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基于化学基因组学的活性化合物与新靶点发现

摘要第4-6页
abstract第6-7页
第1章 引言第13-25页
    1.1 化学基因组学概述第13-16页
    1.2 酿酒酵母的基因组学研究现状第16-18页
    1.3 基于酿酒酵母的化学基因组学研究方法及应用第18-21页
    1.4 拟解决的科学问题与研究意义第21-22页
    1.5 研究路线和方法第22-25页
第2章 基于化学基因组学的活性化合物与新靶点发现第25-68页
    2.1 前言第25-28页
        2.1.1 酿酒酵母基因缺失突变菌株构建原理第25-26页
        2.1.2 化合物与酵母基因相互作用研究原理第26-28页
    2.2 实验材料第28-32页
        2.2.1 酵母菌株第28-29页
        2.2.2 高通量筛选化合物第29页
        2.2.3 抗体与试剂第29-31页
        2.2.4 细胞与质粒第31页
        2.2.5 实验设备第31-32页
    2.3 实验方法第32-41页
        2.3.1 高通量筛选模型的建立与优化第32-33页
        2.3.2 基于酵母生长活性的初筛第33-34页
        2.3.3 对活性化合物进行化学基因组学研究的复筛第34-37页
        2.3.4 数据处理和靶点预测第37-38页
        2.3.5 化学基因组图谱相关性分析第38-39页
        2.3.6 哺乳动物细胞培养第39页
        2.3.7 共聚焦荧光成像第39-40页
        2.3.8 免疫印迹第40-41页
        2.3.9 透射电镜第41页
        2.3.10 统计学分析第41页
    2.4 实验结果第41-63页
        2.4.1 高通量筛选模型的建立与优化第41-43页
        2.4.2 高通量活性化合物筛选第43-44页
        2.4.3 活性化合物功能预测第44-47页
        2.4.4 高可信预测化合物功能分布第47-48页
        2.4.5 化学基因组图谱相关性分析第48-49页
        2.4.6 生物学功能验证第49-59页
        2.4.7 5种重新设计新菌株库的化学基因组筛选第59-61页
        2.4.8 针对HET菌株的化学基因组筛选第61-63页
    2.5 总结与讨论第63-68页
第3章 生长激素释放激素受体与G蛋白复合物的结构与功能研究第68-104页
    3.1 前言第68-73页
        3.1.1 G蛋白偶联受体第68-69页
        3.1.2 B1类分泌素受体第69-71页
        3.1.3 生长激素释放激素受体第71-72页
        3.1.4 研究路线和主要方法第72-73页
    3.2 实验材料第73-77页
        3.2.1 细胞和质粒第73页
        3.2.2 引物序列第73-74页
        3.2.3 试剂与耗材第74-77页
        3.2.4 主要仪器设备第77页
    3.3 实验方法第77-90页
        3.3.1 Bac-to-Bac杆状病毒表达系统第77页
        3.3.2 大肠杆菌培养第77-78页
        3.3.3 质粒构建第78-83页
        3.3.4 蓝白斑筛选第83页
        3.3.5 杆粒提取与鉴定第83-84页
        3.3.6 昆虫细胞培养与转染第84-85页
        3.3.7 P0代病毒收集扩增以及滴度检测第85页
        3.3.8 Nb35的表达纯化第85-87页
        3.3.9 复合物蛋白表达和纯化第87-89页
        3.3.10 负染第89-90页
    3.4 实验结果第90-102页
        3.4.1 表达载体的筛选第90-92页
        3.4.2 受体C端截短优化第92-93页
        3.4.3 MOI优化第93-95页
        3.4.4 复合物二次纯化第95-97页
        3.4.5 稳定性突变筛选第97-98页
        3.4.6 激动剂配体的筛选第98-100页
        3.4.7 MBP亲和标签的优化第100-102页
    3.5 总结与讨论第102-104页
第4章 结论与展望第104-106页
参考文献第106-117页
附录第117-121页
致谢第121-123页
作者简历及攻读学位期间发表的学术论文与研究成果第123页

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