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白介素6基因序列单核苷酸多态与京海黄鸡柔嫩艾美尔球虫抗性的关联分析

中文摘要第3-5页
Abstract第5-6页
中英文对照表第10-11页
第一章 文献综述第11-18页
    1 鸡的球虫病第11-12页
        1.1 鸡球虫病的危害第11页
        1.2 鸡球虫病的预防控制现状和发展趋势第11-12页
    2 IL-6细胞因子的研究进展第12-14页
        2.1 鸡IL-6分子生物学特点和基因组成第13页
        2.2 IL-6基因的生物学功能第13页
        2.3 IL-6与鸡球虫病抗性的关系第13-14页
    3 鸡球虫病抗性相关的评价指标第14-16页
        3.1 干扰素(interferon,INF)第14页
        3.2 白细胞介素(interleukin,IL)第14-15页
        3.3 β-胡萝卜素(β-Carotene,β-C)第15页
        3.4 一氧化氮(NO)第15页
        3.5 抗氧化系统酶第15-16页
        3.6 肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)第16页
    4 京海黄鸡简介第16-17页
    5 本研究的目的意义第17-18页
第二章 球虫感染对京海黄鸡不同组织IL-6,IL-8和CCLi2表达量的影响第18-27页
    1 材料与方法第18-22页
        1.1 试验动物第18页
        1.2 组织样本采集第18页
        1.3 主要仪器与设备第18-19页
        1.4 主要实验试剂第19页
        1.5 主要试剂配制第19页
        1.6 鸡组织总RNA的提取和检测(Trizol法)第19-21页
        1.7 cDNA的合成第21页
        1.8 荧光定量引物设计第21页
        1.9 实时荧光定量PCR第21-22页
        1.10 荧光定量结果分析第22页
    2 结果与分析第22-25页
        2.1 RNA提取结果第22页
        2.2 目的基因熔解曲线第22-23页
        2.3 基因组织表达谱分析及感染球虫后表达的变化第23-25页
    3 讨论第25-27页
第三章 IL-6基因单核苷酸突变第27-41页
    1 材料与方法第27-30页
        1.1 试验动物及病原第27页
        1.2 血样采集第27-28页
        1.3 主要仪器与设备第28页
        1.4 主要实验试剂第28页
        1.5 主要试剂的配制第28页
        1.6 鸡血液DNA的提取第28-29页
        1.7 引物设计第29页
        1.8 PCR扩增体系和条件第29-30页
        1.9 CE测序第30页
    2 数据统计与分析方法第30-31页
        2.1 序列比对第30页
        2.2 基因频率和基因型频率的计算第30-31页
        2.3 Hardy-Weinberg平衡状态的检验第31页
    3 结果与分析第31-38页
        3.1 基因组DNA的提取效果检测第31页
        3.2 IL-6基因测序结果第31-35页
        3.3 IL6基因上游启动子区SNP突变位点转录因子预测第35-38页
    4 讨论第38-41页
        4.1 IL-6基因的多态性和群体遗传学分析第38-39页
        4.2 IL-6基因5'调控区多态性第39页
        4.3 IL-6基因内含子多态性第39-40页
        4.4 IL-6基因外显子多态性第40页
        4.5 IL-6基因3'端多态性第40-41页
第四章 京海黄鸡IL-6基因单核苷酸突变与柔嫩艾美尔球虫抗性指标的关联分析第41-78页
    1 材料与方法第41-42页
        1.1 试验动物及病原第41页
        1.2 主要仪器设备与型号第41-42页
        1.3 抗性指标的测定第42页
    2 数据统计与分析方法第42-43页
        2.1 相关软件第42页
        2.2 单倍型分析第42-43页
        2.3 关联性分析第43页
    3 结果与分析第43-76页
        3.1 京海黄鸡IL-6基因单核苷酸突变与球虫病抗性指标的关联分析第43-71页
        3.2 IL-6基因各变异位点的连锁不平衡分析第71-73页
        3.3 单倍型分析第73-76页
    4 讨论第76-78页
        4.1 IL-6基因单核苷酸突变与抗性指标的关联性第76-77页
        4.2 连锁不平衡分析第77页
        4.3 单倍型分析第77-78页
全文结论第78-79页
参考文献第79-85页
攻读学位期间发表学术论文第85-86页
致谢第86-87页

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