| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6页 |
| 英文缩略表 | 第12-13页 |
| 第一章 引言 | 第13-23页 |
| 1.1 单体型研究进展 | 第13-17页 |
| 1.1.1 单体型在牛育种中的研究进展 | 第14页 |
| 1.1.2 单体型构建方法的研究进展 | 第14-16页 |
| 1.1.2.1 Clark算法 | 第14-15页 |
| 1.1.2.2 最大似然算法 | 第15-16页 |
| 1.1.2.3 贝叶斯算法 | 第16页 |
| 1.1.3 连锁不平衡测度 | 第16-17页 |
| 1.1.3.1 连锁不平衡系数D' | 第16-17页 |
| 1.1.3.2 连锁不平衡系数r2 | 第17页 |
| 1.2 全基因组选择的研究进展 | 第17-21页 |
| 1.2.1 畜禽全基因组选择的发展及其应用 | 第17-19页 |
| 1.2.2 全基因组选择的计算方法 | 第19-21页 |
| 1.2.2.1 GBLUP方法 | 第19-20页 |
| 1.2.2.2 BayesA方法 | 第20页 |
| 1.2.2.3 BayesB方法 | 第20页 |
| 1.2.2.4 BayesCπ方法 | 第20-21页 |
| 1.3 单体型在全基因组选择中的研究进展 | 第21页 |
| 1.4 全基因组选择存在的问题及展望 | 第21-22页 |
| 1.5 本研究的目的和意义 | 第22-23页 |
| 第二章 材料与方法 | 第23-29页 |
| 2.1 试验材料 | 第23页 |
| 2.1.1 参考群体的构建及表型数据收集 | 第23页 |
| 2.1.2 血样采集及基因型数据获得 | 第23页 |
| 2.2 基因型数据处理 | 第23-25页 |
| 2.2.1 基因型数据质量控制 | 第23-25页 |
| 2.2.2 基因型数据构建G阵 | 第25页 |
| 2.3 表型数据处理 | 第25-26页 |
| 2.3.1 表型数据固定效应 | 第25页 |
| 2.3.2 表型性状遗传参数估计 | 第25-26页 |
| 2.4 全基因组单体型构建 | 第26页 |
| 2.5 单体型的基因组育种值估计 | 第26-28页 |
| 2.5.1 GBLUP模型估计单体型效应值 | 第26-27页 |
| 2.5.2 BayesA模型估计单体型效应值 | 第27-28页 |
| 2.5.3 BayesCπ 模型估计单体型效应值 | 第28页 |
| 2.6 单SNP的基因组育种值估计 | 第28页 |
| 2.7 基因组育种值估计的准确性评价 | 第28-29页 |
| 第三章 结果与分析 | 第29-43页 |
| 3.1 DNA凝胶电泳和分光光度计检测结果 | 第29页 |
| 3.2 基因型数据质量控制结果 | 第29-30页 |
| 3.3 表型数据基本统计量 | 第30-32页 |
| 3.4 单体型构建结果 | 第32-35页 |
| 3.5 基因型育种值估计 | 第35-41页 |
| 3.5.1 基因组育种值估计的准确性 | 第35-38页 |
| 3.5.2 不同单体型阈值的基因组育种值估计的准确性 | 第38-40页 |
| 3.5.3 比较基于SNP与基因单体型估计基因组育种值的准确性 | 第40-41页 |
| 3.6 运算时间的比较 | 第41-43页 |
| 第四章 讨论 | 第43-45页 |
| 4.1 连锁不平衡程度对基因组选择的影响 | 第43页 |
| 4.2 统计方法对基因组选择的影响 | 第43-44页 |
| 4.3 单体型估计基因组育种值 | 第44-45页 |
| 第五章 全文结论 | 第45-46页 |
| 参考文献 | 第46-52页 |
| 致谢 | 第52-53页 |
| 作者简历 | 第53页 |