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连作土壤中黄瓜枯萎病菌的致病力变化规律及强、弱致病力菌株的转录组分析

摘要第5-6页
abstract第6-7页
英文缩略表第14-15页
第一章 引言第15-25页
    1.1 黄瓜枯萎病概况第15-17页
        1.1.1 黄瓜枯萎病的发生与危害第15页
        1.1.2 病原和侵染循环第15-16页
        1.1.3 黄瓜枯萎病的防治第16-17页
    1.2 连作条件下枯萎病加重的原因第17-18页
        1.2.1 土壤理化性质的恶化第17页
        1.2.2 土壤微生物区系的失衡第17页
        1.2.3 植物的自毒作用第17-18页
        1.2.4 病原菌数量的积累第18页
        1.2.5 病原菌致病力的变化第18页
    1.3 尖孢镰刀菌的致病力及遗传结构分化第18-20页
        1.3.1 尖孢镰刀菌的致病力分化第19页
        1.3.2 尖孢镰刀菌的群体遗传多样性第19-20页
    1.4 尖孢镰刀菌的致病相关基因研究进展第20-24页
        1.4.1 尖孢镰刀菌重要致病相关基因第20-23页
        1.4.2 黄瓜枯萎病菌的致病相关基因第23页
        1.4.3 致病基因的表达调控对病原菌致病力的影响第23-24页
    1.5 本研究的目的和意义第24-25页
第二章 黄瓜连作条件下病原菌的致病力变化第25-48页
    2.1 实验材料第25-26页
        2.1.1 供试菌株第25页
        2.1.2 供试栽培品种第25页
        2.1.3 供试田地第25页
        2.1.4 培养基及试剂第25-26页
    2.2 实验方法第26-30页
        2.2.1 筛选用于田间接种的初始菌株第26-28页
        2.2.2 建立田间连作及轮作体系第28-29页
        2.2.3 田间病样的采集第29页
        2.2.4 病原菌的分离与鉴定第29页
        2.2.5 病原菌的致病力测定第29-30页
        2.2.6 数据处理第30页
    2.3 结果与分析第30-47页
        2.3.1 田间接种初始菌株的筛选第30-33页
        2.3.2 田间连作及轮作体系的建立第33页
        2.3.3 病原菌的分离与鉴定第33-37页
        2.3.4 病原菌的致病力测定第37-47页
    2.4 讨论第47-48页
第三章 连作土壤中黄瓜枯萎病菌的群体遗传多样性分析第48-55页
    3.1 实验材料第48页
        3.1.1 供试菌株第48页
        3.1.2 供试试剂第48页
    3.2 实验方法第48-49页
        3.2.1 提取上述菌株的DNA第48页
        3.2.2 TEF1-α,H3基因及IGS序列的扩增第48-49页
        3.2.3 测序及分析第49页
    3.3 结果与分析第49-53页
        3.3.1 不同茬次尖孢镰刀菌TEF1-α、H3及IGS基因序列的扩增第49-50页
        3.3.2 不同茬次病原菌群体的遗传多样性分析第50-52页
        3.3.3 系统发育分析第52-53页
    3.4 讨论第53-55页
第四章 强、弱致病力尖孢镰刀菌菌株的转录组分析第55-78页
    4.1 实验材料第55-56页
        4.1.1 供试菌株第55页
        4.1.2 供试黄瓜品种第55页
        4.1.3 供试质粒第55-56页
        4.1.4 供试培养基第56页
        4.1.5 供试试剂第56页
    4.2 实验方法第56-62页
        4.2.1 致病力分化菌株的获得第56-57页
        4.2.2 观察Foc侵染黄瓜的过程第57-58页
        4.2.3 转录组取样第58页
        4.2.4 RNA提取及质量检测第58-59页
        4.2.5 构建cDNA文库第59页
        4.2.6 测序及数据处理第59-60页
        4.2.7 转录组序列的组装与Unigene功能注释第60页
        4.2.8 Unigene表达差异分析第60页
        4.2.9 致病相关基因的分析第60页
        4.2.10 实时荧光定量PCR验证第60-62页
    4.3 结果与分析第62-76页
        4.3.1 抗、感品种继代培养第62-63页
        4.3.2 Foc侵染黄瓜过程的观察第63-64页
        4.3.3 RNA质量检测第64-65页
        4.3.4 转录组组装及功能注释第65-68页
        4.3.5 差异表达基因分析第68-72页
        4.3.6 致病相关基因分析第72-74页
        4.3.7 实时荧光定量PCR验证第74-76页
    4.4 讨论第76-78页
第五章 全文结论第78-79页
    5.1 全文结论第78页
    5.2 展望第78-79页
参考文献第79-89页
致谢第89-90页
作者简历第90页

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