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谷氨酸棒杆菌选择性σ因子σ~E的功能研究

摘要第3-4页
Abstract第4页
第一章 绪论第7-14页
    1.1 σ因子第7页
    1.2 谷氨酸棒杆菌中的选择性σ因子第7-11页
        1.2.1 σ~B第8页
        1.2.2 σ~C和σ~D第8-9页
        1.2.3 σ~H第9-10页
        1.2.4 σ~M第10-11页
        1.2.5 σ~E第11页
    1.3 σ因子研究中需要注意的问题第11-13页
    1.4 立题依据及意义第13-14页
第二章 材料与方法第14-19页
    2.1 实验材料第14页
        2.1.1 菌株、质粒和引物第14页
        2.1.2 培养基和培养条件第14页
        2.1.3 酶和试剂第14页
        2.1.4 主要仪器第14页
    2.2 实验方法第14-19页
        2.2.1 基本的分子生物学实验操作第14-15页
        2.2.2 质粒构建与基因敲除第15-16页
        2.2.3 胁迫处理第16-17页
        2.2.4 RNA提取以及RT-qPCR第17页
        2.2.5 cDNA5′末端快速扩增第17页
        2.2.6 染色质免疫共沉淀第17-18页
        2.2.7 生长曲线的绘制第18页
        2.2.8 乙醇胁迫敏感性测定第18页
        2.2.9 EGFP表达强度测定第18页
        2.2.10 SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳样品的制备第18-19页
第三章 结果与讨论第19-36页
    3.1 σ~E的生理功能鉴定第19-24页
        3.1.1 不同胁迫下各σ因子mRNA表达水平第19-21页
        3.1.2 乙醇胁迫敏感性试验第21-22页
        3.1.3 sigE敲除对菌体聚集度和生长的影响第22-23页
        3.1.4 不同生长阶段下sigE的mRNA表达水平第23-24页
    3.2 σ~E对sigB的调控研究第24-25页
        3.2.1 σ~E的敲除和过表达在转录水平对sigB的影响第24-25页
        3.2.2 ChIP实验验证σ~E对sigB的直接调控第25页
        3.2.3 sigE在乙醇胁迫中介导了sigB的表达第25页
    3.3 sigE-cseE的转录调控分析第25-28页
        3.3.1 5′RACEPCR鉴定sigE-cseE的转录起始位点第25-26页
        3.3.2 σ~E调控了cseE的转录第26-27页
        3.3.3 σ~E与σ~H的调控相关性第27-28页
    3.4 乙醇和σ~E的激活影响了外源蛋白表达第28-31页
        3.4.1 不同乙醇浓度对sigE启动子表达EGFP的影响第28-29页
        3.4.2 不同乙醇浓度对tac启动子表达EGFP的影响第29-30页
        3.4.3 cseE敲除影响了EGFP表达水平第30-31页
    3.5 低浓度乙醇在外源蛋白表达中的应用研究第31-36页
        3.5.1 低浓度乙醇诱导下的生长变化和荧光强度变化第31-32页
        3.5.2 乙酸无法替代乙醇诱导EGFP的表达第32-33页
        3.5.3 几种常见培养基的成本和效果比较第33-34页
        3.5.4 乙醇诱导启动子的构建第34-36页
主要结论与展望第36-37页
    主要结论第36页
    展望第36-37页
致谢第37-38页
参考文献第38-42页
附录A:引物列表第42-44页
附录B:作者在攻读硕士学位期间发表的论文第44页

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