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狂犬病毒感染的神经细胞差异蛋白质组学研究及伴侣素CCTγ的功能分析

论文创新点第1-14页
摘要第14-16页
Abstract第16-19页
研究意义第19-20页
技术路线第20-21页
第一部分 文献综述第21-53页
 第一章 狂犬病毒及其致病机制研究进展第21-35页
  1. RV基因组结构及编码蛋白的功能第21-27页
   ·糖蛋白(G)第21-23页
   ·核蛋白(N)第23页
   ·磷蛋白(P)第23-25页
   ·基质蛋白(M)第25-26页
   ·RNA依赖性RNA聚合酶(L)第26-27页
  2. RV的复制、转录和蛋白表达策略第27-29页
  3. RV的致病机理第29-35页
   ·RV是否通过血液入侵中枢神经系统?第30-31页
   ·神经功能障碍第31-32页
   ·病毒通过引起细胞凋亡或坏死的方式引起细胞死亡第32-33页
   ·RV的免疫逃避策略第33页
   ·与神经元突起有关的新观点第33-35页
 第二章 蛋白质组学及其在病毒学研究中的应用第35-46页
  1 蛋白质组学第35-39页
   ·概念第35-36页
   ·蛋白组学分类第36-38页
   ·蛋白质组学研究的技术手段第38-39页
  2 比较蛋白质组学常用的分离和鉴定技术第39-42页
   ·二维凝胶电泳(2-DE)和二维差异凝胶电泳(2D-DIGE)第39-40页
   ·MS/MS第40页
   ·SILAC第40-41页
   ·LC-MS/MS第41页
   ·ICAT第41页
   ·蛋白质芯片第41-42页
  3 蛋白质组学在病毒学研究领域中的应用第42-46页
   ·病毒感染造成宿主细胞蛋白表达模式的变化第42-43页
   ·病毒药物治疗靶标的寻找第43-44页
   ·研究病毒粒子的蛋白组成第44页
   ·分析病毒基因表达调控及其与宿主蛋白的相互作用第44-46页
 第三章 真核细胞伴侣素的研究进展第46-53页
  1. 分子伴侣的定义及分类第46-47页
  2. 伴侣素家族(chaperonin,Cpn)第47页
  3. 伴侣素的结构与环状排列第47-48页
  4. 核苷酸与CCT的结合及蛋白折叠第48-49页
  5. 伴侣素在肌动蛋白和微管蛋白上的识别位点第49-50页
  6. 伴侣素与上游蛋白陪伴分子的协作第50-51页
  7. 蛋白错误折叠病与伴侣素第51-52页
  8. 伴侣素在病毒感染中的作用第52-53页
第二部分 研究内容第53-137页
 第一章 抗狂犬病毒单克隆抗体的制备及鉴定第53-73页
  摘要第53-54页
  1. 材料第54-55页
   ·主要仪器与器材第54页
   ·实验动物及细胞第54页
   ·毒株、载体和菌株第54页
   ·分子生物学试剂第54页
   ·试剂与药品第54-55页
   ·试剂配制第55页
  2. 方法第55-61页
   ·免疫抗原的制备第55-56页
   ·动物免疫第56-57页
   ·抗血清的分离第57页
   ·细胞融合第57页
   ·阳性细胞株的筛选第57-58页
   ·阳性杂交瘤细胞株的亚克隆第58页
   ·单抗腹水制备第58-59页
   ·单克隆抗体特性鉴定第59-60页
   ·真核表达载体pCI-neo-P的构建第60-61页
  3. 结果第61-69页
   ·单抗细胞的建株第61页
   ·抗N单抗与狂犬病毒ERA株感染Vero细胞的反应性第61-62页
   ·抗N及G单抗腹水ELISA效价及亚型鉴定第62-63页
   ·抗N单抗的免疫印迹实验第63页
   ·抗RV单抗对病毒的识别情况第63-65页
   ·抗RV单抗腹水IFA效价第65页
   ·亚型鉴定第65-66页
   ·19株抗RV单抗的Dot-blot反应性第66-67页
   ·Western-blot结果第67页
   ·中和抗体的鉴定结果第67页
   ·交叉反应情况第67-68页
   ·P基因片段的扩增第68-69页
   ·P基因真核表达载体的构建第69页
   ·P蛋白在成神经瘤细胞中的表达及单抗鉴定第69页
  4. 讨论第69-73页
   ·核蛋白的抗原性第69-70页
   ·糖蛋白的免疫效果第70页
   ·乳鼠脑组织悬液RV病毒抗原的免疫效果第70-72页
   ·抗体对Flury毒株的交叉反应情况第72-73页
 第二章 狂犬病毒感染的成神经瘤细胞差异蛋白质组学研究第73-114页
  摘要第73-74页
  1. 材料与方法第74-84页
   ·细胞与病毒第74-75页
   ·仪器和软件第75页
   ·试剂和药品第75页
   ·抗体第75页
   ·二维电泳样品制备第75-76页
   ·二维凝胶电泳第76-78页
   ·凝胶染色第78页
   ·图像扫描和PDQuest软件的使用第78-79页
   ·差异蛋白点的挖取第79页
   ·蛋白点的质谱鉴定和数据库检索第79-82页
   ·蛋白-蛋白相互作用网络的构建第82页
   ·实时荧光定量PCR验证第82-83页
   ·免疫印迹验证第83页
   ·病毒滴度测定第83-84页
  2、结果第84-108页
   ·样品的制备与验证第84-86页
   ·N2a细胞二维电泳方法的建立第86页
   ·狂犬病毒感染N2a细胞的2DE差异表达背景第86-87页
   ·RV感染N2a细胞的差异表达分析第87-90页
   ·差异蛋白的质谱鉴定第90-101页
   ·差异表达蛋白的分类第101-102页
   ·RV感染N2a细胞差异表达蛋白相互作用网络的构建第102-104页
   ·差异表达蛋白的转录本分析第104-105页
   ·差异表达蛋白的免疫印迹分析(WB)验证第105-108页
  3 讨论第108-113页
   ·RV感染对细胞能量代谢的影响第108-109页
   ·细胞骨架蛋白的变化第109-110页
   ·RNA的加工与生物合成第110-111页
   ·病毒感染与热休克蛋白、蛋白折叠相关蛋白的表达第111-112页
   ·免疫相关蛋白的表达第112-113页
  4 本章小结第113-114页
 第三章 宿主蛋白伴侣素TRiC/CCT在狂犬病毒感染细胞中的功能分析第114-137页
  摘要第114-115页
  1 材料和方法第115-119页
   ·质粒、抗体与试剂第115-116页
   ·病毒制备与细胞培养第116页
   ·抗N兔多抗血清的制备第116页
   ·狂犬病毒N、P蛋白真核表达载体的构建第116-117页
   ·真核表达载体转染第117页
   ·荧光双标染色及核染第117-118页
   ·慢病毒介导CCTγ和CCTα的RNA干扰第118页
   ·CCT基因的RNA干扰对RV复制的影响第118页
   ·实时荧光定量PCR第118-119页
  2 结果第119-134页
   ·伴侣素TRiC/CCT在感染细胞中的亚细胞分布变化第119-121页
   ·分子伴侣HSP90在感染细胞中的亚细胞分布第121-122页
   ·伴侣蛋白Prefoldin 1在RV感染细胞中的亚细胞分布变化第122-124页
   ·动力蛋白轻链DLC8在感染N2a细胞中的分布第124页
   ·宿主基因在RV感染细胞中的转录水平变化第124页
   ·TRiC/CCT和DLC8在pCI-N转染细胞中的亚细胞分布第124-126页
   ·TRiC/CCT和DLC8在pCI-P转染细胞中的亚细胞分布第126-127页
   ·N、P二质粒共转染对于NB样结构形成的必要性第127页
   ·TRiC/CCT在真核表达质粒共转染细胞中的亚细胞定位第127-128页
   ·DLC8和PFDN1在双质粒共转细胞中与内氏小体结构的共定位第128-129页
   ·宿主基因在质粒转染细胞中的转录水平变化第129页
   ·RNA干扰细胞系的建立第129-130页
   ·慢病毒介导的CCT_γ和CCTα干扰导致培养上清中病毒滴度的显著下降第130-132页
   ·细胞内病毒基因组拷贝数的降低第132页
   ·CCTγ和CCTα对病毒各结构蛋白转录和翻译的影响第132-134页
  3. 讨论第134-137页
总结与展望第137-139页
参考文献第139-154页
附录第154-163页
 附录A 缩写词索引第154-156页
 附录B 常用缓冲液及培养基配方第156-162页
 附录C 攻博期间发表或待发表的学术论文第162-163页
致谢第163页

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