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荧光假单胞杆菌水解酶PhlG及酵母细胞色素b5及其还原酶的结构功能研究

目录第1-8页
摘要第8-10页
ABSTRACT第10-12页
第1章 PhlG的晶体结构以及对其活性机理的探讨第12-40页
   ·研究背景第12-17页
     ·生物防治与荧光假单胞杆菌第12-14页
     ·生物防治活性的转录调控和翻译后调控第14-16页
     ·荧光假单胞杆菌参与DAPG代谢的蛋白及其功能第16页
     ·碳-碳键水解酶概述第16-17页
   ·材料与方法第17-22页
     ·基因克隆及质粒构建第17页
     ·PhlG的表达与纯化第17-18页
     ·PhlG晶体生长与优化及衍射数据收集第18-19页
     ·PhlG的结构解析、模型构建与结构修正第19-20页
     ·PhlG的金属元素含量的测定第20页
     ·PhlG与其底物DAPG的分子对接模拟第20-21页
     ·PhlG的活性中心的突变体的构建及活性测定第21-22页
     ·PhlG的底物进入通道的计算模拟第22页
   ·结果与讨论第22-35页
     ·PhlG结晶和数据收集第22-23页
     ·PhlG的结构解析和结构精修第23-24页
     ·PhlG的整体结构第24-28页
     ·活性位点,底物docking模拟和突变分析第28-30页
     ·推断的底物结合通道以及对于谷胱甘肽化引起的PhlG活性抑制的启示第30-31页
     ·PhlG定义了C-C切割水解酶的一个新的家族第31-32页
     ·底物特异性的结构生物学基础和PhlG的催化机理第32-34页
     ·底物进入的结构生物学暗示第34-35页
 小结第35-36页
 参考文献第36-40页
第2章 酵母的细胞色素b5及其还原酶的结构与功能研究第40-70页
   ·引言第40-44页
     ·细胞色素b5与细胞色素b5还原酶第41-43页
     ·细胞色素b5(Cyb5)与细胞色素b5还原酶(Cbr1)参与的细胞色素P450(Cyp450)循环第43-44页
     ·材料与方法第44-49页
     ·Cyb5与Cbrs基因的克隆第44页
     ·Cyb5及其还原酶的蛋白的表达与纯化第44-45页
     ·Cyb5与Cbr1的结晶第45-46页
     ·数据收集和处理第46页
     ·结构解析第46-47页
     ·Cyb5氧化还原状态的定性测定第47-48页
     ·Cbrs系列蛋白还原酶活性的定性测定第48页
     ·融合蛋白的构建、表达和纯化第48-49页
     ·Cbr1与Cyb5的分子对接模拟研究第49页
   ·结果与讨论第49-65页
     ·蛋白的纯化第49-50页
     ·蛋白的结晶和数据的收集第50-53页
     ·对Cyb5和Cbr1的酶活的检测第53-54页
     ·细胞色素b5还原酶Cbr1的整体结构第54-58页
     ·Cyb5的整体结构第58-60页
     ·Cyb5与Cbr1相互作用表面的研究第60-65页
 小结第65-67页
 参考文献第67-70页
第3章 酿酒酵母谷氨酰胺合成酶Gln1的结构与功能研究第70-96页
   ·引言第70-74页
     ·细菌谷氨酰胺合酶GSⅠ的结构第71-72页
     ·真核生物中的谷氨酰胺合酶GSⅡ第72-74页
     ·谷氨酰胺合酶与茶氨酸的合成第74页
   ·材料与方法第74-78页
     ·质粒的构建第74-75页
     ·蛋白的表达与纯化第75页
     ·晶体生长与优化,衍射数据收集及第75-76页
     ·结构解析、模型构建与结构修正第76-77页
     ·Glnl的酶活的测定第77-78页
   ·结果与讨论第78-91页
     ·蛋白的表达和纯化第78-80页
     ·Glnl的结晶第80-81页
     ·Glnl的数据收集及结构解析第81-83页
     ·Gln1AN18的总体结构第83-85页
     ·Gln1N18中新的作用界面以及多聚体的形成第85-86页
     ·对Glnl和Gln1AN18的活性的测定第86-91页
 小结第91-92页
 参考文献第92-96页
附录第96-102页
致谢第102-104页
在读期间发表的学术论文与取得的研究成果第104-105页

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