| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 缩写词对照表 | 第11-12页 |
| 1 文献综述 | 第12-21页 |
| 1.1 骨骼肌生长发育过程 | 第12-13页 |
| 1.2 骨骼肌发育调控研究现状 | 第13-18页 |
| 1.2.1 mRNA与骨骼肌发育 | 第13-15页 |
| 1.2.2 miRNA与骨骼肌发育 | 第15-16页 |
| 1.2.3 lncRNA与骨骼肌发育 | 第16-18页 |
| 1.3 转录组测序技术研究概况 | 第18-20页 |
| 1.3.1 转录组 | 第18-19页 |
| 1.3.2 RNA-seq技术 | 第19-20页 |
| 1.4 本研究的目的及意义 | 第20-21页 |
| 2 材料与方法 | 第21-30页 |
| 2.1 试验动物 | 第21页 |
| 2.2 仪器与试剂 | 第21-22页 |
| 2.2.1 主要仪器设备 | 第21-22页 |
| 2.2.2 主要试剂 | 第22页 |
| 2.3 试验方法 | 第22-30页 |
| 2.3.1 总RNA的提取 | 第22-23页 |
| 2.3.2 总RNA的质检 | 第23-25页 |
| 2.3.3 RNA-seq的文库构建及测序 | 第25页 |
| 2.3.4 测序数据的处理与分析 | 第25-27页 |
| 2.3.5 差异表达基因的qPCR定量验证 | 第27-30页 |
| 3 结果与分析 | 第30-54页 |
| 3.1 总RNA质量检测 | 第30-31页 |
| 3.1.1 总RNA甲醛变性琼脂糖凝胶检测结果 | 第30页 |
| 3.1.2 总RNA毛细管电泳检测结果 | 第30-31页 |
| 3.2 测序数据概述以及质量评估 | 第31-32页 |
| 3.3 clean reads与参考基因组的比对 | 第32-33页 |
| 3.4 转录本拼接结果及其覆盖度分析 | 第33-34页 |
| 3.5 mRNA转录本的鉴定与分析 | 第34-38页 |
| 3.6 序列变异(SNV和INDELS)的鉴定结果 | 第38-39页 |
| 3.7 差异表达mRNA的鉴定和功能富集分析 | 第39-53页 |
| 3.7.1 差异表达mRNA的鉴定 | 第39-40页 |
| 3.7.2 差异表达mRNA转录组的聚类分析 | 第40-41页 |
| 3.7.3 差异表达mRNA的功能富集分析 | 第41-53页 |
| 3.8 RNA-SEQ数据的验证 | 第53-54页 |
| 4 讨论 | 第54-57页 |
| 4.1 转录组中的单核苷酸变异和插入缺失突变 | 第54页 |
| 4.2 骨骼肌发育过程中高表达的mRNA转录本 | 第54-55页 |
| 4.3 不同发育阶段差异表达的mRNA涉及的生物学通路 | 第55-56页 |
| 4.4 RNA-seq结果的可靠性 | 第56-57页 |
| 5 结论 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-62页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第62-63页 |
| 致谢 | 第63页 |