| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4页 |
| 第一章 绪论 | 第7-10页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第7页 |
| 1.2 国内外发展概况 | 第7-9页 |
| 1.3 本文研究内容 | 第9-10页 |
| 第二章 组蛋白去乙酰化酶及其抑制剂 | 第10-14页 |
| 2.1 组蛋白乙酰转移酶 | 第10-11页 |
| 2.2 组蛋白去乙酰化酶 | 第11-12页 |
| 2.3 组蛋白去乙酰化酶抑制剂 | 第12-13页 |
| 2.4 组蛋白去乙酰化酶抑制剂与癌症的治疗 | 第13-14页 |
| 第三章 基因芯片数据分析方法 | 第14-22页 |
| 3.1 实验平台介绍 | 第14-17页 |
| 3.1.1 GSEA | 第14页 |
| 3.1.2 Partek Genomics Suite | 第14-16页 |
| 3.1.3 BioConductor | 第16页 |
| 3.1.4 IPA（Ingenuity Pathway Anaylsis） | 第16-17页 |
| 3.2 相关数据库介绍 | 第17-22页 |
| 3.2.1 基因表达综合数据库 | 第17页 |
| 3.2.2 基因本体论 | 第17-19页 |
| 3.2.3 京都基因与基因组百科全书 | 第19-20页 |
| 3.2.4 凋亡路径图 | 第20-22页 |
| 第四章 基于基因表达一致性统计计算的SAHA作用靶通路分析 | 第22-30页 |
| 4.1 数据源及其预处理 | 第22页 |
| 4.2 H-score方法 | 第22-23页 |
| 4.3 H-score算法实现 | 第23-25页 |
| 4.4 通路内基因表达一致性分析 | 第25-26页 |
| 4.5 正常与肿瘤样本通路内的基因表达一致性分析 | 第26-27页 |
| 4.6 不同功能类中通路内基因表达一致性分析 | 第27-28页 |
| 4.7 SAHA作用靶通路分析 | 第28-30页 |
| 第五章 基于IPA通路分析的SAHA凋亡诱导机制模型预测 | 第30-38页 |
| 5.1 差异表达基因筛选 | 第30页 |
| 5.2 差异表达基因的通路富集分析 | 第30-31页 |
| 5.3 差异表达基因的功能聚类分析 | 第31页 |
| 5.4 差异表达基因的表达谱聚类分析 | 第31-32页 |
| 5.5 SAHA凋亡诱导机制预测 | 第32-38页 |
| 5.5.1 影响DNA损伤修复过程 | 第32-34页 |
| 5.5.2 诱导细胞周期停滞 | 第34-35页 |
| 5.5.3 细胞凋亡响应过程 | 第35-37页 |
| 5.5.4 SAHA诱导的凋亡机制模型 | 第37-38页 |
| 第六章 总结与展望 | 第38-39页 |
| 参考文献 | 第39-42页 |
| 致谢 | 第42-43页 |
| 攻读硕士学位期间发表论文 | 第43页 |
