| 摘要 | 第5-9页 |
| Abstract | 第9-13页 |
| 第一章 引言 | 第20-34页 |
| 1.1 “东亚植物区(East Asiatic Floristic Kingdom)”的提出 | 第20-22页 |
| 1.2 东亚植物区系的晚白垩至古近纪来源 | 第22-24页 |
| 1.2.1 北极—第三纪植物群(Arctic-Teriary Flora) | 第22-23页 |
| 1.2.2 提特斯—第三纪植物群(Tethyan-Tertiary Flora) | 第23页 |
| 1.2.3 北热带植物群(Boreotropical Flora) | 第23-24页 |
| 1.3 东亚与世界其他地区的联系 | 第24-29页 |
| 1.3.1 劳亚古陆与冈瓦纳古陆分离 | 第24页 |
| 1.3.2 东亚与美洲的联系 | 第24-26页 |
| 1.3.3 东亚与非洲的联系 | 第26-28页 |
| 1.3.4 东亚与印度次大陆联系 | 第28页 |
| 1.3.5 东亚—中亚—欧洲联系(欧亚大陆) | 第28-29页 |
| 1.3.6 东亚—热带亚洲—热带大洋洲联系(亚洲) | 第29页 |
| 1.4 被子植物的板块间传播途径 | 第29-31页 |
| 1.4.1 古近纪和新近纪以来的主要传播和迁移途径 | 第29-30页 |
| 1.4.2 长距离传播 | 第30-31页 |
| 1.5 存在问题及本研究目的意义 | 第31-34页 |
| 第二章 “北极—第三纪起源”——以唇形科龙头草属为例 | 第34-54页 |
| 2.1 前言 | 第34-36页 |
| 2.2 材料和方法 | 第36-45页 |
| 2.2.1 取样 | 第36-37页 |
| 2.2.2 DNA提取、扩增与测序 | 第37-42页 |
| 2.2.3 序列比对与系统发育分析 | 第42-43页 |
| 2.2.4 分化时间估算 | 第43-45页 |
| 2.2.5 生物地理学分析 | 第45页 |
| 2.3 研究结果 | 第45-50页 |
| 2.3.1 分子系统发育分析 | 第45-50页 |
| 2.3.2 生物地理学分析 | 第50页 |
| 2.4 讨论 | 第50-54页 |
| 2.4.1 核基因和叶绿体基因拓扑结构冲突 | 第50-51页 |
| 2.4.2 系统发育关系 | 第51-52页 |
| 2.4.3 分化时间与生物地理格局进化历史 | 第52-54页 |
| 第三章 “特提斯起源”——以茜草科假牛繁缕属和钩毛草属为例 | 第54-76页 |
| 3.1 前言 | 第54-61页 |
| 3.2 材料和方法 | 第61-64页 |
| 3.2.1 研究取样 | 第61页 |
| 3.2.2 总DNA提取、扩增与测序 | 第61页 |
| 3.2.3 序列比对及系统发育分析 | 第61-62页 |
| 3.2.4 分子分化时间估算及化石标定 | 第62-63页 |
| 3.2.5 生物地理起源分析 | 第63页 |
| 3.2.6 生态位模型 | 第63-64页 |
| 3.3 研究结果 | 第64-66页 |
| 3.3.1 系统发育分析 | 第64-65页 |
| 3.3.2 分化时间分析 | 第65-66页 |
| 3.3.3 祖先起源地重建 | 第66页 |
| 3.3.4 生态位模型 | 第66页 |
| 3.4 讨论 | 第66-76页 |
| 3.4.1 假牛繁缕属与钩毛草属的系统发育 | 第66-67页 |
| 3.4.2 始新世—中新世古地中海起源 | 第67-70页 |
| 3.4.3 假牛繁缕属的东亚—地中海间断模式 | 第70-74页 |
| 3.4.4 钩毛草属的青藏高原—北美西部间断模式 | 第74-75页 |
| 3.4.5 现存种分化始于上新世 | 第75-76页 |
| 第四章 “热带亚洲起源”——以荨麻科荨麻族为例 | 第76-106页 |
| 4.1 前言 | 第76-80页 |
| 4.2 材料和方法 | 第80-90页 |
| 4.2.1 研究取样 | 第80-81页 |
| 4.2.2 总DNA提取、扩增与测序 | 第81页 |
| 4.2.3 系统发育分析 | 第81页 |
| 4.2.4 形态性状进化分析 | 第81-87页 |
| 4.2.5 分子分化时间估算及化石标定 | 第87-89页 |
| 4.2.6 生物地理起源分析 | 第89-90页 |
| 4.3 研究结果 | 第90-97页 |
| 4.3.1 ITS分析 | 第90-91页 |
| 4.3.2 叶绿体分析 | 第91-93页 |
| 4.3.3 联合分析 | 第93页 |
| 4.3.4 形态性状进化 | 第93-95页 |
| 4.3.5 生物地理学分析 | 第95-97页 |
| 4.4 讨论 | 第97-106页 |
| 4.4.1 Gyrotaenia的系统位置 | 第97页 |
| 4.4.2 荨麻族下各属的单系性 | 第97-99页 |
| 4.4.3 荨麻族下属间的系统发育关系 | 第99-102页 |
| 4.4.4 形态性状进化 | 第102-103页 |
| 4.4.5 荨麻族生物地理起源与分化 | 第103-106页 |
| 第五章 “就地起源”——以东亚与热带大洋洲间断通泉草科为例 | 第106-130页 |
| 5.1 前言 | 第106-110页 |
| 5.2 材料和方法 | 第110-118页 |
| 5.2.0 研究取样 | 第110-111页 |
| 5.2.1 基因片段筛选 | 第111页 |
| 5.2.2 总DNA提取、扩增与测序 | 第111-112页 |
| 5.2.3 序列比对及系统发育分 | 第112-116页 |
| 5.2.4 分化时间估算及化石标定 | 第116-117页 |
| 5.2.5 生物地理起源分析 | 第117-118页 |
| 5.3 研究结果 | 第118-124页 |
| 5.3.1 系统发育分析 | 第118-122页 |
| 5.3.2 分化时间分析及祖先起源地重建 | 第122-124页 |
| 5.4 讨论 | 第124-130页 |
| 5.4.1 通泉草科单系的确定及其在唇形目中的系统位置 | 第124-125页 |
| 5.4.2 通泉草科下系统发育关系 | 第125页 |
| 5.4.3 通泉草属属下系统关系 | 第125-129页 |
| 5.4.4 通泉草科两极间断分布格局的生物地理历史 | 第129-130页 |
| 第六章 “南半球成分的渗入--走出南温带”：和尚菜属分子生物地理学揭示菊科早期演化历史 | 第130-146页 |
| 6.1 前言 | 第130-133页 |
| 6.2 材料和方法 | 第133-138页 |
| 6.2.1 研究取样 | 第133页 |
| 6.2.2 总DNA提取、扩增与测序 | 第133-134页 |
| 6.2.3 序列比对及系统发育分析 | 第134页 |
| 6.2.4 分子分化时间估算及化石标定 | 第134-138页 |
| 6.2.5 生物地理起源分析 | 第138页 |
| 6.3 研究结果 | 第138-142页 |
| 6.3.1 系统发育分析 | 第138-140页 |
| 6.3.2 分化时间分析 | 第140-141页 |
| 6.3.3 祖先起源地重建 | 第141-142页 |
| 6.4 讨论 | 第142-146页 |
| 6.4.1 和尚菜属的系统发育 | 第142-143页 |
| 6.4.2 和尚菜属植物的瘦果传播机制 | 第143页 |
| 6.4.3 和尚菜属的起源与生物地理进化 | 第143-146页 |
| 第七章 结论与展望 | 第146-156页 |
| 7.1 现代东亚植物区系不是一个古老的区系 | 第146-151页 |
| 7.2 地质环境变迁是现代东亚植物区系形成的主要驱动力 | 第151-154页 |
| 7.3 隔离和迁移是东亚植物区系分布格局形成的重要机制 | 第154-155页 |
| 7.4 展望 | 第155-156页 |
| 参考文献 | 第156-191页 |
| 致谢 | 第191-195页 |
| 作者简历及攻读学位期间发表的学术论文与研究成果 | 第195-198页 |
