| 摘要 | 第2-4页 |
| Abstract | 第4-5页 |
| 缩略词表 | 第13-15页 |
| 1. 引言 | 第15-24页 |
| 1.1 赛马简述 | 第15-16页 |
| 1.2 蒙古马及其特点 | 第16-17页 |
| 1.3 蒙古马的耐力 | 第17页 |
| 1.4 蒙古马的现状 | 第17-18页 |
| 1.5 马运动学研究进展概述 | 第18-20页 |
| 1.6 马运动学转录组概述 | 第20-22页 |
| 1.7 miRNA测序进展即及马属动物应用概述 | 第22-24页 |
| 2．本研究的目的意义及技术路线 | 第24-26页 |
| 2.1 本研究的意义和目的 | 第24-25页 |
| 2.2 本研究的技术路线 | 第25-26页 |
| 3. 实验准备 | 第26-35页 |
| 3.1 实验材料 | 第26-28页 |
| 3.1.1 实验主要仪器设备 | 第26页 |
| 3.1.2 实验主要试剂耗材 | 第26-27页 |
| 3.1.3 实验主要数据库及分析软件 | 第27-28页 |
| 3.2 实验用马的训练及样品采集 | 第28-32页 |
| 3.2.1 实验用马的训练 | 第28-30页 |
| 3.2.2 样品采集 | 第30页 |
| 3.2.3 Tol RNA的提取与质量评估 | 第30-32页 |
| 3.3 蒙古马骨骼肌细胞体外培养 | 第32-35页 |
| 4. 实验方法 | 第35-43页 |
| 4.1 血液生理生化指标的检测 | 第35页 |
| 4.2 转录组高通量测序分析 | 第35-37页 |
| 4.2.1 文库制备与文库测序 | 第36-37页 |
| 4.2.2 原始数据的质量检测 | 第37页 |
| 4.3 miRNA测序分析 | 第37-41页 |
| 4.3.1 miRNA文库制备与测序 | 第37-38页 |
| 4.3.2 测序数据的质量控制 | 第38-39页 |
| 4.3.3 参考序列比对 | 第39-40页 |
| 4.3.4 miRNA分类注释与miRNA的预测 | 第40-41页 |
| 4.3.5 GO 功能富集和 KEGG Pathway 分析 | 第41页 |
| 4.4 mi RNA-m RNA整合关联分析 | 第41-42页 |
| 4.5 细胞转染实验 | 第42-43页 |
| 5. 实验结果与分析 | 第43-96页 |
| 5.1 血液生理生化指标的检测 | 第43-44页 |
| 5.2 转录组测序分析 | 第44-63页 |
| 5.2.1 原始序列数据质量控制 | 第44-46页 |
| 5.2.2 测序饱和度分析 | 第46-47页 |
| 5.2.3 去除核糖体RNA | 第47页 |
| 5.2.4 将clean data比对到参考基因组 | 第47-48页 |
| 5.2.5 基因覆盖度统计 | 第48页 |
| 5.2.6 相关性分析 | 第48-49页 |
| 5.2.7 表达模式聚类分析 | 第49-50页 |
| 5.2.8 成对差异基因结果统计 | 第50-53页 |
| 5.2.9 差异基因的Gene Ontology功能富集分析 | 第53-56页 |
| 5.2.10 差异基因KEGG Pathway | 第56-59页 |
| 5.2.11 蒙古马训练前后差异表达基因的实时荧光定量PCR验证 | 第59-63页 |
| 5.3 mi RNA测序分析 | 第63-83页 |
| 5.3.1 测序数据质量及长度分布 | 第63-64页 |
| 5.3.2 公共及特有序列 | 第64-65页 |
| 5.3.3 mi RNA基因组定位及分类注释 | 第65-72页 |
| 5.3.4 各样品中新mi RNA预测统计 | 第72-73页 |
| 5.3.5 已知差异表达的mi RNA | 第73-75页 |
| 5.3.6 miRNA靶基因预测及富集分析 | 第75-78页 |
| 5.3.6.1 miRNA靶基因预测 | 第75页 |
| 5.3.6.2 靶基因Gene Ontology富集分析 | 第75-76页 |
| 5.3.6.3 靶基因KEGG富集分析 | 第76-78页 |
| 5.3.7 差异表达mi RNA的q RT-PCR验证 | 第78-83页 |
| 5.4 miRNA-mRNA整合关联分析 | 第83-90页 |
| 5.4.1 差异表达miRNA与基因比较分析 | 第83-86页 |
| 5.4.2 靶基因GO富集分析 | 第86-87页 |
| 5.4.3 靶基因KEGG富集分析 | 第87-90页 |
| 5.5 运动学候选miRNA的载体构建及细胞转染 | 第90-96页 |
| 5.5.1 Pre-miR-1 载体的构建 | 第90-92页 |
| 5.5.2 载体的构建 | 第92页 |
| 5.5.3 载体双酶切鉴定 | 第92-93页 |
| 5.5.4 细胞转染 | 第93-94页 |
| 5.5.5 实时荧光定量PCR | 第94-96页 |
| 6. 讨论 | 第96-107页 |
| 6.1 训练方案的制定 | 第96-98页 |
| 6.2 血液生理生化指标的检测 | 第98-100页 |
| 6.3 转录组测序分析 | 第100-103页 |
| 6.4 miRNA测序分析 | 第103-105页 |
| 6.5 miRNA-mRNA整合关联分析 | 第105-107页 |
| 7. 全文研究的创新与展望 | 第107-108页 |
| 致谢 | 第108-109页 |
| 参考 文献 | 第109-121页 |
| 作者 简介 | 第121-123页 |
