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鱼源无乳链球菌转录组分析及其毒力相关基因筛选和sRNA预测

摘要第4-5页
Abstract第5-6页
1 前言第9-18页
    1.1 无乳链球菌国内外研究进展第9-12页
        1.1.1 无乳链球菌的特点第9页
        1.1.2 无乳链球菌致病性的研究进展第9-12页
    1.2 链球菌属sRNAs的研究第12-16页
        1.2.1 链球菌属中预测和鉴定sRNAs的方法第13页
        1.2.2 链球菌sRNAs的多样性第13页
        1.2.3 链球菌属调控网络中的sRNAs第13-16页
    1.3 本研究的目的及意义第16-18页
2 无乳链球菌ZQ0910转录组测序分析第18-35页
    2.1 实验材料第18页
        2.1.1 菌株第18页
        2.1.2 主要仪器第18页
        2.1.3 主要溶液和培养基第18页
    2.2 实验方法第18-25页
        2.2.1 无乳链球菌ZQ0910生长曲线的制作第18-19页
        2.2.2 菌株活化及培养第19页
        2.2.3 取菌送测第19页
        2.2.4 测序数据分析第19-20页
        2.2.5 比对统计第20页
        2.2.6 基因统计第20-22页
        2.2.7 基因注释及功能预测第22-23页
        2.2.8 sRNA预测第23-25页
    2.3 结果第25-33页
        2.3.1 无乳链球菌ZQ0910总RNA质量检测第25-26页
        2.3.2 无乳链球菌ZQ0910转录组测序结果第26-27页
        2.3.3 样品间差异分析结果第27-29页
        2.3.4 样品间差异基因注释及功能预测第29-33页
    2.4 讨论第33-35页
3 无乳链球菌ZQ0910毒力相关基因的克隆和验证第35-56页
    3.1 实验材料第35-36页
        3.1.1 菌株和质粒第35页
        3.1.2 主要试剂第35页
        3.1.3 主要仪器第35-36页
        3.1.4 主要溶液和培养基第36页
    3.2 实验方法第36-42页
        3.2.1 无乳链球菌ZQ0910的培养第36页
        3.2.2 无乳链球菌ZQ0910总RNA的提取第36-37页
        3.2.3 总RNA反转录成cDNA第37页
        3.2.4 毒力相关基因的克隆第37-41页
        3.2.5 毒力相关基因的验证第41-42页
    3.3 结果第42-54页
        3.3.1 cylA基因的克隆与分析第42-43页
        3.3.2 cylG基因的克隆与分析第43-44页
        3.3.3 cylI基因的克隆与分析第44-46页
        3.3.4 cylJ基因的克隆与分析第46-47页
        3.3.5 cylK基因的克隆与分析第47-48页
        3.3.6 sodA基因的克隆与分析第48-50页
        3.3.7 PI-2b基因的克隆与分析第50-52页
        3.3.8 荧光定量验证结果第52-54页
    3.4 讨论第54-56页
4 无乳链球菌ZQ0910 sRNA的验证第56-63页
    4.1 实验材料第56页
        4.1.1 菌株和质粒第56页
        4.1.2 候选sRNA序列第56页
        4.1.3 主要试剂第56页
        4.1.4 主要仪器第56页
        4.1.5 主要溶液和培养基第56页
    4.2 实验方法第56-57页
        4.2.1 无乳链球菌ZQ0910总RNA的提取第56页
        4.2.2 总RNA反转录成cDNA第56页
        4.2.3 sRNA的RT-PCR第56-57页
    4.3 结果第57-62页
        4.3.1 无乳链球菌ZQ0910总RNA的提取第57页
        4.3.2 无乳链球菌ZQ0910 cDNA模板合成第57-58页
        4.3.3 sRNA SAR-1、SAR-9、SAR-4、SAR-14、SAR-T克隆结果与分析第58-62页
    4.4 讨论第62-63页
5 结论第63-65页
参考文献第65-74页
致谢第74-75页
作者简介第75-76页
导师简介第76页

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