摘要 | 第3-4页 |
Abstract | 第4-5页 |
第一章 绪论 | 第8-12页 |
1.1 研究背景与意义 | 第8-9页 |
1.1.1 研究背景 | 第8页 |
1.1.2 研究意义 | 第8-9页 |
1.2 国内外研究现状 | 第9-10页 |
1.3 本文研究内容及结构安排 | 第10-12页 |
第二章 构象性B细胞表位与模拟表位的特征挖掘 | 第12-24页 |
2.1 数据集的构建 | 第13页 |
2.2 构象性B细胞表位基本特征的挖掘 | 第13-17页 |
2.2.1 表位的序列连续性区段大小 | 第14页 |
2.2.2 任意两表位残基间距离值 | 第14-15页 |
2.2.3 表位Patch大小 | 第15-17页 |
2.2.4 表位路径的最小长度 | 第17页 |
2.3 构象性B细胞表位与模拟表位残基特征的挖掘 | 第17-22页 |
2.3.1 氨基酸倾向性 | 第17-19页 |
2.3.2 残基-邻居(氨基酸对)倾向性 | 第19-20页 |
2.3.3 残基可及性 | 第20-22页 |
2.4 本章小结 | 第22-24页 |
第三章 基于表位和模拟表位特征的构象性B细胞表位预测方法 | 第24-40页 |
3.1 数据集的构建 | 第25-26页 |
3.2 方法流程图 | 第26-27页 |
3.3 特征提取 | 第27-31页 |
3.3.1 基于氨基酸倾向性的特征 | 第27页 |
3.3.2 基于相对溶液可及性表面面积的特征 | 第27-28页 |
3.3.3 基于氨基酸对倾向性的特征 | 第28-30页 |
3.3.4 基于模拟表位的特征 | 第30-31页 |
3.4 确定候选表位氨基酸 | 第31页 |
3.5 评价参数的选取 | 第31-32页 |
3.6 方法实现与结果分析 | 第32-35页 |
3.6.1 方法实现 | 第32-34页 |
3.6.2 结果分析 | 第34-35页 |
3.7 与其他经典方法的性能比较 | 第35-38页 |
3.8 本章小结 | 第38-40页 |
第四章 总结与展望 | 第40-42页 |
4.1 全文总结 | 第40页 |
4.2 研究展望 | 第40-42页 |
参考文献 | 第42-46页 |
致谢 | 第46页 |