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基于高通量测序的功能微生物分析及其在对虾白斑综合症病毒载体疫苗构建中的应用

摘要第4-8页
abstract第8-12页
第一章 前言第16-29页
    1.1 微生物多样性第16-17页
        1.1.1 微生物的基本概念第16页
        1.1.2 微生物多样性第16页
        1.1.3 微生物多样性的分析方法第16-17页
    1.2 高通量测序技术第17-19页
        1.2.1 高通量测序技术概述第18页
        1.2.2 高通量测序技术平台第18-19页
        1.2.3 高通量测序技术在微生物群落多样性分析中的应用第19页
    1.3 对虾白斑综合症病毒第19-24页
        1.3.1 对虾白斑综合症第19页
        1.3.2 对虾白斑综合症病毒的发现与命名第19-20页
        1.3.3 WSSV的形态特征与理化性质第20页
        1.3.4 WSSV的基因组学第20-21页
        1.3.5 WSSV的蛋白质组学第21-23页
        1.3.6 WSSV的传播途径第23-24页
        1.3.7 WSSV的检测技术第24页
    1.4 表面展示技术第24-25页
        1.4.1 表面展示技术简介第24页
        1.4.2 表面展示系统的组成结构第24-25页
    1.5 冰核蛋白第25-26页
        1.5.1 冰核蛋白的来源第25页
        1.5.2 冰核蛋白的结构第25-26页
        1.5.3 冰核蛋白的应用第26页
    1.6 冰核蛋白表面展示第26-27页
        1.6.1 冰核蛋白表面展示简介第26页
        1.6.2 冰核蛋白表面展示技术的应用第26-27页
    1.7 研究内容与目的第27-28页
    1.8 研究意义第28-29页
第二章 高通量测序技术在微生物类群及功能菌群分析中的应用第29-58页
    2.1 前言第29页
    2.2 实验材料第29-31页
        2.2.1 实验样品采集第29-30页
        2.2.2 实验用仪器与试剂第30页
        2.2.3 实验用引物第30-31页
    2.3 实验方法第31-36页
        2.3.1 粪便基因组DNA的提取第31-32页
        2.3.2 真菌基因组DNA的提取第32页
        2.3.3 冬虫夏草总基因组DNA的提取第32-33页
        2.3.4 PCR扩增第33-34页
        2.3.5 高通量测序第34-36页
    2.4 实验结果第36-55页
        2.4.1 羊粪样品中细菌菌群高通量测序结果第36-43页
        2.4.2 冬虫夏草中真菌菌群测序结果第43-55页
    2.5 讨论第55-58页
第三章 细菌裂解酶菌蜕系统启动子的筛选第58-76页
    3.1 前言第58-59页
    3.2 实验材料第59-61页
        3.2.1 实验用仪器与试剂第59-60页
        3.2.2 实验用菌株和质粒第60-61页
        3.2.3 实验用引物第61页
    3.3 实验方法第61-66页
        3.3.1 重组质粒的构建第61-62页
        3.3.2 质粒DNA的提取第62-63页
        3.3.3 细菌DNA的提取第63-64页
        3.3.4 电击转化用细胞的制备第64页
        3.3.5 电击转化第64页
        3.3.6 阳性克隆筛选第64-66页
        3.3.7 重组基因体外诱导表达第66页
    3.4 实验结果第66-75页
        3.4.1 重组质粒的构建第66-67页
        3.4.2 二联吡啶工作浓度的选择第67-69页
        3.4.3 两种酶体外诱导表达效果对比第69-70页
        3.4.4 不同fur启动子的筛选第70-72页
        3.4.5 重组质粒在病原菌中的表达情况第72-75页
    3.5 讨论第75-76页
第四章 对虾白斑综合症病毒(WSSV)细菌载体疫苗的开发第76-86页
    4.1 前言第76-77页
    4.2 实验材料第77-79页
        4.2.1 实验样品采集第77页
        4.2.2 实验用菌株和质粒第77-78页
        4.2.3 实验用引物第78页
        4.2.4 实验用仪器与试剂第78-79页
    4.3 实验方法第79-81页
        4.3.1 对虾肠道菌群分离第79页
        4.3.2 细菌DNA的提取第79-80页
        4.3.3 pJIVP28表达载体的构建第80页
        4.3.4 质粒DNA的提取第80页
        4.3.5 电击转化用细胞的制备第80-81页
        4.3.6 电击转化第81页
        4.3.7 筛选阳性克隆第81页
        4.3.8 重组蛋白表达活性检测第81页
    4.4 实验结果第81-84页
        4.4.1 对虾肠道菌群分离结果第81-82页
        4.4.2 pJIVP28表面展示菌株的构建第82-83页
        4.4.3 重组蛋白VP28表达活性检测第83-84页
    4.5 讨论第84-86页
第五章 展望第86-87页
参考文献第87-98页
附录一第98-99页
附录二第99-107页
致谢第107页

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