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盐胁迫下耐辐射全局调控蛋白IrrE在大肠杆菌及其rpoS突变株中的功能研究

摘要第1-7页
Abstract第7-14页
第一章 引言第14-35页
   ·转基因技术在植物抗旱耐盐等方面的研究与应用第15-19页
     ·功能基因第15-17页
     ·转录因子第17-18页
     ·信号因子第18-19页
   ·耐辐射微生物及其基因资源第19-24页
     ·耐辐射微生物的种类与分布第19-21页
     ·耐辐射异常球菌抗辐射机制的研究进展第21-23页
     ·耐辐射微生物的基因资源及在农业上的应用展望第23-24页
   ·调控蛋白IrrE 的研究进展第24-30页
     ·IrrE 蛋白的晶体结构研究第25-26页
     ·IrrE 蛋白在辐射应答和DNA 修复中的调控作用第26-29页
     ·IrrE 蛋白在其他生物中的作用第29-30页
   ·细菌耐盐机制的研究进展第30-33页
     ·细菌对高渗胁迫的调控机制第30-32页
     ·RpoS 在大肠杆菌渗透胁迫应答中的作用第32-33页
   ·立题依据第33-34页
   ·技术路线第34-35页
第二章 盐冲击条件下IrrE 增强大肠杆菌海藻糖和甘油的积累第35-53页
   ·材料与方法第35-42页
     ·试验菌株第35页
     ·培养基、酶类及主要生化试剂和耗材第35-36页
     ·主要仪器第36页
     ·引物设计与合成第36页
     ·菌体细胞内钾离子含量的测定第36-37页
     ·菌体细胞内海藻糖和甘油含量的测定第37-38页
     ·菌体细胞内甜菜碱含量的测定第38页
     ·用于实时荧光定量PCR 试验菌株的培养条件与处理第38页
     ·RNA 的提取与纯化第38-39页
     ·RNA 定量与质量检验第39页
     ·RNA 反转录合成单链cDNA第39-40页
     ·细菌基因组的提取与实时荧光定量PCR 引物的验证第40-41页
     ·实时荧光定量PCR 与数据处理第41-42页
   ·结果第42-49页
     ·E. coli MGE 和E. coli MGT 细胞内钾离子含量的变化第42-43页
     ·利用HPLC 检测细胞内的海藻糖和甘油第43页
     ·E. coli MGE 和E. coli MGT 细胞内海藻糖含量的变化第43-44页
     ·E. coli MGE 和E. coli MGT 细胞内甘油含量的变化第44页
     ·E. coli MGE 和E. coli MGT 细胞内甜菜碱含量的变化第44-45页
     ·RNA 的质量检验与引物的验证第45-46页
     ·转irrE 菌株中海藻糖相关基因的表达水平第46-47页
     ·转irrE 菌株中甘油相关基因的表达水平第47页
     ·转irrE 菌株中抗逆相关基因的表达水平第47-49页
   ·讨论第49-53页
     ·调控蛋白IrrE 对大肠杆菌非生物胁迫抗性的影响第49-50页
     ·调控蛋白IrrE 对大肠杆菌细胞内渗透保护物质的影响第50-53页
第三章 IrrE 在大肠杆菌rpoS 突变株中的表达及胁迫研究第53-72页
   ·材料与方法第53-62页
     ·试验菌株与质粒第53页
     ·培养基、酶类及主要生化试剂和耗材第53-54页
     ·主要仪器第54页
     ·引物设计与合成第54页
     ·琼脂糖凝胶中DNA 片段的回收第54页
     ·碱裂解法提取质粒第54-55页
     ·感受态细胞的制备及热击转化方法第55页
     ·重叠延伸PCR 构建融合重组基因第55-57页
     ·将pKD46 转入E. coli JM109第57页
     ·含有pKD46 的E. coli JM109 电击转化感受态细胞的制备第57-58页
     ·线性DNA 的转化及rpoS 突变株的筛选第58页
     ·突变株的鉴定第58页
     ·转irrE 基因的rpoS 突变株与对照菌株的构建和验证第58-59页
     ·转irrE 基因的rpoS 突变株的Western blot 检测第59-61页
     ·突变株在含盐培养基中的生长曲线第61页
     ·突变株对非生物胁迫的抗性分析的第61-62页
     ·利用Biolog 板分析突变株的代谢变化第62页
   ·结果第62-70页
     ·rpoS 基因同源序列和Cm 抗性盒的克隆第62-63页
     ·含抗性盒线性片段的获得第63-64页
     ·突变株的分子验证第64页
     ·IrrE 在大肠杆菌rpoS 突变株中的表达第64-66页
     ·E. coli RE 和E. coli RT 在含盐培养基中的生长曲线第66-67页
     ·E. coli RE 和E. coli RT 在高温、氧化和盐冲击下的生存能力第67-68页
     ·Biolog 分析E. coli RE 和E. coli RT 的代谢变化情况第68-70页
   ·讨论第70-72页
结论第72-73页
参考文献第73-82页
附录第82-84页
致谢第84-85页
作者简介第85页

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