| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-11页 |
| 1 引言 | 第11-17页 |
| ·毛色遗传研究现状 | 第11页 |
| ·Agouti 基因的研究 | 第11-14页 |
| ·Agouti 基因作用机理 | 第11-12页 |
| ·Agouti 基因研究现状 | 第12-13页 |
| ·本课题组对山羊Agouti 基因研究成果 | 第13-14页 |
| ·试验中所涉及的分子标记方法 | 第14-15页 |
| ·单核苷酸多态性 | 第14页 |
| ·单链构象多态性 | 第14页 |
| ·单倍型分析 | 第14-15页 |
| ·本研究的目的、意义及主要内容 | 第15-17页 |
| ·研究的目的、意义和主要内容 | 第15页 |
| ·山羊Agouti 基因内含子3 及3’UTR 序列测定及其结构分析 | 第15页 |
| ·山羊Agouti 基因内含子3 及3’UTR 的SNPs 位点的筛查与多态性分析 | 第15-17页 |
| 2 材料与方法 | 第17-33页 |
| ·试验材料 | 第17-21页 |
| ·试验山羊样品来源及采样方法 | 第17页 |
| ·主要仪器设备 | 第17-18页 |
| ·所用溶液试剂及其配制方法 | 第18-20页 |
| ·主要分子生物学软件 | 第20-21页 |
| ·主要试验方法和步骤 | 第21-30页 |
| ·山羊DNA 的提取 | 第21-22页 |
| ·山羊Agouti 基因含子3 部分序列和3’UTR 区PCR 扩增 | 第22-24页 |
| ·山羊RNA 提取 | 第24-26页 |
| ·山羊Agouti 基因3’RACE 实验 | 第26-28页 |
| ·聚丙烯酰胺凝胶电泳的步骤 | 第28-30页 |
| ·统计分析 | 第30-33页 |
| ·基因频率和基因型频率的计算 | 第30-31页 |
| ·遗传多态性分析 | 第31-33页 |
| 3 结果与分析 | 第33-51页 |
| ·基因组DNA 的提取结果 | 第33页 |
| ·Agouti 基因序列的获得与序列分析 | 第33-35页 |
| ·Agouti 基因内含子3 部分序列与外显子4 到3’UTR 的扩增结果 | 第33-34页 |
| ·Agouti 基因的测序结果 | 第34-35页 |
| ·Agouti 基因的测序结果分析 | 第35页 |
| ·山羊Agouti 基因内含子3 的多态位点分析 | 第35-48页 |
| ·内含子3 g.A4756C 测序结果的比对分析及群体遗传学分析 | 第35-38页 |
| ·Agouti 基因内含子3 g.C4971T 测序结果的比对分析及群体遗传学分析 | 第38-41页 |
| ·Agouti 基因内含子3 g.A5344G 测序结果的比对分析及群体遗传学分 | 第41-43页 |
| ·Agouti 基因内含子3 g.AGG5124-5125 位点测序结果及群体遗传学分析 | 第43-46页 |
| ·Agouti 基因内含子3 四个突变位点的综合群体分析 | 第46-48页 |
| ·RNA 的提取及反转录结果 | 第48-49页 |
| ·RACE 实验 | 第49-50页 |
| ·Outer PCR 结果 | 第49页 |
| ·Inner PCR 及切胶纯化结果 | 第49页 |
| ·测序比对结果 | 第49-50页 |
| ·山羊Agouti 基因3’UTR SSCP 分析 | 第50-51页 |
| 4 讨论 | 第51-58页 |
| ·DNA 的提取 | 第51页 |
| ·PCR 的扩增 | 第51-52页 |
| ·影响 SSCP 检测效果的因素 | 第52-53页 |
| ·PCR 扩增产物的长度 | 第52页 |
| ·SSCP 结果的分析 | 第52页 |
| ·电泳条件 | 第52-53页 |
| ·内含子3 突变位点SNPs 的确定及分析 | 第53-55页 |
| ·g.A4756C 位点的群体遗传学特征 | 第53页 |
| ·g.C4971T 位点的群体遗传学特征 | 第53-54页 |
| ·g.A5344G 位点的群体遗传学特征 | 第54页 |
| ·g.AGG5124-5125 插入突变位点的群体遗传学特征 | 第54-55页 |
| ·Agouti 基因内含子3 存在的四个位点的综合群体遗传学特征 | 第55-56页 |
| ·聚类图 | 第55页 |
| ·单倍型分析 | 第55页 |
| ·四个突变位点与山羊毛色表型的联系 | 第55-56页 |
| ·山羊Agouti 基因3’UTR 和内含子3 部分序列的获得 | 第56页 |
| ·RACE 试验与SSCP 分析 | 第56-58页 |
| 5 结论 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-64页 |
| 在读期间发表的论文 | 第64-65页 |
| 作者简历 | 第65-66页 |
| 致谢 | 第66-67页 |
