| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 前言 | 第11-25页 |
| 1 生物信息学研究进展 | 第11-19页 |
| ·生物信息学的概况 | 第11-12页 |
| ·生物信息学与基因组研究的关系 | 第12-13页 |
| ·生物信息学的主要研究内容 | 第13-16页 |
| ·生物信息学分析常用的软件 | 第16-18页 |
| ·国内外生物信息学的研究现状和未来展望 | 第18-19页 |
| 2 化脓隐秘杆菌研究现状 | 第19-23页 |
| ·化脓隐秘杆菌的分类地位 | 第19-20页 |
| ·化脓隐秘杆菌毒力因子研究进展 | 第20-21页 |
| ·化脓隐秘杆菌耐药性及耐药机制研究现状 | 第21-23页 |
| 3 本研究的目的及意义 | 第23-25页 |
| 第一章 化脓隐秘杆菌ATCC19411基因组测序 | 第25-45页 |
| ·材料 | 第25-26页 |
| ·菌株 | 第25页 |
| ·培养基和主要试剂 | 第25页 |
| ·主要仪器 | 第25-26页 |
| ·方法 | 第26-30页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第26-27页 |
| ·基因组序列的测定与注释 | 第27-30页 |
| ·结果与分析 | 第30-41页 |
| ·化脓隐秘杆菌ATCC19411基因组DNA提取结果 | 第30页 |
| ·化脓隐秘杆菌基因组的一般信息 | 第30-32页 |
| ·化脓隐秘杆菌基因组基因注释 | 第32-36页 |
| ·化脓隐秘杆菌基因组序列中耐药相关基因的筛查 | 第36-41页 |
| ·讨论 | 第41-43页 |
| ·测序方法的选择 | 第41页 |
| ·化脓隐秘杆菌基因组一般信息分析 | 第41-42页 |
| ·关于基因功能注释的分析 | 第42-43页 |
| ·关于后续可进行的工作 | 第43页 |
| ·小结 | 第43-45页 |
| 第二章 pbp3基因的生物信息学分析 | 第45-56页 |
| ·材料与方法 | 第45-46页 |
| ·基因序列 | 第45页 |
| ·PBP3理化性质及功能域预测 | 第45页 |
| ·PBP3二级结构预测 | 第45页 |
| ·PBP3三级结构预测及同源建模 | 第45-46页 |
| ·结果与分析 | 第46-54页 |
| ·pbp3基因序列及分析 | 第46-47页 |
| ·PBP3氨基酸组成特性 | 第47-48页 |
| ·PBP3结构域预测结果及分析 | 第48-50页 |
| ·PBP3二级结构预测结果及分析 | 第50-51页 |
| ·PBP3三级结构预测结果及分析 | 第51-54页 |
| ·讨论 | 第54-55页 |
| ·小结 | 第55-56页 |
| 结论 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
| 攻读硕士学位期间发表文章 | 第63页 |