页
            3.1.2.12 转录组分析第79页
            3.1.2.13 ChIP-qPCR第79页
            3.1.2.14 RT-PCR第79-80页
            3.1.2.15 荧光素酶活性检测第80页
            3.1.2.16 非生物胁迫处理第80-81页
    3.2 实验结果第81-105页
        3.2.1 TsHD1全长基因的克隆及信息学分析第81页
        3.2.2 TsHD1转录激活活性的鉴定第81-82页
        3.2.3 TsHD1与TsNAC1互作的验证第82-85页
            3.2.3.1 酵母水平的合作验证第82-83页
            3.2.3.2 体外互作第83-84页
            3.2.3.3 植物体内互作验证第84-85页
        3.2.4 TsHD1与TsNAC1的互作模式的探究第85-90页
            3.2.4.1 TsHD1通过zinc finger domain形成同源二聚体第85-87页
            3.2.4.2 TsHD1 zinc finger domain与TsNAC1 A subdomain互作第87-88页
            3.2.4.3 互作模式在酵母体内的验证第88-89页
            3.2.4.4 TsNAC1和TsHD1多聚体分子量的鉴定第89-90页
        3.2.5 TsHD1核心识别位点T(A/T)AATT的验证第90-92页
        3.2.6 TsHD1与TsNAC1的协同作用第92-94页
            3.2.6.1 酵母单杂交验证第92-93页
            3.2.6.2 TsNAC1与TsHD1在植物体内互作模式的验证第93-94页
        3.2.7 转基因盐芥的产生第94-96页
        3.2.8 转目的转录因子盐芥材料的基因表达谱分析第96-97页
        3.2.9 候选下游基因的鉴定第97-99页
        3.2.10 TsHD1和TsNAC1的过表达提高了植物耐热和耐旱性第99-100页
        3.2.11 TsHD1和TsNAC1二聚体稳定性验证第100-102页
        3.2.12 TsNAC1和TsHD1在染色质上识别位点与转录组数据的对应性分析第102-105页
    3.3 讨论第105-110页
        3.3.1 TsNAC1的A subdomain与TsHD1的锌指subdomain互作形成异源二聚体第105页
        3.3.2 TsHD1与TsNAC1在植物非生物胁迫响应中扮演上游调控因子的角色第105-106页
        3.3.3 过表达TsHD1上调HSPs和DREB2A的表达来提高植株的耐热性第106-107页
        3.3.4 TsHD1和TsNAC1协同抑制细胞壁的发育第107页
        3.3.5 转录组差异与二聚体比例关系的讨论第107-108页
        3.3.6 TsHD1和TsNAC1的调控模式第108-110页
第四章 玉米ZmNACs亚家族基因的功能研究第110-152页
    4.1 材料与方法第110-115页
        4.1.1 材料第110页
        4.1.2 实验方法第110-115页
            4.1.2.1 目的基因的克隆及过表达载体的构建第110-111页
            4.1.2.2 转基因材料的获得及检测第111页
            4.1.2.3 Mu插入突变的鉴定第111-112页
            4.1.2.4 玉米小苗培养及胁迫处理第112页
            4.1.2.5 酵母双杂交所用载体的构建第112-113页
            4.1.2.6 玉米cDNA文库的制备第113页
            4.1.2.7 表达模式分析第113页
            4.1.2.8 Pull-down实验第113-114页
            4.1.2.9 酵母单杂交试验第114页
            4.1.2.10 ChIP-Seq方法第114页
            4.1.2.11 EMSA检测第114-115页
    4.2 实验结果第115-147页
        4.2.1 候选基因的选择第115-116页
        4.2.2 ZmNACs基因表达模式分析第116-119页
        4.2.3 玉米转基因材料的产生、筛选和鉴定第119-123页
            4.2.3.1 玉米ZmNACs基因的克隆和植物表达载体构建第119-121页
            4.2.3.2 转ZmNACs基因植株的产生和分子检测第121-122页
            4.2.3.3 ZmNACs-GFP融合表达株系的产生和鉴定第122-123页
        4.2.4 ZmSNACs基因Mu转座子插入突变体的鉴定第123-124页
        4.2.5 ZmSNACs蛋白的细胞定位第124-125页
        4.2.6 ZmNACs参与玉米生长速率的调控第125-129页
            4.2.6.1 ZmNACs参与玉米种子萌发和叶片生长的调控第125-127页
            4.2.6.2 ZmNACs参与玉米植株大小的调控第127-129页
        4.2.7 ZmNACs的表达水平对玉米耐盐性的影响第129-130页
        4.2.8 ZmNACs互作蛋白的筛选第130-139页
            4.2.8.1 pGBKT7-BD-ZmSNAC1/ZmNAC23/ZmNAC20质粒自激活能力检测第130页
            4.2.8.2 玉米pGADT7-cDNA Y187文库构建第130-131页
            4.2.8.3 ZmNACs互作蛋白的筛选第131-136页
            4.2.8.4 ZmNACs互作蛋白的初步分析第136-138页
            4.2.8.5 转录因子异源二聚体稳定性分析第138-139页
        4.2.9 ZmNACs下游调控基因的筛选第139-145页
            4.2.9.1 ZmNACs-GFP融合蛋白的DNA结合能力的检测第139-140页
            4.2.9.2 采用ChIP-Seq寻找下游靶基因第140-141页
            4.2.9.3 候选靶基因表达水平的检测第141-143页
            4.2.9.4 酵母单杂交验证ZmNACs与其靶基因的结合第143-145页
        4.2.10 ZmNACs识别位点的确定第145-146页
            4.2.10.1 MEME分析第145页
            4.2.10.2 EMSA鉴定ZmNACs识别位点第145-146页
        4.2.11 ZmNACs成员调控网络的比较第146-147页
    4.3 讨论第147-152页
        4.3.1 ZmNACs表达水平对玉米营养生长的影响第147-149页
        4.3.2 ZmNACs通过不同下游靶参与玉米对胁迫响应第149-150页
        4.3.3 基因表达的协同性与功能的关系第150-151页
        4.3.4 影响异源二聚体丰度的的因素第151-152页
第五章 总结与展望第152-154页
参考文献第154-170页
附录第170-177页
在读期间发表论文第177页
在校期间获得奖励第177-178页
致谢第178-179页
附件第179页

论文共179页,点击 下载论文
上一篇:Arrestin介导GPCR与SH3结构域蛋白信号转导的别构调节机制
下一篇:卷曲额外维中的修改引力及宇宙学