摘要 | 第4-8页 |
abstract | 第8-12页 |
第一章 前言 | 第16-29页 |
1.1 微生物多样性 | 第16-17页 |
1.1.1 微生物的基本概念 | 第16页 |
1.1.2 微生物多样性 | 第16页 |
1.1.3 微生物多样性的分析方法 | 第16-17页 |
1.2 高通量测序技术 | 第17-19页 |
1.2.1 高通量测序技术概述 | 第18页 |
1.2.2 高通量测序技术平台 | 第18-19页 |
1.2.3 高通量测序技术在微生物群落多样性分析中的应用 | 第19页 |
1.3 对虾白斑综合症病毒 | 第19-24页 |
1.3.1 对虾白斑综合症 | 第19页 |
1.3.2 对虾白斑综合症病毒的发现与命名 | 第19-20页 |
1.3.3 WSSV的形态特征与理化性质 | 第20页 |
1.3.4 WSSV的基因组学 | 第20-21页 |
1.3.5 WSSV的蛋白质组学 | 第21-23页 |
1.3.6 WSSV的传播途径 | 第23-24页 |
1.3.7 WSSV的检测技术 | 第24页 |
1.4 表面展示技术 | 第24-25页 |
1.4.1 表面展示技术简介 | 第24页 |
1.4.2 表面展示系统的组成结构 | 第24-25页 |
1.5 冰核蛋白 | 第25-26页 |
1.5.1 冰核蛋白的来源 | 第25页 |
1.5.2 冰核蛋白的结构 | 第25-26页 |
1.5.3 冰核蛋白的应用 | 第26页 |
1.6 冰核蛋白表面展示 | 第26-27页 |
1.6.1 冰核蛋白表面展示简介 | 第26页 |
1.6.2 冰核蛋白表面展示技术的应用 | 第26-27页 |
1.7 研究内容与目的 | 第27-28页 |
1.8 研究意义 | 第28-29页 |
第二章 高通量测序技术在微生物类群及功能菌群分析中的应用 | 第29-58页 |
2.1 前言 | 第29页 |
2.2 实验材料 | 第29-31页 |
2.2.1 实验样品采集 | 第29-30页 |
2.2.2 实验用仪器与试剂 | 第30页 |
2.2.3 实验用引物 | 第30-31页 |
2.3 实验方法 | 第31-36页 |
2.3.1 粪便基因组DNA的提取 | 第31-32页 |
2.3.2 真菌基因组DNA的提取 | 第32页 |
2.3.3 冬虫夏草总基因组DNA的提取 | 第32-33页 |
2.3.4 PCR扩增 | 第33-34页 |
2.3.5 高通量测序 | 第34-36页 |
2.4 实验结果 | 第36-55页 |
2.4.1 羊粪样品中细菌菌群高通量测序结果 | 第36-43页 |
2.4.2 冬虫夏草中真菌菌群测序结果 | 第43-55页 |
2.5 讨论 | 第55-58页 |
第三章 细菌裂解酶菌蜕系统启动子的筛选 | 第58-76页 |
3.1 前言 | 第58-59页 |
3.2 实验材料 | 第59-61页 |
3.2.1 实验用仪器与试剂 | 第59-60页 |
3.2.2 实验用菌株和质粒 | 第60-61页 |
3.2.3 实验用引物 | 第61页 |
3.3 实验方法 | 第61-66页 |
3.3.1 重组质粒的构建 | 第61-62页 |
3.3.2 质粒DNA的提取 | 第62-63页 |
3.3.3 细菌DNA的提取 | 第63-64页 |
3.3.4 电击转化用细胞的制备 | 第64页 |
3.3.5 电击转化 | 第64页 |
3.3.6 阳性克隆筛选 | 第64-66页 |
3.3.7 重组基因体外诱导表达 | 第66页 |
3.4 实验结果 | 第66-75页 |
3.4.1 重组质粒的构建 | 第66-67页 |
3.4.2 二联吡啶工作浓度的选择 | 第67-69页 |
3.4.3 两种酶体外诱导表达效果对比 | 第69-70页 |
3.4.4 不同fur启动子的筛选 | 第70-72页 |
3.4.5 重组质粒在病原菌中的表达情况 | 第72-75页 |
3.5 讨论 | 第75-76页 |
第四章 对虾白斑综合症病毒(WSSV)细菌载体疫苗的开发 | 第76-86页 |
4.1 前言 | 第76-77页 |
4.2 实验材料 | 第77-79页 |
4.2.1 实验样品采集 | 第77页 |
4.2.2 实验用菌株和质粒 | 第77-78页 |
4.2.3 实验用引物 | 第78页 |
4.2.4 实验用仪器与试剂 | 第78-79页 |
4.3 实验方法 | 第79-81页 |
4.3.1 对虾肠道菌群分离 | 第79页 |
4.3.2 细菌DNA的提取 | 第79-80页 |
4.3.3 pJIVP28表达载体的构建 | 第80页 |
4.3.4 质粒DNA的提取 | 第80页 |
4.3.5 电击转化用细胞的制备 | 第80-81页 |
4.3.6 电击转化 | 第81页 |
4.3.7 筛选阳性克隆 | 第81页 |
4.3.8 重组蛋白表达活性检测 | 第81页 |
4.4 实验结果 | 第81-84页 |
4.4.1 对虾肠道菌群分离结果 | 第81-82页 |
4.4.2 pJIVP28表面展示菌株的构建 | 第82-83页 |
4.4.3 重组蛋白VP28表达活性检测 | 第83-84页 |
4.5 讨论 | 第84-86页 |
第五章 展望 | 第86-87页 |
参考文献 | 第87-98页 |
附录一 | 第98-99页 |
附录二 | 第99-107页 |
致谢 | 第107页 |