蛋白质关系网络复合物发现与可视化研究
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 1 绪论 | 第9-16页 |
| ·研究背景 | 第9-10页 |
| ·研究现状 | 第10-13页 |
| ·蛋白质复合物发现算法研究现状 | 第10-12页 |
| ·蛋白质关系网络可视化研究现状 | 第12-13页 |
| ·存在的问题 | 第13-14页 |
| ·本文的工作 | 第14页 |
| ·本文的结构 | 第14-16页 |
| 2 相关知识与复合物发现评测指标 | 第16-24页 |
| ·蛋白质关系网络 | 第16-18页 |
| ·蛋白质复合物 | 第18-20页 |
| ·蛋白质功能标注 | 第20-21页 |
| ·复合物发现的评价 | 第21-24页 |
| 3 利用基因本体相似度的复合物发现算法 | 第24-39页 |
| ·预备知识 | 第24-26页 |
| ·基因本体标注与相似度计算 | 第24-25页 |
| ·重复随机游走算法RRW | 第25-26页 |
| ·算法思想 | 第26-29页 |
| ·基因本体语义相似度 | 第26-28页 |
| ·网络聚类 | 第28-29页 |
| ·结果与讨论 | 第29-38页 |
| ·参数选择 | 第31-32页 |
| ·对比实验结果 | 第32-35页 |
| ·一些预测结果示例 | 第35-38页 |
| ·本章小结 | 第38-39页 |
| 4 蛋白质关系网络可视化系统 | 第39-47页 |
| ·系统框架与实现 | 第39-41页 |
| ·蛋白质关系网络模型 | 第39-40页 |
| ·网络浏览器 | 第40-41页 |
| ·系统实现 | 第41页 |
| ·关键技术 | 第41-43页 |
| ·数据模型设计 | 第41-42页 |
| ·功能扩展 | 第42页 |
| ·CCFA聚类算法 | 第42-43页 |
| ·系统运行 | 第43-46页 |
| ·系统环境 | 第43页 |
| ·运行实例 | 第43-46页 |
| ·本章小结 | 第46-47页 |
| 结论 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-51页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第51-52页 |
| 致谢 | 第52-53页 |
