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西双版纳人工林—西南桦根内真菌多样性研究

摘要第1-6页
Abstract第6-11页
第一章 文献综述第11-15页
   ·研究背景第11-13页
     ·内生真菌概述第11页
     ·DSE概述第11-12页
     ·论文选题背景第12-13页
   ·研究目的及意义第13-14页
   ·研究内容及思路第14-15页
第二章 西双版纳人工林西南桦根内DSE定殖情况调查第15-22页
   ·材料和方法第15-16页
     ·样地概述第15页
     ·样品采集第15页
     ·样品处理第15页
     ·实验方法第15-16页
     ·统计分析第16页
   ·结果第16-20页
     ·西南桦人工林5个样地中DSE和AMF的概况第16-17页
     ·西南桦人工林不同林龄DSE和AMF定殖率的对比第17-20页
   ·讨论第20-22页
     ·西双版纳人工林西南桦根内DSE和AMF的各种结构第20页
     ·西双版纳人工林西南桦根内DSE与AMF的关系第20-22页
第三章 西双版纳人工林西南桦根内DSE菌株的分离及鉴定第22-40页
   ·前言第22页
   ·研究材料的采集第22页
   ·DSE菌株的分离纯化和培养第22-24页
     ·DSE菌株的分离第22-23页
     ·DSE菌株的纯化第23页
     ·DSE菌株的培养第23-24页
       ·常用培养基第23-24页
       ·促孢培养方法第24页
   ·DSE菌株形态学研究第24-25页
     ·DSE菌落形态学研究第24页
     ·DSE菌丝形态学研究第24-25页
   ·DSE菌株分子鉴定第25-30页
     ·CTAB法提取丛因组DNA第25-26页
     ·PCR扩增第26-27页
       ·引物合成第26页
       ·PCR反应体系及条件第26-27页
     ·PCR产物检测第27页
     ·PCR产物回收第27-28页
     ·DNA序列测定第28-30页
       ·测序PCR反应体系第28-29页
       ·测序PCR反应程序(bigdye程序)第29页
       ·测序纯化步骤第29页
       ·测序第29页
       ·序列分析第29-30页
       ·分子系统树的构建第30页
   ·结果第30-39页
     ·DSE的分离结果第30-31页
     ·菌株的形态学描述第31-35页
     ·菌株的分子鉴定结果第35-39页
   ·讨论第39-40页
第四章 三个不同生长阶段的西南桦根内真菌分子多样性研究第40-69页
   ·前言第40页
   ·材料和方法第40-50页
     ·样本采集第40-41页
     ·根内真菌DNA的提取第41-42页
     ·真菌的ITS rDNA基因片段的PCR扩增第42-44页
       ·Nested PCR引物第42页
       ·第一次PCR第42-43页
       ·第二次PCR第43-44页
     ·PCR产物回收第44-45页
     ·扩增产物的连接转化及克隆第45-47页
       ·目的片段与pMD18-T载体的连接第45页
       ·连接产物的转化第45-46页
       ·Amp+/X-gal/IPTG抗性LB培养基对阳性克隆子的初步筛选第46页
       ·阳性克隆的鉴定第46-47页
     ·克隆测序第47-49页
       ·阳性克隆的菌落PCR反应及纯化第47页
       ·测序PCR反应及纯化第47-49页
     ·系统发育分析第49-50页
       ·构建操作分类单元第49页
       ·分析嵌合序列第49页
       ·分析不同样地间的丰富度第49页
       ·分子系统树的构建第49-50页
   ·结果第50-66页
     ·西南桦根样中总DNA的提取、PCR扩增和扩增产物纯化结果第50-51页
     ·西南桦内生真菌ITS rDNA文库构建及阳性克隆筛选第51页
     ·西南桦3个样地的内生真菌ITS rDNA序列分析第51-53页
     ·构建西南桦不同生长阶段的稀疏曲线第53-54页
     ·内生真菌不同群落组成和结构的比较第54页
     ·内生真菌不同群落样本的Blast结果第54-55页
     ·根内生真菌的分子多样性第55-66页
   ·讨论第66-69页
     ·以真菌ITS为分子标记的选择第66页
     ·Nested PCR的选择第66页
     ·西南桦根内真菌分子多样性第66-67页
     ·三个不同生长阶段的西南桦根内真菌分子多样性比较第67-69页
附录第69-80页
 附录1 不同群落OTU组成的比较第69-74页
 附录2 不同样本的ITS文库及Blast结果第74-78页
 附录3 论文中使用的缩写及中英文对照第78-79页
 附录4 论文中使用的试剂、缓冲液和培养基的配制第79-80页
参考文献第80-90页
致谢第90页

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