| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-15页 |
| 1 绪论 | 第15-28页 |
| ·植物花期调控技术研究 | 第15-18页 |
| ·温度调控 | 第15-16页 |
| ·光照调控 | 第16-17页 |
| ·化学调控 | 第17页 |
| ·其它栽培措施调控 | 第17-18页 |
| ·植物开花途径的分子调控机理 | 第18-23页 |
| ·成花诱导 | 第18-21页 |
| ·成花的分生组织发生 | 第21-23页 |
| ·数字基因表达谱升级版(RNA-seq(Quantification)) | 第23-26页 |
| ·RNA-seq背景和概述 | 第23-24页 |
| ·RNA-seq简介 | 第24页 |
| ·RNA-seq研究流程 | 第24-26页 |
| ·本研究的目的与意义 | 第26-27页 |
| ·技术路线 | 第27-28页 |
| 2 百子莲花期调控技术研究 | 第28-38页 |
| ·材料与方法 | 第28-29页 |
| ·材料处理 | 第28-29页 |
| ·方法 | 第29页 |
| ·结果与分析 | 第29-36页 |
| ·试验地全年温度情况 | 第29-30页 |
| ·百子莲花芽分化进程 | 第30-31页 |
| ·不同处理对百子莲花芽分化的影响 | 第31页 |
| ·不同处理对百子莲花期的影响 | 第31-32页 |
| ·不同处理对百子莲开花的影响 | 第32-33页 |
| ·不同处理对百子莲小花的影响 | 第33-36页 |
| ·讨论 | 第36-37页 |
| ·百子莲成花转变过程 | 第36页 |
| ·不同栽培条件对百子莲花期的影响 | 第36-37页 |
| ·外源生长调节剂对百子莲开花的影响 | 第37页 |
| ·本章小结 | 第37-38页 |
| 3 百子莲不同分化阶段花芽比较转录组分析 | 第38-96页 |
| ·材料与方法 | 第38-43页 |
| ·植物材料 | 第38页 |
| ·RNA提取、纯化与反转录 | 第38-40页 |
| ·文库构建和升级版DGE测序 | 第40页 |
| ·原始数据分析与参考序列比对 | 第40页 |
| ·测序评估 | 第40-41页 |
| ·基因表达量统计与功能注释 | 第41页 |
| ·差异表达基因筛选 | 第41-42页 |
| ·差异表达基因Gene Ontology显著性富集分析 | 第42-43页 |
| ·差异表达基因聚类分析 | 第43页 |
| ·差异表达基因Pathway显著性富集分析 | 第43页 |
| ·差异表达基因的Mapman生物学功能分析 | 第43页 |
| ·开花相关基因Real-Time PCR验证 | 第43页 |
| ·结果与分析 | 第43-86页 |
| ·RNA提取质量检测 | 第43-44页 |
| ·RNA-seq(quantification)测序数据和质量评估 | 第44-47页 |
| ·不同分化阶段6个样品的高丰度表达基因分析 | 第47-49页 |
| ·差异表达基因筛选 | 第49-53页 |
| ·Gene Ontology功能注释及显著性富集分析 | 第53-66页 |
| ·差异表达基因PageMan分析 | 第66-68页 |
| ·差异表达基因聚类分析 | 第68-71页 |
| ·差异表达基因KEGG Pathway显著性富集分析 | 第71-77页 |
| ·差异表达基因Mapman分析 | 第77-82页 |
| ·百子莲中与开花相关的基因 | 第82-84页 |
| ·百子莲花芽分化过程中相关基因的表达模式验证 | 第84-86页 |
| ·讨论 | 第86-94页 |
| ·百子莲成花转变过程中差异表达基因的筛选与分析 | 第86-87页 |
| ·百子莲成花转变过程中生物学功能基因 | 第87-89页 |
| ·百子莲成花转变过程中的转录因子 | 第89-90页 |
| ·百子莲成花转变的分子调控途径 | 第90-94页 |
| ·本章小结 | 第94-96页 |
| 4 控温栽培百子莲花芽比较转录组分析 | 第96-129页 |
| ·材料与方法 | 第96页 |
| ·植物材料 | 第96页 |
| ·试验方法及比较转录组数据分析 | 第96页 |
| ·结果与分析 | 第96-124页 |
| ·RNA提取质量检测 | 第96-97页 |
| ·RNA-seq(quantification)测序数据和质量评估 | 第97-98页 |
| ·差异表达基因筛选 | 第98-100页 |
| ·Gene Ontology功能注释及显著性富集分析 | 第100-107页 |
| ·差异表达基因PageMan分析 | 第107-109页 |
| ·差异表达基因聚类分析 | 第109-114页 |
| ·差异表达基因KEGG Pathway显著性富集分析 | 第114-119页 |
| ·差异表达基因Mapman分析 | 第119-122页 |
| ·不同栽培条件的百子莲开花相关基因表达差异 | 第122-124页 |
| ·讨论 | 第124-128页 |
| ·百子莲花芽分化过程中物质能量代谢途径 | 第124-127页 |
| ·百子莲成花转变的调控基因 | 第127-128页 |
| ·本章小结 | 第128-129页 |
| 5 百子莲ApCOL、ApFT和ApVIN3基因的克隆及表达分析 | 第129-151页 |
| ·材料与方法 | 第129-135页 |
| ·植物材料 | 第129页 |
| ·试验方法 | 第129-135页 |
| ·结果与分析 | 第135-148页 |
| ·百子莲ApCOL基因的克隆与表达分析 | 第135-140页 |
| ·百子莲ApFT基因的克隆与表达分析 | 第140-143页 |
| ·百子莲ApVIN3基因的克隆与表达分析 | 第143-148页 |
| ·讨论 | 第148-149页 |
| ·ApCOL、ApFT和ApVIN3的获得与生物信息学分析 | 第148页 |
| ·ApCOL、ApFT和ApVIN3的时空表达分析 | 第148-149页 |
| ·本章小结 | 第149-151页 |
| 结论 | 第151-153页 |
| 参考文献 | 第153-165页 |
| 附录 | 第165-171页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第171-172页 |
| 致谢 | 第172-173页 |
