| 中文摘要 | 第3-5页 |
| 英文摘要 | 第5-7页 |
| 缩略词列表 | 第12-14页 |
| 1 绪论 | 第14-42页 |
| 1.1 问题的提出及研究意义 | 第14页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第14-40页 |
| 1.2.1 营养和光照对马铃薯的生长发育和试管薯形成的影响 | 第14-17页 |
| 1.2.2 动物TOR信号通路研究进展 | 第17-24页 |
| 1.2.3 植物TOR信号通路研究进展 | 第24-34页 |
| 1.2.4 生长素与植物根系再生 | 第34-40页 |
| 1.3 本文研究的目的和研究内容 | 第40-42页 |
| 1.3.1 本文研究的目的 | 第40页 |
| 1.3.2 本文研究的主要内容 | 第40-42页 |
| 2 实验材料及方法 | 第42-54页 |
| 2.1 实验材料及方法 | 第42-44页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第42页 |
| 2.1.2 菌种及质粒载体 | 第42页 |
| 2.1.3 酶及化学试剂 | 第42-43页 |
| 2.1.4 主要仪器设备 | 第43页 |
| 2.1.5 培养基 | 第43-44页 |
| 2.2 实验方法 | 第44-54页 |
| 2.2.1 Trizol法提取总RNA | 第44-45页 |
| 2.2.2 凝胶电泳DNA片段回收 | 第45页 |
| 2.2.3 质粒提取 | 第45-46页 |
| 2.2.4 大肠杆菌感受态的制备 | 第46页 |
| 2.2.5 大肠杆菌感受态的转化 | 第46页 |
| 2.2.6 农杆菌感受态的制备 | 第46-47页 |
| 2.2.7 农杆菌感受态的转化 | 第47页 |
| 2.2.8 农杆菌介导的拟南芥转化方法 | 第47页 |
| 2.2.9 拟南芥种子的无菌消毒 | 第47页 |
| 2.2.10 转基因拟南芥的筛选及鉴定 | 第47-48页 |
| 2.2.11 农杆菌介导的马铃薯转化方法 | 第48页 |
| 2.2.12 cDNA的合成 | 第48-49页 |
| 2.2.13 PCR扩增基因 | 第49-50页 |
| 2.2.14 Blunt-zero cloning vector连接反应 | 第50页 |
| 2.2.15 双酶切反应 | 第50页 |
| 2.2.16 P35S::8GWN连接反应 | 第50页 |
| 2.2.17 LR反应 | 第50-51页 |
| 2.2.18 叶片PCR反应 | 第51页 |
| 2.2.19 半定量及定量PCR反应 | 第51-52页 |
| 2.2.20 蛋白免疫印迹 | 第52-53页 |
| 2.2.21 拟南芥雷帕霉素敏感性实验 | 第53页 |
| 2.2.22 马铃薯TOR抑制剂敏感性实验 | 第53页 |
| 2.2.23 马铃薯诱导薯实验 | 第53-54页 |
| 3 马铃薯SCFKBP12过表达材料的构建及表型观察 | 第54-76页 |
| 3.1 马铃薯TOR复合体的生物信息学及表达模式分析 | 第54-57页 |
| 3.2 野生型马铃薯对雷帕霉素敏感性的分析 | 第57-59页 |
| 3.3 三种FKBP12转基因株系雷帕霉素敏感性的比较 | 第59-64页 |
| 3.3.1 HsFKBP12和AtFKBP12转基因材料的构建 | 第59-60页 |
| 3.3.2 BP12-2, HsFKBP12和AtFKBP12转基因材料雷帕霉素敏感性的比较 | 第60-64页 |
| 3.4 转基因马铃薯BP12-OE株系的获得及表型观察 | 第64-72页 |
| 3.4.1 ScFKBP12可以介导雷帕霉素对马铃薯StTOR的抑制作用 | 第65-66页 |
| 3.4.2 AsTORis能够抑制马铃薯的生长 | 第66-68页 |
| 3.4.3 雷帕霉素和asTORis共同作用协同地抑制马铃薯的生长 | 第68-72页 |
| 3.5 讨论 | 第72-76页 |
| 4 转录组学分析马铃薯中TOR的功能 | 第76-88页 |
| 4.1 转基因马铃薯BP12-OE17株系的转录组测序样品制备 | 第76页 |
| 4.2 转基因马铃薯BP12-OE17株系的转录组测序质量分析 | 第76-77页 |
| 4.3 差异表达基因分析 | 第77-84页 |
| 4.3.1 Go富集分析 | 第77-78页 |
| 4.3.2 KEGG pathway富集分析 | 第78-79页 |
| 4.3.3 TOR信号通路在马铃薯中的保守功能 | 第79-81页 |
| 4.3.4 TOR与光合作用 | 第81-84页 |
| 4.4 TOR与马铃薯微型薯形成 | 第84-85页 |
| 4.5 讨论 | 第85-88页 |
| 5 TOR与生长素调控马铃薯根系再生的研究 | 第88-114页 |
| 5.1 TOR信号通路与马铃薯根系再生 | 第88页 |
| 5.2 BP12-OE株系在根系再生中的表型观察 | 第88-89页 |
| 5.3 TOR对于拟南芥根系再生过程的调控 | 第89-91页 |
| 5.4 TOR信号通路能够影响生长素信号 | 第91-95页 |
| 5.5 TOR能够影响根系再生过程中生长素的合成，转运及信号转导 | 第95-97页 |
| 5.6 生长素信号转导突变体对于TOR二代抑制剂敏感 | 第97-101页 |
| 5.7 在BP12-2 中过表达拟南芥生长素受体ATTIR1能够增强BP12-2 对于TOR抑制剂的抗性 | 第101-107页 |
| 5.7.1 转基因TIR1/BP12-OE转基因材料的获得 | 第101-102页 |
| 5.7.2 转基因TIR1/BP12-OE株系的表型观察 | 第102-103页 |
| 5.7.3 TIR1能够增强BP12-2 在TOR抑制剂处理时的根系再生能力 | 第103-105页 |
| 5.7.4 TOR能够通过影响生长素受体蛋白稳定性影响生长素信号转导 | 第105-107页 |
| 5.8 在马铃薯中过表达ATTIR1能够增加马铃薯在抑制剂培养基中根系再生的能力 | 第107-110页 |
| 5.9 讨论 | 第110-114页 |
| 6 MICRORNA组学分析马铃薯中TOR对于MIRNA的调控 | 第114-120页 |
| 6.1 转基因马铃薯BP12-OE17株系测序样品的制备 | 第114页 |
| 6.2 测序质量分析 | 第114-115页 |
| 6.3 参考序列比对分析 | 第115-116页 |
| 6.4 MIRNA差异表达基因分析 | 第116-117页 |
| 6.5 MIRNA靶基因的预测及功能分析 | 第117-118页 |
| 6.6 讨论 | 第118-120页 |
| 7 结论与展望 | 第120-122页 |
| 7.1 主要结论 | 第120-121页 |
| 7.2 后续研究工作的展望 | 第121-122页 |
| 致谢 | 第122-124页 |
| 参考文献 | 第124-142页 |
| 附录 1 | 第142-144页 |
| A 作者在攻读博士学位期间发表的论文目录 | 第142页 |
| B 作者在攻读博士学位期间参加的科研项目及得奖情况 | 第142-144页 |
| 附录 2 | 第144-160页 |
| A BP12-OE17中雷帕霉素+KU处理组2899个基因的GO富集分析 | 第144-145页 |
| B 转录组数据中与激素信号通路相关的基因的差异变化列表 | 第145-147页 |
| C 转录组数据中与根系再生相关的基因差异变化列表 | 第147-153页 |
| D 转录组数据中与氮素代谢相关的基因差异变化列表 | 第153-154页 |
| E MICRORNA组学中差异变化MIRNA列表 | 第154-156页 |
| F 部分MIRNA所对应的差异表达的靶基因 | 第156-158页 |
| G 本研究中所使用的引物 | 第158-160页 |
