| 摘要 | 第5-6页 |
| abstract | 第6-7页 |
| 英文缩略表 | 第16-17页 |
| 第一章 引言 | 第17-26页 |
| 1.1 果实硬度变化研究进展 | 第18-21页 |
| 1.1.1 果肉细胞壁结构组分变化 | 第18-19页 |
| 1.1.2 与果实硬度变化相关的关键酶研究 | 第19-20页 |
| 1.1.3 西瓜果肉硬度的研究 | 第20-21页 |
| 1.2 果实有机酸研究进展 | 第21页 |
| 1.2.1 西瓜果实有机酸研究 | 第21页 |
| 1.3 近等基因系的构建及应用 | 第21-22页 |
| 1.3.1 近等基因系的构建 | 第21-22页 |
| 1.3.2 近等基因系的应用 | 第22页 |
| 1.4 西瓜果实转录组研究进展 | 第22-23页 |
| 1.5 西瓜果实性状基因定位研究 | 第23-24页 |
| 1.6 本研究的目的和意义 | 第24-26页 |
| 第二章 西瓜果肉硬度和酸味性状近等基因系构建 | 第26-35页 |
| 2.1 材料和方法 | 第26-28页 |
| 2.1.1 试验材料 | 第26-27页 |
| 2.1.2 西瓜果肉硬度测定 | 第27页 |
| 2.1.3 西瓜中心果肉pH测定 | 第27页 |
| 2.1.4 西瓜有机酸含量测定 | 第27页 |
| 2.1.5 西瓜基因组DNA提取 | 第27页 |
| 2.1.6 SSR标记分析 | 第27-28页 |
| 2.1.7 数据统计与分析 | 第28页 |
| 2.2 结果与分析 | 第28-34页 |
| 2.2.1 亲本多态性引物的筛选 | 第28页 |
| 2.2.2 BC7F1世代西瓜硬果肉株系基因型比较分析 | 第28-29页 |
| 2.2.3 BC7F1世代西瓜果实酸味株系基因型比较分析 | 第29页 |
| 2.2.4 BC7F1硬果肉西瓜单株1-6基因型分析 | 第29-30页 |
| 2.2.5 BC7F1酸果肉西瓜单株3-10基因型分析 | 第30-31页 |
| 2.2.6 西瓜果肉硬度性状近等基因系构建 | 第31-33页 |
| 2.2.7 西瓜果实酸味性状近等基因系构建 | 第33-34页 |
| 2.3 讨论 | 第34-35页 |
| 第三章 西瓜果肉硬度比较转录组分析 | 第35-53页 |
| 3.1 材料和方法 | 第35-41页 |
| 3.1.1 材料 | 第35页 |
| 3.1.2 西瓜果肉硬度测定 | 第35页 |
| 3.1.3 西瓜果肉中细胞壁物质含量的测定 | 第35-36页 |
| 3.1.4 总RNA的提取与质量检测 | 第36-37页 |
| 3.1.5 cDNA文库构建、质控及测序 | 第37-38页 |
| 3.1.6 测序质量控制和转录组数据与参考基因组序列比对 | 第38页 |
| 3.1.7 基因表达水平定量和差异表达基因(DEGs)筛选 | 第38页 |
| 3.1.8 GO和KEGG通路富集分析 | 第38页 |
| 3.1.9 总RNA反转录 | 第38-39页 |
| 3.1.10 RT-PCR反应 | 第39-40页 |
| 3.1.11 实时荧光定量(qRT-PCR)分析 | 第40-41页 |
| 3.1.12 数据分析 | 第41页 |
| 3.2 结果与分析 | 第41-49页 |
| 3.2.1 西瓜果实发育过程中细胞壁物质含量的变化 | 第41-42页 |
| 3.2.2 RNA-Seq数据的综合评价 | 第42-43页 |
| 3.2.3 差异表达基因的鉴定 | 第43-45页 |
| 3.2.4 差异表达基因的GO和KEGG功能富集分析 | 第45-48页 |
| 3.2.5 西瓜果实细胞壁物质成分相关基因的表达分析 | 第48页 |
| 3.2.6 qRT-PCR验证转录组数据的准确性 | 第48-49页 |
| 3.3 讨论 | 第49-53页 |
| 3.3.1 细胞壁物质成分含量对西瓜果肉硬度的影响 | 第49-51页 |
| 3.3.2 西瓜果实细胞壁物质合成相关基因的研究 | 第51-53页 |
| 第四章 西瓜果肉硬度主效基因的定位研究 | 第53-65页 |
| 4.1 材料和方法 | 第53-55页 |
| 4.1.1 材料及群体构建 | 第53页 |
| 4.1.2 西瓜果肉硬度测定 | 第53页 |
| 4.1.3 西瓜基因组DNA提取 | 第53页 |
| 4.1.4 西瓜果肉硬度DNA软肉、硬肉池的构建 | 第53-54页 |
| 4.1.5 BSA-Seq数据分析 | 第54页 |
| 4.1.6 分子标记的开发 | 第54页 |
| 4.1.7 PCR扩增、酶切及电泳 | 第54-55页 |
| 4.1.8 数据统计与分析 | 第55页 |
| 4.2 结果与分析 | 第55-61页 |
| 4.2.1 BC7F1世代多态性引物的筛选 | 第55-56页 |
| 4.2.2 BC7F2分离群体的西瓜果肉硬度数据调查分析 | 第56-57页 |
| 4.2.3 SSR标记GNS124与果肉硬度性状的连锁分析 | 第57页 |
| 4.2.4 西瓜果肉硬度基因的定位 | 第57-58页 |
| 4.2.5 候选基因预测与分析 | 第58-61页 |
| 4.2.6 与果肉硬度连锁的Caps3标记在自然群体中的验证 | 第61页 |
| 4.3 讨论 | 第61-65页 |
| 4.3.1 西瓜果肉硬度性状的定位研究 | 第61-62页 |
| 4.3.2 木葡聚糖内糖基转移酶在植物发育和果实成熟过程中的作用 | 第62-63页 |
| 4.3.3 乙烯响应元件(ERF)在果实成熟过程中的调控作用 | 第63-65页 |
| 第五章 西瓜果肉可溶性糖和有机酸的比较转录组分析 | 第65-82页 |
| 5.1 材料与方法 | 第65-68页 |
| 5.1.1 材料 | 第65页 |
| 5.1.2 西瓜中心可溶性固形物含量和pH测定 | 第65页 |
| 5.1.3 西瓜可溶性糖含量测定 | 第65-66页 |
| 5.1.4 西瓜有机酸含量测定 | 第66页 |
| 5.1.5 总RNA提取与质量检测 | 第66页 |
| 5.1.6 cDNA文库构建和测序 | 第66页 |
| 5.1.7 测序数据过滤和比对分析 | 第66-67页 |
| 5.1.8 基因表达定量和差异基因筛选 | 第67页 |
| 5.1.9 GO和KEGG通路富集分析 | 第67页 |
| 5.1.10 总RNA反转录 | 第67页 |
| 5.1.11 RT-PCR反应 | 第67-68页 |
| 5.1.12 实时荧光定量(qRT-PCR)分析 | 第68页 |
| 5.1.13 数据分析 | 第68页 |
| 5.2 结果与分析 | 第68-78页 |
| 5.2.1 西瓜果实发育过程中可溶性糖和有机酸含量的动态变化 | 第68-70页 |
| 5.2.2 RNA-Seq数据的综合评价 | 第70-71页 |
| 5.2.3 差异表达基因的鉴定 | 第71-73页 |
| 5.2.4 差异表达基因的GO和KEGG功能富集分析 | 第73-76页 |
| 5.2.5 西瓜果实可溶性糖和有机酸积累与代谢相关基因的表达分析 | 第76-78页 |
| 5.2.6 qRT-PCR验证转录组数据的准确性 | 第78页 |
| 5.3 讨论 | 第78-82页 |
| 5.3.1 比较转录组分析试验材料的创新 | 第78页 |
| 5.3.2 西瓜果实发育和成熟过程中可溶性糖和有机酸含量的动态变化 | 第78-80页 |
| 5.3.3 可溶性糖合成和代谢相关基因的分析 | 第80页 |
| 5.3.4 有机酸积累和代谢相关基因的分析 | 第80-82页 |
| 第六章 西瓜果实酸味性状主效基因的定位研究 | 第82-92页 |
| 6.1 材料与方法 | 第82-83页 |
| 6.1.1 材料及群体构建 | 第82页 |
| 6.1.2 西瓜中心果肉pH测定 | 第82页 |
| 6.1.3 西瓜基因组DNA提取 | 第82页 |
| 6.1.4 西瓜果实酸味低pH池和高pH池的构建 | 第82页 |
| 6.1.5 BSA-Seq数据分析 | 第82-83页 |
| 6.1.6 分子标记的开发 | 第83页 |
| 6.1.7 PCR扩增、酶切及电泳 | 第83页 |
| 6.1.8 数据统计与分析 | 第83页 |
| 6.2 结果与分析 | 第83-90页 |
| 6.2.1 BC7F1世代多态性引物的筛选 | 第83-84页 |
| 6.2.2 BC7F2世代西瓜果实pH调查分析 | 第84-85页 |
| 6.2.3 SSR标记与西瓜果实酸味性状的连锁分析 | 第85页 |
| 6.2.4 西瓜果实酸味基因的定位 | 第85-87页 |
| 6.2.5 候选基因预测与分析 | 第87-88页 |
| 6.2.6 与果实酸味连锁的Caps116标记在自然群体中的验证 | 第88-90页 |
| 6.3 讨论 | 第90-92页 |
| 6.3.1 西瓜果实酸味基因的定位研究 | 第90页 |
| 6.3.2 Cla009218和Cla009226在果实发育和成熟过程中的作用 | 第90-92页 |
| 第七章 全文结论 | 第92-95页 |
| 7.1 全文结论 | 第92-93页 |
| 7.1.1 创制西瓜果肉硬度和酸味性状的近等基因系 | 第92页 |
| 7.1.2 西瓜果肉硬度比较转录组分析 | 第92页 |
| 7.1.3 西瓜果肉硬度性状主效基因的精细定位 | 第92页 |
| 7.1.4 西瓜果肉可溶性糖和有机酸的比较转录组分析 | 第92-93页 |
| 7.1.5 西瓜果肉酸味性状主效基因的精细定位 | 第93页 |
| 7.2 全文创新点 | 第93页 |
| 7.3 存在问题及展望 | 第93-95页 |
| 参考文献 | 第95-108页 |
| 附录 | 第108-117页 |
| 致谢 | 第117-118页 |
| 作者简历 | 第118页 |
