| 摘要 | 第6-7页 |
| abstract | 第7-8页 |
| 英文缩略表 | 第13-14页 |
| 第一章 引言 | 第14-28页 |
| 1.1 菰的种类分布及起源驯化 | 第14-17页 |
| 1.1.1 菰的种类及分布 | 第14-16页 |
| 1.1.2 菰的起源驯化 | 第16-17页 |
| 1.2 菰米的营养价值与功效 | 第17-18页 |
| 1.3 菰与生态环境的关系 | 第18页 |
| 1.4 野生菰资源遗传多样性及遗传结构分析 | 第18-22页 |
| 1.4.1 所使用的标记 | 第18-21页 |
| 1.4.2 常用分析软件 | 第21-22页 |
| 1.4.3 中国野生菰的遗传现状 | 第22页 |
| 1.5 菰基因组与水稻基因组的比较 | 第22-23页 |
| 1.6 菰与水稻育种 | 第23-25页 |
| 1.6.1 杂交手段的尝试 | 第24页 |
| 1.6.2 转基因手段的尝试 | 第24-25页 |
| 1.6.3 菰优异性状控制基因挖掘的实践 | 第25页 |
| 1.7 抗病基因与植物免疫 | 第25-26页 |
| 1.7.1 植物抗病基因 | 第25-26页 |
| 1.7.2 植物免疫反应 | 第26页 |
| 1.8 本研究的目的意义 | 第26-28页 |
| 第二章 华中、华东五大湖区野生菰的遗传结构与多样性分析 | 第28-40页 |
| 2.1 材料与方法 | 第28-32页 |
| 2.1.1 材料 | 第28-29页 |
| 2.1.2 试验方法 | 第29-32页 |
| 2.1.2.1 菰基因组DNA提取 | 第29页 |
| 2.1.2.2 SSR标记的选择与PCR扩增、电泳 | 第29-31页 |
| 2.1.2.3 数据统计分析 | 第31-32页 |
| 2.2 结果与分析 | 第32-38页 |
| 2.2.1 华中、华东野生菰的遗传多样性 | 第32-36页 |
| 2.2.2 中国野生菰的遗传结构分析 | 第36-38页 |
| 2.2.3 聚类和进化关系分析 | 第38页 |
| 2.3 小结 | 第38-39页 |
| 2.4 讨论 | 第39-40页 |
| 第三章 菰ZLBBR1基因的克隆及功能分析 | 第40-67页 |
| 3.1 材料与方法 | 第40-52页 |
| 3.1.1 材料 | 第40-43页 |
| 3.1.1.1 植物材料 | 第40页 |
| 3.1.1.2 菌株和质粒 | 第40-41页 |
| 3.1.1.3 主要试剂及仪器 | 第41页 |
| 3.1.1.4 PCR扩增的引物 | 第41-42页 |
| 3.1.1.5 主要培养基及溶液 | 第42-43页 |
| 3.1.1.6 水稻遗传转化所用培养基及组分 | 第43页 |
| 3.1.2 主要实验方法 | 第43-52页 |
| 3.1.2.1 菰叶片总RNA的提取 | 第43-44页 |
| 3.1.2.2 5’RACE | 第44页 |
| 3.1.2.3 3’RACE | 第44页 |
| 3.1.2.4 染色体步移法克隆ZlBBR1基因启动子 | 第44-45页 |
| 3.1.2.5 ZlBBR1功能验证相关载体构建 | 第45-49页 |
| 3.1.2.6 ZlBBR1蛋白亚细胞定位研究 | 第49-50页 |
| 3.1.2.7 水稻遗传转化 | 第50页 |
| 3.1.2.8 实时荧光定量PCR | 第50页 |
| 3.1.2.9 GUS组织化学染色 | 第50-51页 |
| 3.1.2.10 白叶枯病原菌接种处理 | 第51页 |
| 3.1.2.11 激素测定 | 第51页 |
| 3.1.2.12 转录组测序 | 第51-52页 |
| 3.2 结果与分析 | 第52-64页 |
| 3.2.1 菰ZlBBR1基因全序列的克隆 | 第52-53页 |
| 3.2.2 菰ZlBBR1基因功能预测 | 第53-55页 |
| 3.2.3 菰ZlBBR1基因编码蛋白的亚细胞定位 | 第55页 |
| 3.2.4 菰ZlBBR1基因的表达模式分析 | 第55-56页 |
| 3.2.5 转菰ZlBBR1基因水稻材料对PXO71的抗性统计 | 第56-59页 |
| 3.2.5.1 转基因水稻T_0代材料对PXO71的抗性统计 | 第56-57页 |
| 3.2.5.2 转基因水稻纯系材料对PXO71的抗性统计 | 第57-59页 |
| 3.2.6 三个纯系材料对PXO71抗性反应中的激素变化 | 第59-60页 |
| 3.2.7 纯系材料L1对PXO71抗性反应中的转录水平变化 | 第60-64页 |
| 3.3 小结 | 第64页 |
| 3.4 讨论 | 第64-67页 |
| 第四章 ZlBBR1同源基因的鉴定及生物信息学分析 | 第67-82页 |
| 4.1 材料与方法 | 第67-73页 |
| 4.1.1 材料 | 第67-70页 |
| 4.1.1.1 鄱阳湖区菰样本材料 | 第67-69页 |
| 4.1.1.2 全国范围内菰样本材料 | 第69-70页 |
| 4.1.1.3 160 份常规水稻种植资源材料 | 第70页 |
| 4.1.2 方法 | 第70-73页 |
| 4.1.2.1 DNA模板制备 | 第70-72页 |
| 4.1.2.2 PCR反应程序及参数 | 第72-73页 |
| 4.1.2.3 目标片段回收 | 第73页 |
| 4.1.2.4 测序及序列拼接 | 第73页 |
| 4.1.2.5 生物信息学分析软件及网站 | 第73页 |
| 4.2 结果与分析 | 第73-80页 |
| 4.2.1 鄱阳湖区菰ZlBBR1的鉴定和进化分析 | 第73-75页 |
| 4.2.2 全国范围内菰样品ZlBBR1基因编码区差异位点分析 | 第75-77页 |
| 4.2.3 常规水稻材料中OsBBR1同源基因的鉴定及进化分析 | 第77-80页 |
| 4.3 小结 | 第80-81页 |
| 4.4 讨论 | 第81-82页 |
| 第五章 全文结论 | 第82-83页 |
| 参考文献 | 第83-93页 |
| 附录 | 第93-97页 |
| 致谢 | 第97-98页 |
| 作者简历 | 第98页 |
