| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4-5页 |
| 第1章 引言 | 第10-19页 |
| 1.1 研究背景 | 第10-12页 |
| 1.2 理论模拟方法 | 第12-17页 |
| 1.2.1 量子化学方法 | 第14页 |
| 1.2.2 全原子分子动力学模拟方法 | 第14-15页 |
| 1.2.3 粗粒化分子动力学模拟方法 | 第15-16页 |
| 1.2.4 非平衡分子动力学模拟方法 | 第16-17页 |
| 1.3 论文研究内容 | 第17-19页 |
| 第2章 量子化学方法 | 第19-30页 |
| 2.1 定态薛定谔方程 | 第19-21页 |
| 2.1.1 哈密顿量 | 第19-20页 |
| 2.1.2 非相对论近似 | 第20页 |
| 2.1.3 玻恩-奥本海默近似 | 第20-21页 |
| 2.1.4 单电子近似 | 第21页 |
| 2.2 Hartree-Fock 理论 | 第21-24页 |
| 2.2.1 Hartree 理论 | 第21-22页 |
| 2.2.2 Hartree-Fock 理论 | 第22-24页 |
| 2.3 密度泛函理论 | 第24-28页 |
| 2.3.1 Thomas-Fermi 理论 | 第25页 |
| 2.3.2 Hohenberg-Kohn 理论 | 第25-26页 |
| 2.3.3 Kohn-Sham 理论 | 第26-27页 |
| 2.3.4 交换关联泛函 | 第27-28页 |
| 2.4 基组 | 第28-30页 |
| 2.4.1 斯莱特基组 | 第29页 |
| 2.4.2 高斯型基组 | 第29页 |
| 2.4.3 压缩高斯型基组 | 第29-30页 |
| 第3章 全原子分子动力学模拟方法 | 第30-43页 |
| 3.1 研究背景 | 第30页 |
| 3.2 基本原理 | 第30-31页 |
| 3.3 分子动力学计算流程 | 第31-33页 |
| 3.3.1 估计计算的可行性 | 第31-32页 |
| 3.3.2 分子动力学计算流程 | 第32-33页 |
| 3.4 分子力场 | 第33-38页 |
| 3.4.1 力场方法的势能表达形式 | 第33-36页 |
| 3.4.2 力场方法的本质和改进 | 第36-37页 |
| 3.4.3 分子力场类型 | 第37-38页 |
| 3.5 积分步长的选取 | 第38页 |
| 3.6 周期性边界条件 | 第38-40页 |
| 3.7 能量的截断和构建邻表 | 第40-41页 |
| 3.8 加强采样 | 第41-43页 |
| 第4章 粗粒化分子动力学模拟方法 | 第43-52页 |
| 4.1 研究背景 | 第43-44页 |
| 4.2 粗粒化一般步骤 | 第44-47页 |
| 4.2.1 映像过程 | 第44-45页 |
| 4.2.2 粗粒化模型的力场 | 第45-47页 |
| 4.3 粗粒化方法分类 | 第47-50页 |
| 4.3.1 力匹配法 | 第47页 |
| 4.3.2 MARTINI 力场法 | 第47-50页 |
| 4.4 本章小结 | 第50-52页 |
| 第5章 缺电子的杂原子桥连杯芳烃体系阴离子结合特性的理论研究 | 第52-66页 |
| 5.1 研究背景 | 第52-54页 |
| 5.2 计算细节 | 第54页 |
| 5.3 结果和讨论 | 第54-65页 |
| 5.3.1 二体配合物的结构和能量 | 第54-57页 |
| 5.3.2 非共价键相互作用 | 第57-60页 |
| 5.3.3 三体配合物的结构和能量 | 第60-62页 |
| 5.3.4 溶剂效应 | 第62-65页 |
| 5.4 本章小结 | 第65-66页 |
| 第6章 含光异构化偶氮苯的表面活性剂与α-环糊精超分子组装的分子动力学模拟 | 第66-82页 |
| 6.1 研究背景 | 第66-67页 |
| 6.2 模型和模拟方法 | 第67-70页 |
| 6.2.1 建模 | 第67-68页 |
| 6.2.2 模拟细节 | 第68-69页 |
| 6.2.3 修改力场 | 第69-70页 |
| 6.3 结果与讨论 | 第70-80页 |
| 6.3.1 水溶液中包合型配合物的形成 | 第71-73页 |
| 6.3.2 由主客体相互作用引起的结构变化 | 第73-76页 |
| 6.3.3 氢键分析 | 第76-77页 |
| 6.3.4 α-环糊精空腔中水分子 | 第77-78页 |
| 6.3.5 平均力势的计算 | 第78-80页 |
| 6.4 本章小结 | 第80-82页 |
| 第7章 光控组装和解组装的粗粒化分子动力学模拟 | 第82-98页 |
| 7.1 研究背景 | 第82-83页 |
| 7.2 模型和模拟方法 | 第83-88页 |
| 7.2.1 模型的建立 | 第83-84页 |
| 7.2.2 映射 | 第84-85页 |
| 7.2.3 粗粒化力场 | 第85-86页 |
| 7.2.4 全原子分子动力学模拟 | 第86-87页 |
| 7.2.5 粗粒化分子动力学模拟 | 第87-88页 |
| 7.3 结果和讨论 | 第88-96页 |
| 7.3.1 全原子和粗粒化分子动力学模拟的胶束结构比较 | 第88-89页 |
| 7.3.2 α-CD 的全原子和粗粒化模型对比 | 第89-91页 |
| 7.3.3 cis-AzoC10 和 trans-AzoC10 聚集情况 | 第91-93页 |
| 7.3.4 α-CD/cis-AzoC10 自组装 | 第93-94页 |
| 7.3.5 trans-AzoC10/α-CD 解组装 | 第94-96页 |
| 7.4 本章小结 | 第96-98页 |
| 第8章 利用晶格形变调控有机半导体电荷输运性能的理论理解 | 第98-118页 |
| 8.1 研究背景 | 第98-100页 |
| 8.2 计算方法 | 第100-103页 |
| 8.2.1 建模 | 第100页 |
| 8.2.2 非平衡分子动力学模拟 | 第100-101页 |
| 8.2.3 重整能 | 第101-102页 |
| 8.2.4 转移积分 | 第102页 |
| 8.2.5 电荷转移速率 | 第102-103页 |
| 8.2.6 载流子迁移率 | 第103页 |
| 8.3 结果与讨论 | 第103-116页 |
| 8.3.1 应力—应变曲线 | 第103-106页 |
| 8.3.2 晶格形变下 TIPS-P 分子晶体的电荷传输性能 | 第106-110页 |
| 8.3.3 结构—性能关系预测 | 第110-114页 |
| 8.3.4 结合剪切应变和正应变，调节 TIPS-P 的电荷传输性能 | 第114-116页 |
| 8.4 本章小结与展望 | 第116-118页 |
| 第9章 总结与展望 | 第118-120页 |
| 参考文献 | 第120-138页 |
| 致谢 | 第138-140页 |
| 附录 | 第140-153页 |
| 个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第153-154页 |
