| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6页 |
| 一 文献综述 | 第9-18页 |
| 0 引言 | 第9页 |
| 1 双壳贝类基因组的研究现状 | 第9-11页 |
| 1.1 基因组的特点 | 第9-11页 |
| 1.2 虾夷扇贝的国内外研究现状 | 第11页 |
| 2 基因组文库的研究进展 | 第11-14页 |
| 2.1 基因组文库主要大片段文库 | 第11-13页 |
| 2.2 大片段基因组文库的应用 | 第13-14页 |
| 3 第二代高通量测序技术 | 第14-18页 |
| 3.1 第二代高通量测序技术简介 | 第14-15页 |
| 3.2 高通量测序技术的应用 | 第15-18页 |
| 二 虾夷扇贝 fosmid 文库的构建 | 第18-31页 |
| 0 引言 | 第18页 |
| 1 材料与方法 | 第18-24页 |
| 1.1 材料及试剂盒 | 第18页 |
| 1.2 仪器 | 第18-19页 |
| 1.3 试剂 | 第19页 |
| 1.4 方法 | 第19-23页 |
| 1.5 插入片段大小的检测 | 第23-24页 |
| 2 结果分析 | 第24-29页 |
| 2.1 虾夷扇贝高质量 DNA 的获得 | 第24-25页 |
| 2.2 目的片段的获取 | 第25-26页 |
| 2.3 噬菌体的包装与转导 | 第26-27页 |
| 2.4 获取、保存克隆 | 第27页 |
| 2.5 构建二级池、超级池 | 第27-28页 |
| 2.6 插入片段大小与覆盖率检测 | 第28-29页 |
| 3 讨论 | 第29-31页 |
| 3.1 虾夷扇贝 DNA 的制备与高质量目的片段的获取 | 第29-30页 |
| 3.2 Fosmid 文库构建的意义 | 第30-31页 |
| 三 WGP 物理图谱构建策略的初步评估 | 第31-45页 |
| 1 材料方法 | 第31-34页 |
| 1.1 质粒提取 | 第31页 |
| 1.2 2b-RAD 测序文库构建 | 第31-33页 |
| 1.3 测序数据分析（以 8 张 384 孔板，BsaXI 酶切标签为例） | 第33-34页 |
| 2 结果与分析 | 第34-41页 |
| 2.1 解码信息统计 | 第35-41页 |
| 2.2 不同 Cutoff Score 条件下 FPC 拼接结果 | 第41页 |
| 3 讨论 | 第41-45页 |
| 3.1 混合全基因组物理图谱构建策略 | 第41-42页 |
| 3.2 对单克隆解码结果的分析 | 第42-43页 |
| 3.3 单克隆所含的标签数分布及标签深度分布分析 | 第43-44页 |
| 3.4 FPC 拼接条件及结果分析 | 第44-45页 |
| 参考文献 | 第45-53页 |
| 致谢 | 第53-54页 |
| 个人简历 | 第54-55页 |
