| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 1. 绪论 | 第15-44页 |
| 1.1. 引言 | 第15页 |
| 1.2. 生物膜、膜蛋白与疾病 | 第15-19页 |
| 1.2.1. 生物膜的结构、功能及特点 | 第15-17页 |
| 1.2.2. 膜蛋白的分类以及功能的多样性 | 第17-18页 |
| 1.2.3. 膜蛋白与疾病 | 第18-19页 |
| 1.3. 氨基酸及其在膜蛋白中的作用 | 第19-29页 |
| 1.3.1. 基本氨基酸的种类及性质 | 第19-20页 |
| 1.3.2. 碱性-芳香性氨基酸簇在外周蛋白中的作用 | 第20-22页 |
| 1.3.3. GPCR激活机制中的芳香性氨基酸微开关 | 第22-25页 |
| 1.3.4. 细菌视紫红质激活机制中芳香性氨基酸微开关存在的可能性 | 第25-29页 |
| 1.4. 生物固体核磁共振 | 第29-38页 |
| 1.4.1. 固体核磁共振简介 | 第29-30页 |
| 1.4.2. 基本实验方法 | 第30-34页 |
| 1.4.3. 生物固体核磁共振 | 第34-38页 |
| 1.5. 膜蛋白同位素标记策略 | 第38-41页 |
| 1.5.1. 定点标记 | 第39页 |
| 1.5.2. 选择性标记 | 第39-41页 |
| 1.5.3. 全标记 | 第41页 |
| 1.5.4. 氘代 | 第41页 |
| 1.6. 本论文的研究内容和目标 | 第41-44页 |
| 2. 芳香性氨基酸甲酯及肽模型化合物与脂膜相互作用机制研究 | 第44-65页 |
| 2.1. 引言 | 第44-47页 |
| 2.2. 材料与方法 | 第47-49页 |
| 2.2.1. 材料 | 第47-48页 |
| 2.2.2. 磷脂双分子层的制备 | 第48页 |
| 2.2.3. 固体核磁共振实验 | 第48-49页 |
| 2.3. 结果与讨论 | 第49-64页 |
| 2.3.1. 磷脂双分子层~1H谱的指认 | 第49-51页 |
| 2.3.2. 磷脂膜不同位置弛豫时间T_1、T_2及T_(1ρ)的测定 | 第51-56页 |
| 2.3.3. 磷脂双分子层动态构象的~(31)P固体核磁共振研究 | 第56-58页 |
| 2.3.4. Vamp2及Gravin中色氨酸参与膜融合的机制 | 第58-64页 |
| 2.4. 本章总结 | 第64-65页 |
| 3. 芳香性氨基酸Tyrosine185和Tyrosine57在细菌视紫红质光循环中的调控作用 | 第65-97页 |
| 3.1. 引言 | 第65-67页 |
| 3.2. 材料与方法 | 第67-73页 |
| 3.2.1. [10,11,14,15-~(13)C_4]-Ret合成与纯化 | 第68页 |
| 3.2.2. ~(13)C、~(15)N标记WT/MT-bR蛋白的表达与纯化 | 第68-69页 |
| 3.2.3. 动力学光谱检测 | 第69页 |
| 3.2.4. 分子动力学计算 | 第69-70页 |
| 3.2.5. 固体核磁共振工作实验 | 第70-72页 |
| 3.2.6. 距离和扭转角的拟合计算 | 第72-73页 |
| 3.3. 结果与讨论 | 第73-95页 |
| 3.3.1. 细菌视紫红质的重构 | 第73-74页 |
| 3.3.2. [10,11,14,15-~(13)C_4]-Ret化学位移指认 | 第74-75页 |
| 3.3.3. 暗适应下Ret顺反异构的变化 | 第75-79页 |
| 3.3.4. Tyr57/Tyr185化学位移指认 | 第79-83页 |
| 3.3.5. Tyr185与Ret的相互作用 | 第83-86页 |
| 3.3.6. Tyr185突变对配体键合区的影响 | 第86-89页 |
| 3.3.7. Tyr185突变对Asp85-Asp212-Arg82氢键网络的影响 | 第89-90页 |
| 3.3.8. Tyr185突变对bR光循环的影响 | 第90-92页 |
| 3.3.9. Tyr57突变对配体键合区的影响 | 第92页 |
| 3.3.10. Tyr57突变对bR光循环的影响 | 第92-95页 |
| 3.4. 本章总结 | 第95-97页 |
| 4. 碱性环境对细菌视紫红质稳定性和活性的调控 | 第97-112页 |
| 4.1. 引言 | 第97-98页 |
| 4.2. 材料与方法 | 第98-100页 |
| 4.2.1. 样品的准备 | 第98-99页 |
| 4.2.2. 动力学光谱检测 | 第99页 |
| 4.2.3. 固体核磁共振实验 | 第99-100页 |
| 4.2.4. 距离和扭转角的拟合计算 | 第100页 |
| 4.3. 结果与讨论 | 第100-111页 |
| 4.3.1. 碱性环境对视黄醛键合区的扰动 | 第101-109页 |
| 4.3.2. 碱性环境对蛋白整体结构的扰动 | 第109-111页 |
| 4.4. 本章小结 | 第111-112页 |
| 5. 总结与展望 | 第112-115页 |
| 参考文献 | 第115-128页 |
| 附录一 氨基酸甲酯和小分子肽的结构式 | 第128-129页 |
| 作者简历及在学期间所取得的科研成果 | 第129-132页 |
| 致谢 | 第132-133页 |
