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鸡CFL2基因遗传变异及其效应与表达的研究

致谢第1-9页
摘要第9-10页
1 文献综述第10-24页
   ·肌纤维特性的研究进展第10-13页
     ·肌纤维的组织学结构第10页
     ·肌纤维的生长发育及转化规律第10-11页
     ·肌纤维特性的影响因素第11-12页
       ·遗传因素第11页
       ·营养和环境因素第11-12页
       ·性别因素第12页
       ·不同生长阶段第12页
     ·肌纤维与肉质性状的关系第12-13页
   ·与肌纤维特性相关基因的研究第13-16页
     ·Myod 基因家族第13-14页
     ·肌肉生长抑制素(Myostatin)基因第14-15页
     ·肌钙蛋白酶抑制蛋白(calpastatin,CAST)第15页
     ·Pax 基因家族第15-16页
   ·CFL2 基因的研究进展第16-19页
     ·CFL2 基因表达第16页
     ·CFL2 基因结构第16-17页
     ·CFL2 蛋白结构第17页
     ·CFL2 蛋白功能第17-18页
       ·CFL2 对肌肉的作用第17-18页
       ·CFL2 其它生物学功能第18页
     ·CFL2 基因与疾病第18-19页
   ·单核苷酸多态性(SNP)第19-24页
     ·SNP 概述第19页
     ·SNPS 的特点第19-20页
       ·SNPS 为双等位型标记。第19页
       ·SNPS 在DNA 分子水平上的分布不均匀。第19页
       ·SNPS 的密度比较高。第19-20页
       ·SNPS 的遗传稳定性较强。第20页
       ·SNPS 的检测和分析易实现自动化。第20页
     ·SNPs 的检测方法第20-21页
       ·直接测序第20页
       ·单链构象多态性第20页
       ·限制性片段长度多态性(PCR‐RFLP)第20-21页
       ·CRS‐PCR‐RFLP第21页
       ·变性高效液相色谱第21页
       ·基因芯片第21页
     ·SNPS 在家禽中的研究第21-23页
     ·研究SNPS 的意义第23-24页
       ·构建高密度遗传连锁图谱第23页
       ·分析群体遗传进化进程第23页
       ·进行疾病诊断第23-24页
2 引言第24-25页
3 鸡CFL2 基因多态性与经济性状的相关性分析第25-46页
   ·材料与方法第25-30页
     ·试验材料第25-26页
       ·试验动物与血样第25页
       ·试验主要试剂第25页
       ·主要试剂的配制第25-26页
       ·主要仪器第26页
     ·试验方法第26-29页
       ·鸡基因组DNA 提取第26页
       ·引物设计与合成第26-27页
       ·琼脂糖凝胶电泳检测DNA第27页
       ·引物的稀释第27页
       ·最佳 PCR 条件的建立第27-28页
       ·扩增产物的PCR‐RFLP第28-29页
       ·图像分析第29页
       ·测序第29页
     ·数据统计分析第29-30页
       ·基因频率和基因型频率第29页
       ·遗传多态性分析第29页
       ·基因效应分析模型第29-30页
   ·结果与分析第30-42页
     ·鸡CFL2 基因遗传变异的检测第30-33页
       ·不同位点PCR 扩增结果第30页
       ·鸡CFL2 基因SNP 检测结果分析第30-31页
       ·鸡CFL2 基因2 个SNP 位点的酶切分析第31-32页
       ·鸡CFL2 基因T853G、G2545A 位点不同基因型和基因频率统计第32-33页
       ·鸡CFL2 基因T853G、G2545A 位点的群体遗传特性第33页
     ·鸡CFL2 基因单位点SNP 与生产性状的关联分析第33-42页
       ·鸡CFL2 基因T853G 多态位点与生长性状的关联分析第33页
       ·CFL2 基因T853G 位点不同基因型与肌纤维、肉质性状的关联分析第33-34页
       ·CFL2 基因T853G 位点不同基因型与屠宰性状的关联分析第34页
       ·CFL2 基因T853G 位点不同基因型与不同血液生理生化指标的关联分析第34页
       ·CFL2 基因G2545A 位点不同基因型与生长性状的关联分析第34页
       ·CFL2 基因G2545A 位点不同基因型与肌纤维、肉质性状的关联分析第34页
       ·CFL2 基因G2545A 位点不同基因型与屠宰性状的关联分析第34-35页
       ·CFL2 基因G2545A 位点不同基因型与不同血液生理生化指标的关联分析第35-42页
   ·讨论第42-44页
     ·CFL2 基因遗传变异的检测及其技术第42页
     ·鸡CFL2 基因2 个SNPS 在F2 代资源群的遗传特性第42-43页
     ·鸡CFL2 基因多态位点与鸡生产性状关联分析第43-44页
   ·小结第44-46页
4 丝毛乌骨鸡CFL2 基因的克隆及生物信息学分析第46-60页
   ·试验材料第46页
     ·试验材料第46页
     ·酶与试剂第46页
     ·主要仪器第46页
   ·试验方法第46-50页
     ·引物的设计与合成第46页
     ·总RNA 的提取第46-47页
     ·RNA 浓度的测定第47页
     ·反转录反应第47页
     ·PCR 反应第47-48页
     ·PCR 产物的回收和纯化第48页
     ·基因克隆第48-49页
       ·连接反应体系第48-49页
       ·DNA 的转化第49页
       ·菌液PCR 鉴定第49页
       ·测序第49页
     ·序列的生物信息学分析软件及方法第49-50页
   ·结果与分析第50-57页
     ·总RNA 提取第50页
     ·RT‐PCR 结果第50-51页
     ·菌液PCR 的鉴定第51页
     ·目的片段测序结果及分析第51-52页
     ·鸡 CFL2 基因生物信息学分析第52-57页
       ·开放阅读框(ORF)的确定第52-53页
       ·鸡CFL2 基因CDS 区序列的碱基组成第53页
       ·鸡CFL2 基因CDS 密码子使用及氨基酸组成第53-54页
       ·鸡CFL2 蛋白磷酸化位点的预测第54-55页
       ·CFL2 蛋白疏水性分析第55页
       ·鸡 CFL2 蛋白跨膜螺旋特征预测第55页
       ·鸡CFL2 蛋白二级结构预测第55-56页
       ·鸡 CFL2 蛋白信号肽序列的预测第56页
       ·鸡 CFL2 蛋白保守结构域及同源三级结构预测第56-57页
       ·鸡的CFL2 氨基酸序列与其他物种的比对第57页
   ·讨论第57-59页
     ·鸡CFL2 基因克隆序列的分析第57-58页
     ·鸡CFL2 蛋白结构及功能的预测与分析第58-59页
   ·小结第59-60页
5 鸡CFL2 基因不同周龄组织表达的研究第60-65页
   ·试验材料和方法第60-61页
     ·试验材料第60-61页
       ·试验动物与来源第60页
       ·饲养管理第60页
       ·样品采集第60页
       ·主要试剂及配制第60页
       ·主要仪器第60-61页
     ·试验方法第61页
       ·PCR 引物设计与合成第61页
       ·总RNA 的提取第61页
       ·RNA 浓度的测定第61页
       ·反转录反应第61页
       ·实时荧光定量PCR第61页
       ·数据分析第61页
   ·结果与分析第61-63页
     ·目的片段的常规PCR 结果第61-62页
     ·同周龄不同组织CFL2 基因mRNA 水平差异的比较第62页
     ·不同周龄相同组织CFL2 基因mRNA 水平的变化规律第62-63页
   ·讨论第63-64页
   ·小结第64-65页
6 结论第65-66页
参考文献第66-70页
ABSTRACT第70页

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