| 第一部分:人色氨酰-tRNA 合成酶催化活性片断的结构与功能的研究 | 第1-63页 |
| 引言 | 第9-17页 |
| 1. 氨酰-tRNA 合成酶 | 第9-10页 |
| 2. 氨酰-tRNA 合成酶及其复合物的结构 | 第10页 |
| 3. 第I类c 亚类aaRS | 第10页 |
| 4. 第I类c 亚类aaRS 的晶体结构 | 第10-12页 |
| ·细菌的 TyrRS | 第10-11页 |
| ·古细菌和真核生物的TyrRS | 第11页 |
| ·细菌的 TrpRS | 第11-12页 |
| 5. 第 I 类c 亚类aaRS 识别和结合tRNA 的方式 | 第12-14页 |
| 6. 高等动物第I 类c 亚类aaRS 进化获得的新功能 | 第14-17页 |
| 材料和方法 | 第17-29页 |
| 1. 材料和试剂 | 第17-18页 |
| ·常用试剂和材料 | 第17页 |
| ·菌株 | 第17页 |
| ·仪器 | 第17-18页 |
| 2. 方法 | 第18-29页 |
| ·hTrpRS-Hi56的表达和纯化 | 第18-19页 |
| ·溶液中蛋白质分子尺寸和聚集状态分析 | 第19页 |
| ·SDS-PAGE | 第19页 |
| ·蛋白质 N-端序列分析 | 第19页 |
| ·8834-CodonPlus(DE3)-RIL pET 24a(+)-hTrpRS 表达菌株的构建 | 第19-20页 |
| ·硒代甲硫氨酸(Selenomethionine)取代的hTrpRS-Hi56的表达和纯化 | 第20-21页 |
| ·蛋白质浓度测定方法 | 第21-22页 |
| ·晶体生长-悬滴气相扩散法 | 第22-24页 |
| ·X-射线晶体衍射和数据收集 | 第24-25页 |
| ·hTrpRS-Hi56的晶体结构测定 | 第25-29页 |
| 结果 | 第29-50页 |
| 1. T2-hTrpRS 整体结构 | 第29-33页 |
| 2. T2-hTrpRS 二聚体结构 | 第33-35页 |
| 3. 催化活性中心的结构 | 第35-41页 |
| 4. T2-hTrpRS 与bTrpRS 在结构域相对运动上的差别 | 第41-48页 |
| 5. hTrpRS 底物口袋开阔的入口 | 第48-50页 |
| 讨论 | 第50-57页 |
| 1. hTrpRS 识别 ATP 和色氨酸底物的方式 | 第50-51页 |
| 2. hTrpRS 识别和结合tRNATrp位点的预测 | 第51-55页 |
| 3. 抑制血管生成活性位点的预测 | 第55-57页 |
| 结论 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-63页 |
| 第二部分:人脑组织中丰富表达的Ras 同源类似物的结构与功能的研究 | 第63-99页 |
| 引言 | 第63-69页 |
| 1. 小 G 蛋白 | 第63页 |
| 2. 脑组织中丰富表达的 Ras 同源类似物(Rheb) | 第63-64页 |
| 3. 对 Rheb 在 MAPK 通路中作用的研究 | 第64-65页 |
| 4. 结节性硬化综合症(TSC)相关基因和蛋白 | 第65-66页 |
| 5. 雷帕霉素靶点蛋白(target of rapamycin, TOR) | 第66-67页 |
| 6. Rheb 在 TSC 蛋白和mTOR 之间传递信号调控细胞的生长 | 第67-69页 |
| 材料和方法 | 第69-77页 |
| 1. 材料和试剂 | 第69页 |
| ·常用试剂和材料 | 第69页 |
| ·仪器 | 第69页 |
| 2. 方法 | 第69-77页 |
| ·hRheb GTPase 结构域的表达与纯化 | 第69-71页 |
| ·hRheb 与鸟苷酸复合物的结晶 | 第71-72页 |
| ·X-射线衍射数据收集 | 第72-73页 |
| ·结构测定与精修 | 第73-77页 |
| 结果 | 第77-89页 |
| 1. hRheb 的整体结构 | 第77-82页 |
| 2. 磷酸基团结合loop 的结构 | 第82-86页 |
| 3. hRheb 有着与 Ras | 第86页 |
| 4. Switch II 独特的构象 | 第86-89页 |
| 讨论 | 第89-92页 |
| 1. Switch II 独特的构象导致 Rheb 非常低的内在 GTPase 活性 | 第89-90页 |
| 2. TSC2GAP 可能通过一种新的调节机制促进Rheb 水解 GTP | 第90-91页 |
| 3. Rheb 代表了 Ras | 第91-92页 |
| 结论 | 第92-93页 |
| 参考文献 | 第93-99页 |
| 发表文章目录 | 第99页 |
| 获奖 | 第99-100页 |
| 致谢 | 第100-101页 |
