| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 引言 | 第10-11页 |
| 第一章 前言 | 第11-24页 |
| 1.1 海洋共附生菌 | 第11-15页 |
| 1.1.1 海洋共附生菌 | 第11-12页 |
| 1.1.2 海洋共附生菌来源活性物质 | 第12-14页 |
| 1.1.3 海洋共附生菌的应用价值 | 第14-15页 |
| 1.2 南极磷虾 | 第15-17页 |
| 1.2.1 南极磷虾介绍 | 第15-16页 |
| 1.2.2 南极磷虾潜在价值 | 第16-17页 |
| 1.2.3 南极磷虾共附生菌活性物质 | 第17页 |
| 1.3 微生物多样性研究 | 第17-20页 |
| 1.3.1 基于生物化学性质的经典方法 | 第18-19页 |
| 1.3.2 基于分子生物学方法 | 第19-20页 |
| 1.4 微生物分类学鉴定 | 第20-24页 |
| 1.4.1 经典分类学方法 | 第20-21页 |
| 1.4.2 化学分类 | 第21-22页 |
| 1.4.3 分子生物学鉴定方法 | 第22-24页 |
| 第二章 基于高通量测序分析的南极大磷虾共附生菌物种多样性研究 | 第24-38页 |
| 2.1 实验材料 | 第24页 |
| 2.2 仪器和设备 | 第24-25页 |
| 2.3 生物信息学分析 | 第25页 |
| 2.4 方法 | 第25-26页 |
| 2.4.1 高通量测序 | 第25页 |
| 2.4.2 数据处理 | 第25-26页 |
| 2.4.3 数据分析 | 第26页 |
| 2.5 结果与分析 | 第26-37页 |
| 2.5.1 样品质量控制 | 第26-27页 |
| 2.5.2 样品OTU分布统计 | 第27-30页 |
| 2.5.3 样品多样性指数 | 第30-32页 |
| 2.5.4 分类学分析 | 第32-37页 |
| 2.6 小结 | 第37-38页 |
| 第三章 南极大磷虾可培养共附生菌的分离及其物种多样性研究 | 第38-52页 |
| 3.1 实验材料 | 第38页 |
| 3.2 培养基 | 第38-39页 |
| 3.3 试剂 | 第39页 |
| 3.4 仪器和设备 | 第39-40页 |
| 3.5 方法 | 第40-42页 |
| 3.5.1 可培养菌株的分离 | 第40-41页 |
| 3.5.2 形态学观察 | 第41页 |
| 3.5.3 系统发育进化分析 | 第41-42页 |
| 3.6 结果与分析 | 第42-50页 |
| 3.6.1 可培养细菌的分离 | 第42页 |
| 3.6.2 菌株系统发育分析 | 第42-46页 |
| 3.6.3 可培养菌株的多样性分析 | 第46-50页 |
| 3.6.4 可能的微生物新种属 | 第50页 |
| 3.7 小结 | 第50-52页 |
| 第四章 南极大磷虾共附生菌来源微生物新种鉴定及其代谢产物分析 | 第52-76页 |
| 4.1 材料 | 第52页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第52页 |
| 4.1.2 分离材料、溶剂与试剂 | 第52页 |
| 4.1.3 培养基 | 第52页 |
| 4.2 仪器设备 | 第52-53页 |
| 4.3 试剂 | 第53-54页 |
| 4.4 方法 | 第54-58页 |
| 4.4.1 形态学观察 | 第54页 |
| 4.4.2 基本生理生化指标检测 | 第54-55页 |
| 4.4.3 全细胞脂肪酸组分检测 | 第55-56页 |
| 4.4.4 16S r RNA基因序列测定及比对分析 | 第56页 |
| 4.4.5 菌株发酵 | 第56页 |
| 4.4.6 微生物菌株天然产物提取和分离 | 第56-57页 |
| 4.4.7 LC-TOF MS代谢产物分析 | 第57-58页 |
| 4.5 结果分析 | 第58-75页 |
| 4.5.1 菌株的形态特征 | 第58-59页 |
| 4.5.2 菌株 16S r RNA基因序列分析 | 第59-64页 |
| 4.5.3 生理生化指标分析 | 第64页 |
| 4.5.4 菌株脂肪酸分析 | 第64-68页 |
| 4.5.5 菌株NJES-13 的代谢产物多样性分析 | 第68-75页 |
| 4.6 小结 | 第75-76页 |
| 第五章 总结和展望 | 第76-78页 |
| 5.1 结论总结 | 第76-77页 |
| 5.2 展望 | 第77-78页 |
| 参考文献 | 第78-84页 |
| 附录 | 第84-92页 |
| 附录一 高通量测序样品的OTU及其序列数信息 | 第84-89页 |
| 附录二 南极大磷虾共附生菌群高通量数据各类群分度统计 | 第89-92页 |
| 致谢 | 第92-93页 |
| 论文发表情况 | 第93页 |
