| 中文摘要 | 第1-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 1 前言 | 第12-24页 |
| ·AIV的分类及命名 | 第12页 |
| ·禽流感分子生物学特征 | 第12-13页 |
| ·AIV粒子特征及其物理特性 | 第12-13页 |
| ·AIV的基因组结构 | 第13页 |
| ·编码蛋白的结构和功能 | 第13-19页 |
| ·聚合酶蛋白(Polymerise) | 第14-15页 |
| ·血凝素(Hemagglutinin, HA) | 第15-17页 |
| ·核蛋白(Nuo1eoprotein，NP) | 第17页 |
| ·神经氨酸酶(Nueraminidase, NA) | 第17-18页 |
| ·基质蛋白(Matrix proteins，M) | 第18-19页 |
| ·非结构蛋白(Nonstructural proteins, NS) | 第19页 |
| ·AIV的复制和传播 | 第19-20页 |
| ·病毒的复制 | 第19-20页 |
| ·病毒的传播 | 第20页 |
| ·AIV的遗传变异特性 | 第20-21页 |
| ·抗原漂移 | 第20-21页 |
| ·抗原转变 | 第21页 |
| ·H9N2亚型AIV的研究进展 | 第21-24页 |
| ·H9N2的流行情况 | 第21-22页 |
| ·H9N2的宿主范围、传播途径和方式 | 第22-23页 |
| ·H9N2感染人的研究进展 | 第23-24页 |
| 2 材料和方法 | 第24-32页 |
| ·材料 | 第24-26页 |
| ·毒株 | 第24页 |
| ·H9N2病料来源 | 第24页 |
| ·试验研究中HA基因序列毒株来源 | 第24页 |
| ·实验研究中H5N2毒株来源 | 第24页 |
| ·SPF鸡胚 | 第24页 |
| ·主要试剂 | 第24页 |
| ·分子生物学分析软件 | 第24页 |
| ·试验中所用溶液的配制 | 第24-25页 |
| ·实验所用主要仪器设备 | 第25-26页 |
| ·方法 | 第26-32页 |
| ·8株H9N2亚型AIV的分离鉴定、序列测定和全基因组序列分析 | 第26-30页 |
| ·病毒的分离与初步鉴定 | 第26-27页 |
| ·病毒的全基因组测序 | 第27-30页 |
| ·基因组拼接、全基因组的序列分析 | 第30页 |
| ·HA基因遗传演化及其变异频率探讨 | 第30-31页 |
| ·H9N2亚型AIV基因作为供体基因在新型H5N2重组病毒中的作用 | 第31-32页 |
| 3 结果与分析 | 第32-62页 |
| ·H9N2全基因序列分析 | 第32-50页 |
| ·病毒分离和鉴定 | 第32页 |
| ·分离毒株基因组PCR扩增结果 | 第32-33页 |
| ·HA基因序列分析 | 第33-36页 |
| ·HA基因同源性和遗传进化分析 | 第33-34页 |
| ·HA基因受体结合位点、抗原关键位点与蛋白裂解位点的分析 | 第34-35页 |
| ·HA基因潜在糖基化位点的分析 | 第35-36页 |
| ·NA基因序列分析 | 第36-38页 |
| ·NA基因同源率和遗传进化分析 | 第36页 |
| ·NA基因氨基酸序列分析 | 第36-38页 |
| ·PB2基因序列分析 | 第38-39页 |
| ·PB2基因同源率和遗传进化分析 | 第38页 |
| ·PB2基因的氨基酸序列分析 | 第38-39页 |
| ·PB1基因序列分析 | 第39页 |
| ·PB1基因同源率和遗传进化分析 | 第39页 |
| ·PB1基因的氨基酸序列分析 | 第39页 |
| ·PA基因序列分析 | 第39-40页 |
| ·PA基因同源率和遗传进化分析 | 第39页 |
| ·PA基因的氨基酸序列分析 | 第39-40页 |
| ·NP基因序列分析 | 第40页 |
| ·NP基因同源率和遗传进化分析 | 第40页 |
| ·NP基因的氨基酸序列分析 | 第40页 |
| ·M基因序列分析 | 第40-41页 |
| ·M基因同源率和遗传进化分析 | 第40-41页 |
| ·M基因的氨基酸序列分析 | 第41页 |
| ·NS基因序列分析 | 第41-49页 |
| ·NS基因同源率和遗传进化分析 | 第41页 |
| ·NS基因的氨基酸序列分析 | 第41-49页 |
| ·H9N2亚型禽流感毒株基因重排 | 第49-50页 |
| ·H9N2 HA基因变异规律分析 | 第50-56页 |
| ·本研究中所选H9N2病毒株的地理位置分布 | 第50-51页 |
| ·HA基因进化树的构建 | 第51-53页 |
| ·HA基因核苷酸的年平均进化率及变异率的研究 | 第53页 |
| ·HA 基因核苷酸进化率与年代的相关性 | 第53-54页 |
| ·HA基因氨基酸变异率的研究 | 第54-55页 |
| ·不同谱系H9N2毒株HA基因氨基酸位点比较 | 第55-56页 |
| ·H9N2基因作为供体基因在重组病毒H5N2中的作用 | 第56-62页 |
| 4 讨论 | 第62-67页 |
| ·H9N2全基因组序列分析 | 第62-64页 |
| ·HA基因遗传演化及其变异频率探讨 | 第64-65页 |
| ·H9N2亚型AIV基因作为供体基因在新型H5N2重组病毒中的作用 | 第65-67页 |
| 5 结论 | 第67-68页 |
| 参考文献 | 第68-74页 |
| 致谢 | 第74-75页 |
| 研究生期间发表论文 | 第75页 |
