| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6页 |
| 英文缩略表 | 第10-11页 |
| 第一章 引言 | 第11-21页 |
| 1.1 TYLCD的分布 | 第11页 |
| 1.2 TYLCD的影响因素及发病症状 | 第11页 |
| 1.3 TYLCD的传毒介体和传毒特性 | 第11-12页 |
| 1.4 TYLCV的研究 | 第12-17页 |
| 1.4.1 TYLCD病原 | 第12页 |
| 1.4.2 TYLCV病毒基因组结构 | 第12-14页 |
| 1.4.3 病毒的侵染 | 第14页 |
| 1.4.4 病毒的复制 | 第14-15页 |
| 1.4.5 病毒的转录 | 第15-16页 |
| 1.4.6 病毒的移动 | 第16-17页 |
| 1.5 病毒的致病机理 | 第17页 |
| 1.6 番茄抗Ty基因简介 | 第17-18页 |
| 1.7 番茄与TYLCV的互作 | 第18-19页 |
| 1.8 试验设计 | 第19-21页 |
| 第二章 番茄Ty基因对TYLCV复制的影响 | 第21-29页 |
| 2.1 试验材料 | 第21-22页 |
| 2.1.1 试验样品 | 第21-22页 |
| 2.1.2 主要试剂及仪器设备 | 第22页 |
| 2.2 试验方法 | 第22-25页 |
| 2.2.1 pBinPLUS-SH2-1.4A的培养及提取 | 第22-23页 |
| 2.2.2 番茄苗的培养 | 第23页 |
| 2.2.3 接种病毒 | 第23页 |
| 2.2.4 DNA的提取 | 第23页 |
| 2.2.5 引物的设计及PCR检测 | 第23-24页 |
| 2.2.6 荧光定量PCR反应体系及条件 | 第24页 |
| 2.2.7 绝对定量标准曲线的制备 | 第24-25页 |
| 2.2.8 荧光定量PCR分析 | 第25页 |
| 2.3 结果与分析 | 第25-28页 |
| 2.3.1 TYLCV的特异引物 | 第25-26页 |
| 2.3.2 TYLCV绝对定量标准曲线 | 第26页 |
| 2.3.3 春季和秋季不同基因型番茄材料中TYLCV的拷贝情况 | 第26-28页 |
| 2.4 讨论 | 第28-29页 |
| 第三章 番茄Ty基因对TYLCV表达的影响 | 第29-39页 |
| 3.1 试验材料 | 第29页 |
| 3.1.1 试验样品 | 第29页 |
| 3.1.2 主要试剂及仪器设备 | 第29页 |
| 3.2 试验方法 | 第29-31页 |
| 3.2.1 试验材料的处理 | 第29-30页 |
| 3.2.2 RNA的提取及cDNA第一条链的合成 | 第30页 |
| 3.2.3 引物的设计及PCR检测 | 第30页 |
| 3.2.4 荧光定量PCR反应体系及条件 | 第30-31页 |
| 3.2.5 标准曲线的绘制及转录物的定量与分析 | 第31页 |
| 3.3 结果与分析 | 第31-37页 |
| 3.3.1 TYLCV的6个基因特异引物的设计 | 第31-32页 |
| 3.3.2 TYLCV各基因的绝对定量标准曲线 | 第32-33页 |
| 3.3.3 不同基因型番茄材料中TYLCV各基因的表达情况 | 第33-37页 |
| 3.4 讨论 | 第37-39页 |
| 第四章 番茄Ty基因对TYLCV移动的影响 | 第39-47页 |
| 4.1 试验材料 | 第39页 |
| 4.2 试验方法 | 第39页 |
| 4.3 试验结果与分析 | 第39-45页 |
| 4.3.1 TYLCV在番茄材料中的移动情况 | 第40-42页 |
| 4.3.2 供试番茄材料的发病情况 | 第42-45页 |
| 4.4 讨论 | 第45-47页 |
| 第五章 TYLCV侵染番茄的转录组分析 | 第47-58页 |
| 5.1 试验材料及试剂 | 第47页 |
| 5.2 材料处理 | 第47-48页 |
| 5.3 转录组的测序与分析 | 第48-49页 |
| 5.3.1 Illunima测序 | 第48页 |
| 5.3.2 基因组参考序列比对 | 第48页 |
| 5.3.3 基因表达量的注释 | 第48页 |
| 5.3.4 基因差异表达分析 | 第48-49页 |
| 5.3.5 GO功能注释及功能分析 | 第49页 |
| 5.3.6 KEGG pathway分析 | 第49页 |
| 5.4 试验结果 | 第49-56页 |
| 5.4.1 测序产量统计、序列质量评价 | 第49页 |
| 5.4.2 差异表达基因的筛选 | 第49-50页 |
| 5.4.3 差异基因的GO富集分析 | 第50-52页 |
| 5.4.4 KEGG代谢通路分析 | 第52-53页 |
| 5.4.5 光合作用途径中差异表达的基因 | 第53-56页 |
| 5.4.6 Ty-1/Ty-3 候选基因的表达情况 | 第56页 |
| 5.5 讨论 | 第56-58页 |
| 全文结论 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-65页 |
| 附录 | 第65-80页 |
| 致谢 | 第80-81页 |
| 作者简历 | 第81页 |
