| 中文摘要 | 第1-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 1 前言 | 第12-24页 |
| ·猪圆环病毒病研究进展 | 第12-16页 |
| ·猪圆环病毒的发现和命名 | 第12页 |
| ·病原学特征 | 第12-13页 |
| ·分子生物学特征 | 第13页 |
| ·流行病学特征 | 第13-14页 |
| ·猪圆环病毒Ⅱ型相关疾病 | 第14-16页 |
| ·miRN A的研究进展 | 第16-20页 |
| ·miRN A的发现与命名 | 第16-17页 |
| ·miRN A的起源 | 第17-18页 |
| ·miRN A的合成 | 第18-19页 |
| ·RNA诱导沉默复合物（RISC）的生成 | 第19-20页 |
| ·miRN A的调控 | 第20页 |
| ·miRN A的高通量测序及生物信息学分析 | 第20-23页 |
| ·小RNA测序 | 第21页 |
| ·miRN A靶基因的预测 | 第21-23页 |
| ·miRN A靶基因的鉴定 | 第23页 |
| ·本研究目的意义 | 第23-24页 |
| 2 材料与方法 | 第24-36页 |
| ·实验材料 | 第24-27页 |
| ·实验动物 | 第24页 |
| ·样品采集 | 第24页 |
| ·毒株 | 第24页 |
| ·主要仪器设备 | 第24-25页 |
| ·主要试剂及来源 | 第25-26页 |
| ·主要数据库及生物信息学软件 | 第26页 |
| ·常用试剂的配制 | 第26-27页 |
| ·实验方法 | 第27-36页 |
| ·引物序列及Tm值 | 第27页 |
| ·肺组织总RNA的提取 | 第27-29页 |
| ·cDNA文库构建 | 第29-30页 |
| ·Illumina/Solexa测序数据分析 | 第30-31页 |
| ·miRN A表达谱的qRT-PCR验证分析 | 第31-33页 |
| ·上调差异表达miRNA富集通路及靶基因预测 | 第33页 |
| ·上调差异表达miRNA可能靶基因分析 | 第33-36页 |
| 3 结果与分析 | 第36-55页 |
| ·总RNA的提取，小RNA文库的构建及Solexa测序分析 | 第36-43页 |
| ·总RNA的检测 | 第36页 |
| ·RNA质量检测及测序的文库构建 | 第36-37页 |
| ·小RNA测序数据处理及片段长度分布统计 | 第37-38页 |
| ·文库间公共与特有序列及基因组定位分析 | 第38-42页 |
| ·小RNA序列的分类和注释分析 | 第42-43页 |
| ·PCV2感染后肺组织miRNAs的鉴定 | 第43-47页 |
| ·已知miRN A的比对 | 第43页 |
| ·已知miRN A差异表达分析 | 第43-45页 |
| ·差异表达miRNA聚类分析 | 第45-47页 |
| ·新miRN A预测 | 第47页 |
| ·已知miRN A表达的qRT-PCR验证 | 第47-50页 |
| ·标准曲线的制备 | 第47-48页 |
| ·差异表达miRNA的定量验证 | 第48-50页 |
| ·上调差异表达miRNA富集通路及靶基因预测 | 第50-55页 |
| ·四个上调表达miRNA的富集通路分析 | 第50-52页 |
| ·四个上调表达miRNA的靶基因分析 | 第52-54页 |
| ·miRN A靶基因NFAT5、IGF1定量分析 | 第54-55页 |
| 4 讨论 | 第55-60页 |
| ·Solexa测序数据分析 | 第55页 |
| ·差异表达miRN A分析 | 第55-57页 |
| ·四个上调表达miRNA功能分析 | 第57-58页 |
| ·靶基因功能分析 | 第58-60页 |
| 5 结论 | 第60-61页 |
| 参考文献 | 第61-70页 |
| 致谢 | 第70-71页 |
| 攻读硕士期间发表论文情况 | 第71页 |