摘要 | 第1-4页 |
Abstract | 第4-8页 |
前言 | 第8-9页 |
文献综述 | 第9-55页 |
第一章 生物信息学研究进展 | 第9-16页 |
1 生物信息学的研究目标和任务 | 第9-10页 |
2 生物信息学研究内容 | 第10-14页 |
·基因组核酸序列的装配 | 第10页 |
·寻找新基因 | 第10页 |
·非编码区分析 | 第10-11页 |
·蛋白质结构和功能预测 | 第11-12页 |
·蛋白质结构预测 | 第11页 |
·蛋白质功能预测 | 第11-12页 |
·基因组序列比对 | 第12页 |
·分子系统进化研究 | 第12页 |
·遗传密码的起源研究 | 第12-13页 |
·单核苷酸多态性研究 | 第13页 |
·比较基因组学研究 | 第13页 |
·系统生物学研究 | 第13-14页 |
·药物分子设计 | 第14页 |
3 生物信息学的应用范围 | 第14页 |
4 生物信息学的研究意义 | 第14-16页 |
第二章 牦牛的分布及其生物学特性 | 第16-18页 |
1 牦牛的分布 | 第16页 |
2 牦牛的生物学特性 | 第16-18页 |
第三章 JHDM2A 基因和 JHDM2A 的研究进展 | 第18-24页 |
1 组蛋白甲基化与去甲基化 | 第18-19页 |
·组蛋白甲基化、去甲基化与表观遗传学 | 第18页 |
·组蛋白甲基化与去甲基化的研究进展 | 第18-19页 |
2 JHDM2A 与JHDM2A 的研究进展 | 第19-24页 |
·JHDM2A 的研究 | 第19页 |
·JMJD 家族研究概况 | 第19-20页 |
·组蛋白去甲基化酶与JHDM2A | 第20-21页 |
·JHDM2A 与JMJD 家族的生理功能 | 第21-23页 |
·调控精子发育 | 第21页 |
·调节性激素受体 | 第21-23页 |
·调控代谢基因表达 | 第23页 |
·展望 | 第23-24页 |
第四章 牦牛 JHDM2A 基因的克隆测序及其生物信息学分析 | 第24-54页 |
1 材料与方法 | 第24-31页 |
·试验材料及分析软件 | 第24-26页 |
·实验动物及样品的采集 | 第24页 |
·主要仪器设备 | 第24-25页 |
·主要药品试剂 | 第25页 |
·主要分析软件 | 第25-26页 |
·试验方法 | 第26-27页 |
·总RNA 的提取 | 第26页 |
·总RNA 的检测 | 第26-27页 |
·琼脂糖凝胶电泳检测 | 第26页 |
·全自动电泳检测 | 第26-27页 |
·RT-PCR 扩增与克隆 | 第27-30页 |
·cDNA 第一条链合成 | 第27页 |
·引物设计与合成 | 第27-28页 |
·PCR 扩增 | 第28页 |
·电泳 | 第28-29页 |
·PCR 产物的胶回收 | 第29页 |
·连接 | 第29页 |
·转化 | 第29-30页 |
·大肠杆菌JM109 感受态细胞的制备 | 第29-30页 |
·连接产物的转化 | 第30页 |
·重组子的鉴定 | 第30页 |
·生物信息学分析 | 第30-31页 |
·序列测定与比较 | 第30页 |
·牦牛JHDM2A 蛋白的氨基酸序列预测及比较分析 | 第30页 |
·牦牛JHDM2A 蛋白的性质分析与结构功能预测 | 第30-31页 |
2 结果与分析 | 第31-50页 |
·牦牛RNA 纯度的检测 | 第31页 |
·牦牛JHDM2A 基因cDNA 的 PCR 扩增 | 第31-32页 |
·牦牛JHDM2A 基因重组子的鉴定 | 第32页 |
·牦牛JHDM2A 基因的核苷酸序列及比对 | 第32-36页 |
·JHDM2A 基因的核苷酸序列 | 第32-34页 |
·牦牛与其他4 个物种JHDM2A 基因序列的比对 | 第34-36页 |
·牦牛JHDM2A 蛋白的氨基酸序列及比对 | 第36-38页 |
·牦牛JHDM2A 蛋白的性质 | 第38-48页 |
·牦牛JHDM2A 蛋白的氨基酸组成、分子量、等电点 | 第38-39页 |
·牦牛JHDM2A 蛋白的疏水性 | 第39-40页 |
·牦牛JHDM2A 蛋白的跨膜区 | 第40-41页 |
·牦牛JHDM2A 蛋白的定位 | 第41页 |
·牦牛JHDM2A 蛋白的信号肽及比对 | 第41-42页 |
·牦牛JHDM2A 蛋白的磷酸化位点 | 第42-43页 |
·牦牛JHDM2A 蛋白的结构域 | 第43-46页 |
·牦牛JHDM2A 蛋白质的二级结构及其对比 | 第46-48页 |
·牦牛JHDM2A 蛋白质的三级结构 | 第48页 |
·牦牛JHDM2A 基因的密码子偏好性 | 第48-50页 |
3 讨论 | 第50-54页 |
·牦牛JHDM2A 基因的核苷酸序列 | 第50页 |
·牦牛JHDM2A 蛋白的氨基酸序列 | 第50-51页 |
·牦牛JHDM2A 蛋白的生物学特征 | 第51页 |
·JHDM2A 基因及其JHDM2A 蛋白的功能 | 第51-54页 |
结论 | 第54-55页 |
参考文献 | 第55-59页 |
附录一 | 第59-73页 |
附录二 | 第73-78页 |
致谢 | 第78-79页 |