| 摘要 | 第6-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 缩略语表 | 第12-13页 |
| 1 前言 | 第13-33页 |
| 1.1 芽胞杆菌及其杀线虫特征 | 第13-25页 |
| 1.1.1 芽胞杆菌的简介 | 第13页 |
| 1.1.2 杀线虫芽胞杆菌的种类 | 第13-14页 |
| 1.1.3 芽胞杆菌的杀线虫毒力因子 | 第14-16页 |
| 1.1.4 杀线虫晶体蛋白的的穿孔机制 | 第16-23页 |
| 1.1.5 特洛伊木马机制 | 第23-24页 |
| 1.1.6 巴斯德芽菌的特异寄生机制 | 第24-25页 |
| 1.2 杀线虫芽胞杆菌基因组学研究 | 第25-28页 |
| 1.3 芽胞杆菌杀线虫次级代谢产物的研究 | 第28-31页 |
| 1.3.1 芽胞杆菌中的抗生素 | 第28-30页 |
| 1.3.2 芽胞杆菌杀线虫次级代谢产物研究 | 第30-31页 |
| 1.4 芽胞杆菌与线虫的相互作用研究 | 第31-32页 |
| 1.5 研究目的和意义 | 第32-33页 |
| 2 材料和方法 | 第33-38页 |
| 2.1 材料 | 第33-35页 |
| 2.1.1 菌株 | 第33页 |
| 2.1.2 线虫 | 第33页 |
| 2.1.3 培养基 | 第33页 |
| 2.1.4 试剂 | 第33-34页 |
| 2.1.5 仪器 | 第34-35页 |
| 2.2 方法 | 第35-38页 |
| 2.2.1 秀丽小杆线虫的培养 | 第35页 |
| 2.2.2 生物测定 | 第35-36页 |
| 2.2.3 芽胞杆菌菌株总DNA提取 | 第36页 |
| 2.2.4 全基因组测序和注释 | 第36页 |
| 2.2.5 系统发育树构建 | 第36-37页 |
| 2.2.6 杀线虫毒力因子的预测 | 第37页 |
| 2.2.7 代谢组制备 | 第37-38页 |
| 2.2.8 代谢组检测与鉴定 | 第38页 |
| 3 结果与分析 | 第38-78页 |
| 3.1 跨两个科的120个芽胞杆菌显示多样化的杀线虫能力 | 第38-47页 |
| 3.1.1 120个芽胞杆菌的选择、鉴定及杀线虫活性测定 | 第38-43页 |
| 3.1.2 120个芽胞杆菌呈现多样化的杀线虫活性 | 第43-47页 |
| 3.2 120个杀线虫芽胞杆菌的基因组特征 | 第47-54页 |
| 3.3 120个芽胞杆菌含有五类杀线虫毒力因子 | 第54-59页 |
| 3.4 芽胞杆菌至少含有四种杀线虫机制 | 第59-62页 |
| 3.5 芽胞杆菌含有丰富的其他潜在杀线虫毒力因子 | 第62-66页 |
| 3.6 生物源杀线虫次级代谢产物数据库的建立 | 第66-68页 |
| 3.7 芽胞杆菌产生的杀线虫非肽类次级代谢产物 | 第68-74页 |
| 3.8 芽胞杆菌次级代谢产物合成基因簇的预测 | 第74页 |
| 3.9 芽胞杆菌产生大量的具有潜在杀线虫活性的二肽和三肽化合物 | 第74-78页 |
| 4 讨论 | 第78-82页 |
| 4.1 芽胞杆菌是一个很好的杀线虫资源库和研究细菌对线虫致病性模型 | 第79页 |
| 4.2 多样的杀线虫毒力因子有助于芽胞杆菌适应线虫 | 第79页 |
| 4.3 不同芽胞杆菌之间存在趋同进化 | 第79-81页 |
| 4.4 芽胞杆菌丰富的次级代谢产物参与其杀线虫过程 | 第81页 |
| 4.5 丰富的杀线虫芽胞杆菌基因组和代谢组资源有助于分析不同菌株之间存在的杀线虫表型差异性关联分析 | 第81-82页 |
| 5 总结与创新点 | 第82-85页 |
| 参考文献 | 第85-104页 |
| 附录 | 第104-151页 |
| 已发表和待发表论文 | 第151-152页 |
| 致谢 | 第152-153页 |
