| 摘要 | 第6-7页 |
| abstract | 第7页 |
| Chapter 1 Introduction | 第12-21页 |
| 1.1 Japanese encephalitis virus | 第12页 |
| 1.2 Significance and epidemiology-around the word | 第12-14页 |
| 1.3 Replication cycle of JEV | 第14-16页 |
| 1.4 Insights into pathogenesis of Japanese encephalitis | 第16-18页 |
| 1.5 Antiviral response of host’s innate immune system | 第18-19页 |
| 1.6 Invasion of native antiviral response of host | 第19-20页 |
| 1.7 Objective | 第20-21页 |
| Chapter 2 Proteomics Analysis of Mouse Brain Infected with JEV | 第21-43页 |
| 2.1 Introduction | 第21-24页 |
| 2.2 Materials and methods | 第24-31页 |
| 2.2.1 Ethical statement | 第24页 |
| 2.2.2 Animal model | 第24页 |
| 2.2.3 Inoculation of virus | 第24页 |
| 2.2.4 Collection of samples | 第24-25页 |
| 2.2.5 Cell culture | 第25页 |
| 2.2.6 Tissue culture infective dose | 第25-26页 |
| 2.2.7 iTRAQ-based proteomics analysis | 第26-27页 |
| 2.2.7.1 Protein extraction | 第26页 |
| 2.2.7.2 Protein digestion and iTRAQ labeling | 第26页 |
| 2.2.7.3 Peptide fractionation with strong cation exchange(SCX)chromatography | 第26-27页 |
| 2.2.7.4 Liquid chromatography(LC) –electrospray ionization(ESI)tandem MS(MS/MS)analysis by Q exactive | 第27页 |
| 2.2.7.5 Sequence database searching and data analysis | 第27页 |
| 2.2.8 Western blot | 第27-29页 |
| 2.2.9 Bioinformatics | 第29-30页 |
| 2.2.10 Primary neurons isolation | 第30页 |
| 2.2.11 Primary fibroblast isolation | 第30-31页 |
| 2.2.12 Typical RNAiMAX transfection procedure | 第31页 |
| 2.3 Results | 第31-39页 |
| 2.3.1 Mouse model;Infection,survival assay and harvest sheet for JEV infected mice | 第31-32页 |
| 2.3.2 Tissue culture infective dose | 第32页 |
| 2.3.3 Proteomic expression patterns in mouse brain after JEV infection | 第32-33页 |
| 2.3.4 Additional evidence validating the Mass Spectrometry data | 第33页 |
| 2.3.5 Up-regulation of ISG15 and B2M | 第33-34页 |
| 2.3.6 Down-regulation of AATK | 第34-35页 |
| 2.3.7 Gene ontology(GO)enrichment analysis of the DEPs by p value | 第35-36页 |
| 2.3.8 KEGG pathway enrichment analysis of differentially regulated proteins | 第36-38页 |
| 2.3.9 JEV infection upregulates expression of TREX | 第38-39页 |
| 2.3.10 Knock-down of TREX1 gene expression inhibits JEV infections | 第39页 |
| 2.4 Discussion | 第39-43页 |
| Chapter 3 Conclusions | 第43-44页 |
| References | 第44-50页 |
| Acknowledgements | 第50-51页 |
| Curriculum vitae | 第51页 |
