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化脓隐秘杆菌基因组测序及pbp3基因的生物信息学分析

摘要第1-9页
Abstract第9-11页
前言第11-25页
 1 生物信息学研究进展第11-19页
   ·生物信息学的概况第11-12页
   ·生物信息学与基因组研究的关系第12-13页
   ·生物信息学的主要研究内容第13-16页
   ·生物信息学分析常用的软件第16-18页
   ·国内外生物信息学的研究现状和未来展望第18-19页
 2 化脓隐秘杆菌研究现状第19-23页
   ·化脓隐秘杆菌的分类地位第19-20页
   ·化脓隐秘杆菌毒力因子研究进展第20-21页
   ·化脓隐秘杆菌耐药性及耐药机制研究现状第21-23页
 3 本研究的目的及意义第23-25页
第一章 化脓隐秘杆菌ATCC19411基因组测序第25-45页
   ·材料第25-26页
     ·菌株第25页
     ·培养基和主要试剂第25页
     ·主要仪器第25-26页
   ·方法第26-30页
     ·基因组DNA的提取第26-27页
     ·基因组序列的测定与注释第27-30页
   ·结果与分析第30-41页
     ·化脓隐秘杆菌ATCC19411基因组DNA提取结果第30页
     ·化脓隐秘杆菌基因组的一般信息第30-32页
     ·化脓隐秘杆菌基因组基因注释第32-36页
     ·化脓隐秘杆菌基因组序列中耐药相关基因的筛查第36-41页
   ·讨论第41-43页
     ·测序方法的选择第41页
     ·化脓隐秘杆菌基因组一般信息分析第41-42页
     ·关于基因功能注释的分析第42-43页
     ·关于后续可进行的工作第43页
   ·小结第43-45页
第二章 pbp3基因的生物信息学分析第45-56页
   ·材料与方法第45-46页
     ·基因序列第45页
     ·PBP3理化性质及功能域预测第45页
     ·PBP3二级结构预测第45页
     ·PBP3三级结构预测及同源建模第45-46页
   ·结果与分析第46-54页
     ·pbp3基因序列及分析第46-47页
     ·PBP3氨基酸组成特性第47-48页
     ·PBP3结构域预测结果及分析第48-50页
     ·PBP3二级结构预测结果及分析第50-51页
     ·PBP3三级结构预测结果及分析第51-54页
   ·讨论第54-55页
   ·小结第55-56页
结论第56-57页
参考文献第57-62页
致谢第62-63页
攻读硕士学位期间发表文章第63页

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