摘要 | 第12-14页 |
ABSTRACT | 第14-16页 |
缩略词 | 第17-18页 |
第一章 绪论 | 第18-30页 |
1.1 几种重要的鲽科鱼类简介 | 第18-21页 |
1.1.1 星斑川鲽 | 第18-20页 |
1.1.2 石鲽 | 第20页 |
1.1.3 钝吻黄盖鲽 | 第20-21页 |
1.2 几种重要的DNA分子标记 | 第21-26页 |
1.2.1 限制性内切酶长度多态性(RFLP) | 第21-22页 |
1.2.2 随机扩增的多态性DNA(RAPD) | 第22页 |
1.2.3 扩增片段长度多态性(AFLP) | 第22-23页 |
1.2.4 微卫星(SSR) | 第23-26页 |
1.2.5 线粒体标记 | 第26页 |
1.3 鱼类杂交育种 | 第26-27页 |
1.4 本文的研究目的与意义 | 第27-30页 |
第二章 基于转录组测序的星斑川鲽微卫星分子标记的开发 | 第30-46页 |
2.1 材料 | 第30页 |
2.1.1 样品 | 第30页 |
2.1.2 试剂 | 第30页 |
2.1.3 主要仪器 | 第30页 |
2.2 实验方法 | 第30-33页 |
2.2.1 基因组DNA提取 | 第31页 |
2.2.2 星斑川鲽转录组SSR位点的鉴别和引物设计 | 第31-32页 |
2.2.3 SSR引物在日照星斑川鲽群体中的验证 | 第32-33页 |
2.2.4 微卫星引物多态性检测 | 第33页 |
2.3 实验结果与分析 | 第33-42页 |
2.3.1 星斑川鲽转录组中SSR位点分布 | 第33-35页 |
2.3.2 星斑川鲽转录组中SSR的分布特征 | 第35-36页 |
2.3.3 星斑川鲽转录组中SSR平均分布距离 | 第36页 |
2.3.4 星斑川鲽的微卫星特征 | 第36-42页 |
2.4 讨论 | 第42-44页 |
2.5 本章小结 | 第44-46页 |
第三章 星斑川鲽微卫星标记在江苏星斑川鲽群体、石鲽及杂交子代中的应用 | 第46-60页 |
3.1 材料 | 第46-47页 |
3.1.1 样品 | 第46页 |
3.1.2 试剂 | 第46-47页 |
3.2 实验方法 | 第47-48页 |
3.2.1 基因组DNA提取 | 第47页 |
3.2.2 微卫星引物 | 第47页 |
3.2.3 引物扩增及检测 | 第47-48页 |
3.2.4 毛细管电泳结果分析 | 第48页 |
3.3 实验结果 | 第48-54页 |
3.3.1 20对微卫星引物在江苏星斑川鲽群体中的扩增情况 | 第48页 |
3.3.2 20对微卫星引物在黄盖鲽群体中的扩增情况 | 第48页 |
3.3.3 20对微卫星引物在石鲽群体中的扩增情况 | 第48-49页 |
3.3.4 20对微卫星引物在杂交一代(P.stellatus♂×K.bicoloratus♂)中的扩增情况 | 第49页 |
3.3.5 18对微卫星引物在杂交一代(P stellatus♂×K.bicoloratus♂)左右眼个体的扩增情况 | 第49-54页 |
3.4 讨论 | 第54-58页 |
3.4.1 星斑川鲽不同群体与相近鲽科鱼类微卫星多样性的比较 | 第54-56页 |
3.4.2 星斑川鲽与石鲽的正反交 | 第56-57页 |
3.4.3 星斑川鲽、石鲽和杂交一代(P stellatus♀×K.bicoloratus♂)微卫星多样性的比较 | 第57-58页 |
3.4.4 根据18对微卫星区分杂交一代(P.stellatus♀×K.bicoloratus♂)中左右眼个体 | 第58页 |
3.5 本章小结 | 第58-60页 |
第四章 星斑川鲽、黄盖鲽和石鲽以及杂交子代中线粒体基因Cytb和COI片段序列的比较研究 | 第60-92页 |
4.1 材料 | 第60页 |
4.1.1 样品 | 第60页 |
4.1.2 试剂 | 第60页 |
4.2 实验方法 | 第60-63页 |
4.2.1 基因组DNA提取 | 第61页 |
4.2.2 线粒体基因COI和Cytb片段的扩增 | 第61-62页 |
4.2.3 序列分析 | 第62-63页 |
4.3 实验结果 | 第63-86页 |
4.3.1 线粒体Cytb基因扩增结果 | 第63页 |
4.3.2 线粒体Cytb基因扩增结果的横向比较分析 | 第63-70页 |
4.3.3 线粒体COI基因扩增结果的横向比较分析 | 第70-75页 |
4.3.4 线粒体Cytb基因扩增结果的比较分析 | 第75-81页 |
4.3.5 线粒体COI基因扩增结果的比较分析 | 第81-86页 |
4.4 讨论 | 第86-89页 |
4.4.1 基于线粒体基因COI和Cytb分析鱼类遗传多样性 | 第86-87页 |
4.4.2 对星斑川鲽等四个鲽科间遗传多样性的比较分析 | 第87-88页 |
4.4.3 对星斑川鲽、石鲽以及杂交子代间遗传多样性的比较分析 | 第88-89页 |
4.5 本章小结 | 第89-92页 |
附录 | 第92-94页 |
参考文献 | 第94-108页 |
致谢 | 第108-110页 |
攻读学位期间发表和撰写的学术论文目录 | 第110-111页 |
附件 | 第111页 |