| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 英文缩略表 | 第14-15页 |
| 第一章 引言 | 第15-20页 |
| 1.1 铜制剂农药 | 第15页 |
| 1.1.1 铜制剂农药的应用 | 第15页 |
| 1.1.2 铜制剂农药对微生物的影响 | 第15页 |
| 1.2 微生物对铜的耐性与代谢机理 | 第15-16页 |
| 1.2.1 微生物对铜的耐性 | 第15-16页 |
| 1.2.2 铜的代谢机理 | 第16页 |
| 1.3 木霉菌的生物防治机制及铜代谢研究概况 | 第16-18页 |
| 1.3.1 木霉菌的生防机制 | 第16-17页 |
| 1.3.2 木霉菌的产孢特性及影响因素 | 第17-18页 |
| 1.3.3 木霉菌铜胁迫应答及代谢研究概况 | 第18页 |
| 1.4 本研究的目的意义、技术路线 | 第18-20页 |
| 1.4.1 本研究的目的意义 | 第18-19页 |
| 1.4.2 本研究的技术路线 | 第19-20页 |
| 第二章 木霉菌耐铜性测定 | 第20-30页 |
| 2.1 材料 | 第20页 |
| 2.1.1 供试菌株 | 第20页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第20页 |
| 2.1.3 引物 | 第20页 |
| 2.2 方法 | 第20-22页 |
| 2.2.1 木霉基因组DNA提取 | 第20-21页 |
| 2.2.2 木霉菌分子鉴定 | 第21页 |
| 2.2.3 铜离子对木霉菌的菌落形态影响 | 第21页 |
| 2.2.4 木霉菌的生长速度测定 | 第21页 |
| 2.2.5 木霉菌的产孢量测定 | 第21页 |
| 2.2.6 木霉菌的生物量测定 | 第21-22页 |
| 2.3 结果与分析 | 第22-29页 |
| 2.3.1 木霉菌菌落形态及分生孢子梗形态观察 | 第22页 |
| 2.3.2 木霉菌基因组提取和ITS区的PCR扩增 | 第22-24页 |
| 2.3.3 木霉菌的系统进化树构建 | 第24-26页 |
| 2.3.4 铜胁迫对木霉菌菌落形态的影响 | 第26-27页 |
| 2.3.5 铜胁迫下对木霉菌生长的影响 | 第27-28页 |
| 2.3.6 铜胁迫对木霉菌Th-33和1888产孢的影响 | 第28页 |
| 2.3.7 铜胁迫对木霉菌Th-33和1888生物量的影响 | 第28-29页 |
| 2.4 讨论 | 第29-30页 |
| 第三章 哈茨木霉Th-33在铜胁迫下的转录组变化分析 | 第30-46页 |
| 3.1 材料 | 第30页 |
| 3.1.1 供试菌株 | 第30页 |
| 3.1.2 主要试剂 | 第30页 |
| 3.2 方法 | 第30-31页 |
| 3.2.1 取样时间的确定 | 第30页 |
| 3.2.2 总RNA的提取 | 第30页 |
| 3.2.3 cDNA文库的构建和测序 | 第30-31页 |
| 3.2.4 差异表达基因分析 | 第31页 |
| 3.3 结果与分析 | 第31-43页 |
| 3.3.1 取样时间的确定 | 第31页 |
| 3.3.2 RNA提取及测序文库构建 | 第31-32页 |
| 3.3.3 测序数据处理和de novo组装 | 第32页 |
| 3.3.4 原始测序数据质量分析 | 第32-35页 |
| 3.3.5 基因注释和表达定量分析 | 第35-36页 |
| 3.3.6 差异表达基因分析 | 第36页 |
| 3.3.7 差异表达基因的GO富集分析 | 第36-37页 |
| 3.3.8 差异表达基因的KEGG代谢途径富集分析 | 第37-38页 |
| 3.3.9 细胞壁相关蛋白基因 | 第38-39页 |
| 3.3.10 细胞膜相关蛋白基因 | 第39页 |
| 3.3.11 抗氧化酶SOD、CAT、POD编码基因 | 第39-40页 |
| 3.3.12 转录因子相关基因 | 第40-41页 |
| 3.3.13 细胞内铜代谢网络 | 第41-43页 |
| 3.4 讨论 | 第43-46页 |
| 第四章 棘孢木霉1888在铜胁迫下的转录组变化分析 | 第46-58页 |
| 4.1 材料 | 第46页 |
| 4.1.1 菌株 | 第46页 |
| 4.2 方法 | 第46-47页 |
| 4.2.1 取样时间的确定 | 第46页 |
| 4.2.2 总RNA的提取 | 第46页 |
| 4.2.3 cDNA文库的构建和测序 | 第46页 |
| 4.2.4 基因注释和表达定量分析 | 第46页 |
| 4.2.5 差异表达基因分析 | 第46-47页 |
| 4.2.6 差异表达基因功能分类 | 第47页 |
| 4.3 结果与分析 | 第47-56页 |
| 4.3.1 取样时间的确定 | 第47页 |
| 4.3.2 RNA提取及测序文库构建 | 第47页 |
| 4.3.3 原始测序数据质量分析 | 第47-50页 |
| 4.3.4 基因注释和表达定量分析 | 第50-51页 |
| 4.3.5 差异表达基因分析 | 第51页 |
| 4.3.6 差异表达基因的GO富集分析 | 第51-52页 |
| 4.3.7 差异表达基因的KEGG代谢途径富集分析 | 第52页 |
| 4.3.8 细胞壁相关蛋白基因 | 第52-53页 |
| 4.3.9 细胞膜相关蛋白基因 | 第53-54页 |
| 4.3.10 抗氧化酶SOD、CAT、POD编码基因 | 第54页 |
| 4.3.11 转录因子相关基因 | 第54页 |
| 4.3.12 细胞内铜代谢网络 | 第54-56页 |
| 4.4 讨论 | 第56-58页 |
| 第五章 Th-33和1888比较转录组分析 | 第58-67页 |
| 5.1 Th-33和1888差异表达基因对比分析 | 第58-65页 |
| 5.1.1 Th-33和1888差异表达基因数目比较 | 第58页 |
| 5.1.2 Th-33和1888差异表达基因的GO富集对比分析 | 第58-60页 |
| 5.1.3 Th-33和1888差异表达基因的KEGG代谢途径富集对比分析 | 第60-61页 |
| 5.1.4 Th-33和1888中编码细胞壁差异表达基因对比分析 | 第61页 |
| 5.1.5 Th-33和1888中编码细胞膜相关差异表达基因对比分析 | 第61-62页 |
| 5.1.6 Th-33和1888编码抗氧化酶SOD、CAT、POD差异表达基因对比分析 | 第62-63页 |
| 5.1.7 Th-33和1888编码谷胱甘肽相关差异表达基因对比分析 | 第63页 |
| 5.1.8 Th-33和1888编码转录因子相关差异表达基因对比分析 | 第63-64页 |
| 5.1.9 Th-33和1888对比细胞内铜代谢网络 | 第64-65页 |
| 5.2 讨论 | 第65-67页 |
| 第六章 实时荧光定量PCR验证差异表达基因 | 第67-74页 |
| 6.1 材料 | 第67-68页 |
| 6.1.1 菌株 | 第67页 |
| 6.1.2 主要仪器 | 第67页 |
| 6.1.3 主要试剂 | 第67页 |
| 6.1.4 基因信息 | 第67-68页 |
| 6.2 方法 | 第68-70页 |
| 6.2.1 总RNA的提取和cDNA合成 | 第68-69页 |
| 6.2.2 引物设计 | 第69页 |
| 6.2.3 检测和计算12个差异表达基因的相对表达量 | 第69-70页 |
| 6.3 结果与分析 | 第70-73页 |
| 6.3.1 qRT-PCR内参基因的验证 | 第70页 |
| 6.3.2 qRT-PCR差异表达基因的验证 | 第70-73页 |
| 6.4 讨论 | 第73-74页 |
| 第七章 全文结论 | 第74-75页 |
| 参考文献 | 第75-82页 |
| 致谢 | 第82-83页 |
| 作者简历 | 第83页 |
