| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 1 文献综述 | 第10-21页 |
| ·猪基因组研究现状 | 第10-11页 |
| ·利用LongSAGE技术进行转录谱(Transcriptome)分析 | 第11-16页 |
| ·SAGE技术的发展 | 第11-12页 |
| ·SAGE技术的一般原理和实验过程 | 第12-13页 |
| ·SAGE的原理 | 第12页 |
| ·SAGE的一般实验过程 | 第12-13页 |
| ·转录谱的研究方法 | 第13-15页 |
| ·LongSAGE技术是研究转录谱与识别新基因的有效方法 | 第15-16页 |
| ·猪骨骼肌发生和发育的研究现状 | 第16-19页 |
| ·骨骼肌发生和发育的一般过程 | 第16页 |
| ·骨骼肌发生和发育的分子调控机制 | 第16-17页 |
| ·关于猪肌纤维的研究 | 第17-18页 |
| ·猪胚胎骨骼肌的研究现状 | 第18-19页 |
| ·猪33天和65天胚胎骨骼肌转录谱研究的必要性 | 第19页 |
| ·3个猪差异表达基因BIN1,TNNT2和TNNI2的研究现状 | 第19-21页 |
| ·BIN1(Bridging integrator 1)基因 | 第19-20页 |
| ·TNNT2(Troponin T2)基因和TNNI2(Troponin I2)基因 | 第20-21页 |
| 2 研究目的和意义 | 第21-22页 |
| ·目的 | 第21页 |
| ·意义 | 第21-22页 |
| 3 材料和方法 | 第22-33页 |
| ·材料 | 第22-24页 |
| ·构建LongSAGE标签库所需材料和试剂 | 第22页 |
| ·三个差异表达基因的研究材料 | 第22页 |
| ·组织样品 | 第22页 |
| ·DNA样品 | 第22页 |
| ·主要试剂及配制 | 第22-24页 |
| ·主要试剂 | 第22-23页 |
| ·主要试剂的配制 | 第23-24页 |
| ·菌株 | 第24页 |
| ·主要仪器及分子生物学软件 | 第24页 |
| ·方法 | 第24-33页 |
| ·胚胎骨骼肌样品的采集 | 第24页 |
| ·总RNA的提取及完整性检测 | 第24-25页 |
| ·RNA的反转录 | 第25页 |
| ·LongSAGE标签库的构建 | 第25-26页 |
| ·LongSAGE标签库的分析 | 第26-27页 |
| ·LongSAGE标签的鉴定 | 第26页 |
| ·T33和T65的转录谱分析 | 第26-27页 |
| ·T33和T65高表达标签的GO(Gene Ontology)分析 | 第27页 |
| ·差异表达标签的统计分析 | 第27页 |
| ·三个差异表达基因全长cDNA的分离 | 第27-29页 |
| ·组织样品RNA的制备和反转录 | 第27页 |
| ·引物设计 | 第27-28页 |
| ·PCR扩增条件 | 第28页 |
| ·PCR产物的纯化、克隆和测序 | 第28-29页 |
| ·三个差异表达基因的组织表达谱分析 | 第29-30页 |
| ·两个差异表达基因的RH物理定位法 | 第30-32页 |
| ·引物设计 | 第30页 |
| ·PCR扩增及其分型方法 | 第30-32页 |
| ·利用EST信息寻找SNP位点 | 第32-33页 |
| 4 结果 | 第33-48页 |
| ·T33和T65 LongSAGE标签库的整体情况 | 第33-34页 |
| ·T33和T65转录谱分析结果 | 第34-36页 |
| ·T33和T65高表达标签的GO分析结果 | 第36-37页 |
| ·在T33和T65中差异表达的标签统计分析结果 | 第37-38页 |
| ·三个差异表达基因全长cDNA的分离结果 | 第38-44页 |
| ·BIN1基因的cDNA序列分析 | 第39-41页 |
| ·TNNI2基因的cDNA序列分析 | 第41-43页 |
| ·TNNT2基因的cDNA序列分析 | 第43-44页 |
| ·三个差异表达基因组织表达谱分析结果 | 第44-45页 |
| ·BIN1和TNNT2基因的RH物理定位结果 | 第45页 |
| ·BIN1基因的SNP位点预测结果 | 第45-48页 |
| 5 讨论 | 第48-53页 |
| ·猪胚胎发育时期的选择 | 第48页 |
| ·通城猪胚胎骨骼肌33天和65天的转录谱特点 | 第48-49页 |
| ·关于利用LongSAGE方法研究猪胚胎骨骼肌转录谱 | 第49-51页 |
| ·SAGE／LongSAGE数据库分析方法的探讨 | 第51-52页 |
| ·关于高通量方法筛选差异表达基因进行功能研究的思考 | 第52-53页 |
| 6 小结 | 第53-55页 |
| ·本研究获得的主要结果 | 第53页 |
| ·本研究的创新点与特色 | 第53-54页 |
| ·本研究的不足之处 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-64页 |
| 附录 | 第64-71页 |
| 附录1 缩略词表(Abbreviations) | 第64-65页 |
| 附录2 附表1-3 | 第65-68页 |
| 附录3 附图1-4 | 第68-71页 |
| 致谢 | 第71-72页 |
