| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5页 |
| 第1章 绪论 | 第8-19页 |
| 1.1 课题背景及研究的目的和意义 | 第8-15页 |
| 1.1.1 课题背景 | 第8-12页 |
| 1.1.2 研究目的和意义 | 第12-15页 |
| 1.2 国内外研究现状分析 | 第15-17页 |
| 1.2.1 国内外研究现状 | 第15-16页 |
| 1.2.2 启动子相关识别软件 | 第16-17页 |
| 1.3 本文的主要研究内容 | 第17-19页 |
| 第2章 多细胞系基因表达研究 | 第19-30页 |
| 2.1 前言 | 第19页 |
| 2.2 数据获取及处理 | 第19-24页 |
| 2.3 多细胞系基因表达情况分析 | 第24-27页 |
| 2.4 基因表达水平与转录起始位点之间距离的关系 | 第27-29页 |
| 2.5 本章小结 | 第29-30页 |
| 第3章 基于新一代测序数据启动子类型识别 | 第30-39页 |
| 3.1 前言 | 第30页 |
| 3.2 数据获取及处理 | 第30-33页 |
| 3.3 多细胞系启动子类型识别 | 第33-38页 |
| 3.3.1 基于RNA聚合酶II测序数据的启动子类型识别 | 第33-34页 |
| 3.3.2 基于隐式马尔科夫模型的启动子类型识别 | 第34-38页 |
| 3.4 本章小结 | 第38-39页 |
| 第4章 机器学习方法在启动子识别研究中的应用 | 第39-49页 |
| 4.1 前言 | 第39-40页 |
| 4.2 数据获取及处理 | 第40-41页 |
| 4.3 组蛋白修饰特征 | 第41-43页 |
| 4.4 基于机器学习算法的启动子类型识别预测 | 第43-48页 |
| 4.4.1 支持向量机简述 | 第44页 |
| 4.4.2 随机森林简述 | 第44页 |
| 4.4.3 基于组蛋白修饰特征的启动子类型识别预测 | 第44-48页 |
| 4.5 本章小结 | 第48-49页 |
| 结论 | 第49-51页 |
| 参考文献 | 第51-57页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文 | 第57-59页 |
| 致谢 | 第59页 |