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牦牛JHDM2A基因的克隆测序及其生物信息学分析

摘要第1-4页
Abstract第4-8页
前言第8-9页
文献综述第9-55页
 第一章 生物信息学研究进展第9-16页
  1 生物信息学的研究目标和任务第9-10页
  2 生物信息学研究内容第10-14页
   ·基因组核酸序列的装配第10页
   ·寻找新基因第10页
   ·非编码区分析第10-11页
   ·蛋白质结构和功能预测第11-12页
     ·蛋白质结构预测第11页
     ·蛋白质功能预测第11-12页
   ·基因组序列比对第12页
   ·分子系统进化研究第12页
   ·遗传密码的起源研究第12-13页
   ·单核苷酸多态性研究第13页
   ·比较基因组学研究第13页
   ·系统生物学研究第13-14页
   ·药物分子设计第14页
  3 生物信息学的应用范围第14页
  4 生物信息学的研究意义第14-16页
 第二章 牦牛的分布及其生物学特性第16-18页
  1 牦牛的分布第16页
  2 牦牛的生物学特性第16-18页
 第三章 JHDM2A 基因和 JHDM2A 的研究进展第18-24页
  1 组蛋白甲基化与去甲基化第18-19页
   ·组蛋白甲基化、去甲基化与表观遗传学第18页
   ·组蛋白甲基化与去甲基化的研究进展第18-19页
  2 JHDM2A 与JHDM2A 的研究进展第19-24页
   ·JHDM2A 的研究第19页
   ·JMJD 家族研究概况第19-20页
   ·组蛋白去甲基化酶与JHDM2A第20-21页
   ·JHDM2A 与JMJD 家族的生理功能第21-23页
     ·调控精子发育第21页
     ·调节性激素受体第21-23页
     ·调控代谢基因表达第23页
   ·展望第23-24页
 第四章 牦牛 JHDM2A 基因的克隆测序及其生物信息学分析第24-54页
  1 材料与方法第24-31页
   ·试验材料及分析软件第24-26页
     ·实验动物及样品的采集第24页
     ·主要仪器设备第24-25页
     ·主要药品试剂第25页
     ·主要分析软件第25-26页
   ·试验方法第26-27页
     ·总RNA 的提取第26页
     ·总RNA 的检测第26-27页
       ·琼脂糖凝胶电泳检测第26页
       ·全自动电泳检测第26-27页
   ·RT-PCR 扩增与克隆第27-30页
     ·cDNA 第一条链合成第27页
     ·引物设计与合成第27-28页
     ·PCR 扩增第28页
     ·电泳第28-29页
     ·PCR 产物的胶回收第29页
     ·连接第29页
     ·转化第29-30页
       ·大肠杆菌JM109 感受态细胞的制备第29-30页
       ·连接产物的转化第30页
     ·重组子的鉴定第30页
   ·生物信息学分析第30-31页
     ·序列测定与比较第30页
     ·牦牛JHDM2A 蛋白的氨基酸序列预测及比较分析第30页
     ·牦牛JHDM2A 蛋白的性质分析与结构功能预测第30-31页
  2 结果与分析第31-50页
   ·牦牛RNA 纯度的检测第31页
   ·牦牛JHDM2A 基因cDNA 的 PCR 扩增第31-32页
   ·牦牛JHDM2A 基因重组子的鉴定第32页
   ·牦牛JHDM2A 基因的核苷酸序列及比对第32-36页
     ·JHDM2A 基因的核苷酸序列第32-34页
     ·牦牛与其他4 个物种JHDM2A 基因序列的比对第34-36页
   ·牦牛JHDM2A 蛋白的氨基酸序列及比对第36-38页
   ·牦牛JHDM2A 蛋白的性质第38-48页
     ·牦牛JHDM2A 蛋白的氨基酸组成、分子量、等电点第38-39页
     ·牦牛JHDM2A 蛋白的疏水性第39-40页
     ·牦牛JHDM2A 蛋白的跨膜区第40-41页
     ·牦牛JHDM2A 蛋白的定位第41页
     ·牦牛JHDM2A 蛋白的信号肽及比对第41-42页
     ·牦牛JHDM2A 蛋白的磷酸化位点第42-43页
     ·牦牛JHDM2A 蛋白的结构域第43-46页
     ·牦牛JHDM2A 蛋白质的二级结构及其对比第46-48页
     ·牦牛JHDM2A 蛋白质的三级结构第48页
   ·牦牛JHDM2A 基因的密码子偏好性第48-50页
  3 讨论第50-54页
   ·牦牛JHDM2A 基因的核苷酸序列第50页
   ·牦牛JHDM2A 蛋白的氨基酸序列第50-51页
   ·牦牛JHDM2A 蛋白的生物学特征第51页
   ·JHDM2A 基因及其JHDM2A 蛋白的功能第51-54页
 结论第54-55页
参考文献第55-59页
附录一第59-73页
附录二第73-78页
致谢第78-79页

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