棉花纤维发育转录图谱的构建
| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 缩略词表 | 第11-12页 |
| 前言 | 第12-21页 |
| 1 遗传标记 | 第12-16页 |
| ·遗传标记的发展 | 第12页 |
| ·分子标记 | 第12-16页 |
| ·SSR标记 | 第12-13页 |
| ·EST-SSR标记 | 第13页 |
| ·SRAP标记 | 第13-14页 |
| ·SSCP标记 | 第14-16页 |
| 2 遗传作图 | 第16-19页 |
| ·基因组图谱的种类 | 第16-18页 |
| ·遗传图谱 | 第16页 |
| ·物理图谱 | 第16页 |
| ·转录图谱 | 第16-17页 |
| ·序列图谱 | 第17-18页 |
| ·棉花遗传作图的发展 | 第18-19页 |
| ·棉花遗传连锁图的发展 | 第18页 |
| ·棉花转录图谱的发展 | 第18-19页 |
| 3 差异显示反转录技术 | 第19-20页 |
| 4 棉花纤维发育过程 | 第20-21页 |
| 本研究目的、意义及研究内容 | 第21-27页 |
| 1 供试材料 | 第22页 |
| 2 实验方法 | 第22-27页 |
| ·海岛棉、陆地棉纤维发育的差异显示 | 第22-24页 |
| ·实验材料准备 | 第22页 |
| ·cDNA-SRAP差异显示 | 第22页 |
| ·差异片段的回收、克隆 | 第22-24页 |
| ·差异序列测序和功能预测 | 第24页 |
| ·功能标记的开发与定位 | 第24-25页 |
| ·功能标记的开发 | 第24页 |
| ·功能标记的定位 | 第24-25页 |
| ·纤维发育转录图谱构建 | 第25-27页 |
| ·作图群体准备 | 第25页 |
| ·群体的EST-SSR分析 | 第25页 |
| ·转录图谱的构建 | 第25-27页 |
| 结果与分析 | 第27-42页 |
| 1 RNA的质量 | 第27页 |
| 2 海岛棉、陆地棉纤维发育的差异显示 | 第27-30页 |
| ·cDNA-SRAP差异显示 | 第27-28页 |
| ·差异条带的收集 | 第28-29页 |
| ·差异序列的功能预测 | 第29-30页 |
| 3 功能标记的开发和定位 | 第30页 |
| 4 纤维发育转录图谱的构建 | 第30-40页 |
| ·EST-SSR引物分析 | 第30-35页 |
| ·引物来源 | 第30-32页 |
| ·引物多态性分析 | 第32-34页 |
| ·扩增产物的分析 | 第34-35页 |
| ·转录图谱的构建 | 第35-40页 |
| ·转录图谱的基本特征 | 第35-40页 |
| ·序列的功能分析 | 第40页 |
| 5 从标记的共显性探讨海陆表达差异 | 第40-41页 |
| 6 各个发育时期纤维的EST-SSR分析 | 第41-42页 |
| 讨论 | 第42-46页 |
| 1 海岛棉、陆地棉纤维发育的差异显示 | 第42-43页 |
| 2 棉花纤维转录图谱的构建 | 第43-45页 |
| ·棉纤维转录图构建的必要性和展望 | 第43-44页 |
| ·关于本实验作图方法的选择 | 第44页 |
| ·关于作图群体的选择 | 第44-45页 |
| ·关于不在转录图中的标记 | 第45页 |
| 3 SSCP在棉花分子生物学研究中的应用 | 第45页 |
| 4 关于实验的影响因素 | 第45-46页 |
| 参考文献 | 第46-51页 |
| 致谢 | 第51-52页 |
| 附录1 基本操作 | 第52-59页 |
| 附录2 差异序列功能注释 | 第59-61页 |
| 附录3 ESTs功能注释 | 第61-62页 |
