| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-28页 |
| ·研究背景 | 第10页 |
| ·血管内皮生长因子受体-2 所介导的信号通路 | 第10-20页 |
| ·血管内皮生长因子的结构和功能 | 第10-12页 |
| ·血管内皮生长因子受体的结构和功能 | 第12-13页 |
| ·VEGFR-2 的结构及其生物学功能 | 第13页 |
| ·VEGFR-2 激酶区的结构及其生物学功能 | 第13-14页 |
| ·VEGFR-2 所介导的信号通路 | 第14-17页 |
| ·调控内皮细胞的增殖 | 第14页 |
| ·调控内皮细胞的迁移 | 第14-16页 |
| ·调控内皮细胞的存活 | 第16-17页 |
| ·调控内皮细胞的通透性 | 第17页 |
| ·VEGF/VEGFR-2 信号通路对树突细胞的活性的调节 | 第17页 |
| ·影响VEGFR-2 生物学功能的因素 | 第17-19页 |
| ·蛋白酪氨酸磷酸酶的影响 | 第17-18页 |
| ·Myoferlin 膜蛋白的影响 | 第18页 |
| ·受体内吞的影响 | 第18-19页 |
| ·以VEGF/VEGFR 信号通路为靶点的抗肿瘤治疗 | 第19页 |
| ·小结 | 第19-20页 |
| ·计算机辅助药物分子设计 | 第20-24页 |
| ·药物发现的途径与过程 | 第20-21页 |
| ·计算机辅助药物设计的策略及方法 | 第21-23页 |
| ·基于配体的药物设计方法 | 第21-22页 |
| ·基于受体的药物设计方法 | 第22页 |
| ·与组合化学相结合的药物设计方法 | 第22-23页 |
| ·计算机辅助药物设计所涉及到的相关技术 | 第23-24页 |
| ·药效团模型方法的简介 | 第23页 |
| ·三维定量构效关系研究方法简介 | 第23-24页 |
| ·激酶抑制剂的研究现状 | 第24-26页 |
| ·本课题研究内容及选题意义 | 第26-28页 |
| 第二章 药效团模型的建立 | 第28-43页 |
| ·实验材料 | 第28-29页 |
| ·计算平台 | 第29-30页 |
| ·硬件平台 | 第29-30页 |
| ·软件平台 | 第30页 |
| ·药效团模型的构建和分析 | 第30-42页 |
| ·化合物分子的空间构型的构建 | 第31页 |
| ·构建分子构象库 | 第31-33页 |
| ·对分子进行能量优化 | 第31-32页 |
| ·分子构象数据库的构建 | 第32-33页 |
| ·建立药效团模型 | 第33-41页 |
| ·确定模板分子 | 第33页 |
| ·DISCOtech 运算 | 第33-35页 |
| ·使用DISCOtech 对模型优化 | 第35-37页 |
| ·查看药效团信息 | 第37-39页 |
| ·使用GASP 进行模型优化 | 第39-41页 |
| ·药效团模型的评价 | 第41-42页 |
| ·小结 | 第42-43页 |
| 第三章 三维定量构象关系研究 | 第43-73页 |
| ·实验材料 | 第43-46页 |
| ·计算平台 | 第46-47页 |
| ·硬件平台 | 第46页 |
| ·软件平台 | 第46-47页 |
| ·3D-QSAR 模型的建立 | 第47-64页 |
| ·苯并咪唑衍生物生物活性数据的采集 | 第48页 |
| ·苯并咪唑类化合物的分子构型的构建 | 第48页 |
| ·苯并咪唑衍生物分子构型的优化 | 第48-51页 |
| ·初始构象的获得 | 第49-50页 |
| ·全局构象搜索 | 第50-51页 |
| ·活性构象的确定与分子的叠合 | 第51-53页 |
| ·获得常温下的分子构象 | 第51页 |
| ·数据库的建立 | 第51-52页 |
| ·分子的叠合 | 第52-53页 |
| ·导入生物活性数据 | 第53-54页 |
| ·CoMFA QSAR 的建立和PLS 数理统计 | 第54-63页 |
| ·CoMFA 模型参数的选取 | 第54-56页 |
| ·偏最小二乘法分析 | 第56-57页 |
| ·最佳Energy Cutoff 值的搜索 | 第57-59页 |
| ·不同电荷的影响 | 第59-60页 |
| ·空间网格间距对CoMFA 结果的影响 | 第60-62页 |
| ·应用Advanced CoMFA | 第62-63页 |
| ·基于CoMSIA 的QSAR 模型建立和PLS 数理统计 | 第63-64页 |
| ·QSAR 模型的验证 | 第64-67页 |
| ·结果与讨论 | 第67-71页 |
| ·基于CoMFA 的QSAR 模型 | 第67-68页 |
| ·基于CoMSIA 的QSAR 模型 | 第68-71页 |
| ·Optimizing QSAR | 第71页 |
| ·小结 | 第71-73页 |
| 第四章 新型 VEGFR-2 抑制剂的设计 | 第73-75页 |
| 结论与展望 | 第75-76页 |
| 参考文献 | 第76-81页 |
| 致谢 | 第81-82页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文及获奖目录 | 第82-83页 |
