| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 引言 | 第12-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-24页 |
| 1.1 DNA分子标记在水产动物遗传育种中的应用 | 第13-16页 |
| 1.1.1 RFLP在水产动物遗传育种中的应用 | 第13页 |
| 1.1.2 RAPD在水产动物遗传育种中的应用 | 第13-14页 |
| 1.1.3 AFLP在水产动物遗传育种中的应用 | 第14页 |
| 1.1.4 SSR在水产动物遗传育种中的应用 | 第14-15页 |
| 1.1.5 SNP在水产动物遗传育种中的应用 | 第15-16页 |
| 1.2 SNP分子遗传标记在罗非鱼中应用 | 第16-18页 |
| 1.2.1 罗非鱼生长性状相关的SNP分子遗传标记 | 第16-17页 |
| 1.2.2 罗非鱼抗逆性性状相关的SNP分子遗传标记 | 第17页 |
| 1.2.3 罗非鱼性别性状相关的SNP分子遗传标记 | 第17页 |
| 1.2.4 罗非鱼SNP群体遗传多样性研究及亲缘关系鉴定中的应用 | 第17-18页 |
| 1.2.5 罗非鱼SNPs遗传连锁图谱的构建及QTL定位 | 第18页 |
| 1.3 Ikaros基因的研究进展 | 第18-22页 |
| 1.3.1 Ikaros基因的结构 | 第18-19页 |
| 1.3.2 Ikaros基因的表达 | 第19-20页 |
| 1.3.3 Ikaros基因的功能 | 第20-21页 |
| 1.3.4 Ikaros基因多态性与疾病的相关性 | 第21-22页 |
| 1.4 本研究的目的与意义 | 第22-23页 |
| 1.5 本研究的技术路线 | 第23-24页 |
| 第二章 尼罗罗非鱼Ikaros基因的克隆及表达分析 | 第24-41页 |
| 2.1 实验材料 | 第24-25页 |
| 2.1.1 实验用鱼 | 第24页 |
| 2.1.2 菌株 | 第24-25页 |
| 2.1.3 实验试剂 | 第25页 |
| 2.2 实验方法 | 第25-27页 |
| 2.2.1 尼罗罗非鱼Ikaros基因组DNA序列及其cDNA序列的克隆 | 第25页 |
| 2.2.2 尼罗罗非鱼Ikaros基因的组织分布 | 第25-26页 |
| 2.2.3 尼罗罗非鱼感染无乳链球菌后Ikaros基因在各组织中的表达变化 | 第26页 |
| 2.2.4 生物信息学与统计分析 | 第26-27页 |
| 2.3 实验结果 | 第27-38页 |
| 2.3.1 尼罗罗非鱼Ikaros的cDNA序列及其特征 | 第27-28页 |
| 2.3.2 尼罗罗非鱼Ikaros的基因组DNA序列及其mRNA剪接异构体 | 第28-31页 |
| 2.3.3 尼罗罗非鱼Ikaros蛋白的结构分析 | 第31-33页 |
| 2.3.4 尼罗罗非鱼Ikaros的系统进化分析 | 第33页 |
| 2.3.5 Ikaros基因在健康尼罗罗非鱼不同组织中的表达特征 | 第33页 |
| 2.3.6 感染无乳链球菌后Ikaros基因在尼罗罗非鱼组织中的表达变化情况 | 第33-38页 |
| 2.4 讨论 | 第38-41页 |
| 2.4.1 尼罗罗非鱼Ikaros基因序列特征及分析 | 第38页 |
| 2.4.2 尼罗罗非鱼Ikaros同源比较及结构域分析 | 第38-39页 |
| 2.4.3 尼罗罗非鱼Ikaros基因的表达特征 | 第39-41页 |
| 第三章 尼罗罗非鱼Ikaros基因5'调控区的克隆及其与无乳链球菌抗性相关SNP位点的筛选 | 第41-58页 |
| 3.1 实验材料 | 第42页 |
| 3.1.1 实验用鱼 | 第42页 |
| 3.1.2 菌株 | 第42页 |
| 3.1.3 实验试剂 | 第42页 |
| 3.2 实验方法 | 第42-44页 |
| 3.2.1 F0和F1代尼罗罗非鱼抗病群体和易感群体的构建 | 第42-43页 |
| 3.2.2 基因组DNA的提取 | 第43页 |
| 3.2.3 尼罗罗非鱼Ikaros基因5'调控区的克隆与序列分析 | 第43页 |
| 3.2.4 尼罗罗非鱼Ikaros基因5'调控区序列SNPs的筛查 | 第43页 |
| 3.2.5 SNPs的基因分型及与无乳链球菌抗性的关联分析 | 第43-44页 |
| 3.2.6 生物信息学分析 | 第44页 |
| 3.3 结果与分析 | 第44-54页 |
| 3.3.1 Ikaros基因5'调控区序列的克隆 | 第44-45页 |
| 3.3.2 Ikaros基因5'调控区序列的结构预测和分析 | 第45-46页 |
| 3.3.3 Ikaros基因5'调控区序列SNPs的筛查及与无乳链球菌病抗性的关联分析 | 第46页 |
| 3.3.4 F1代尼罗罗非鱼抗病群体和易感群体的SNPs基因分型及遗传结构分析 | 第46-49页 |
| 3.3.5 F1代Ikaros基因5'调控区SNPs的基因分型及遗传结构分析 | 第49页 |
| 3.3.6 F1代尼罗罗非鱼SNPs的连锁不平衡分析及与无乳链球菌病抗性的关联分析 | 第49-54页 |
| 3.4 讨论 | 第54-58页 |
| 3.4.1 Ikaros基因5'调控区序列的结构特点 | 第54-55页 |
| 3.4.2 Ikaros基因SNP多态性分析 | 第55页 |
| 3.4.3 尼罗罗非鱼抗病相关SNP多态性分析 | 第55-58页 |
| 全文总结 | 第58-60页 |
| 参考文献 | 第60-69页 |
| 硕士期间发表论文情况 | 第69-70页 |
| 致谢 | 第70页 |
