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利用DIA方法研究长角血蜱叮咬对兔皮肤蛋白的表达量和磷酸化修饰的影响

摘要第4-6页
Abstract第6-8页
第一章 综述第11-19页
    1.1 蜱类简介第11页
    1.2 蜱叮咬特性与宿主防御第11-13页
    1.3 蛋白质组学研究现状及发展趋势第13-14页
    1.4 修饰蛋白质组学与磷酸化蛋白质组学第14-16页
    1.5 蜱与蛋白质组学第16-17页
    1.6 研究目的及意义第17-19页
第二章 长角血蜱叮咬对兔皮肤组织全蛋白的影响第19-47页
    2.1 实验材料第19-21页
        2.1.1 实验动物及分组第19页
        2.1.2 实验耗材及仪器第19-20页
        2.1.3 实验试剂第20-21页
    2.2 实验方法第21-25页
        2.2.1 实验动物及皮肤样品的获取第21页
        2.2.2 蛋白的提取和酶解第21-22页
        2.2.3 用高效液相色谱进行DDA样品分离建库第22-23页
        2.2.4 DDA建库分析第23-24页
        2.2.5 DIA数据分析第24页
        2.2.6 蛋白质鉴定与数据分析第24-25页
        2.2.7 生物信息学分析第25页
    2.3 实验结果第25-42页
        2.3.1 被长角血蜱叮咬后兔皮肤蛋白的定量蛋白质组第25-31页
        2.3.2 长角血蜱叮咬造成兔皮肤蛋白的差异表达第31-36页
        2.3.3 差异表达蛋白GO富集分析第36-39页
        2.3.4 差异表达蛋白KEGG通路分析第39-42页
    2.4 讨论第42-47页
        2.4.1 吞噬作用通路第42-44页
        2.4.2 凝血和伤口愈合相关蛋白第44-45页
        2.4.3 毛发生长相关蛋白第45-47页
第三章 长角血蜱叮咬对兔皮肤组织磷酸化修饰的影响第47-63页
    3.1 实验材料第47-48页
        3.1.1 实验动物及分组第47页
        3.1.2 实验耗材及仪器第47页
        3.1.3 实验试剂第47-48页
    3.2 实验方法第48-51页
        3.2.1 实验动物及皮肤样品的获取第48页
        3.2.2 蛋白的提取和酶解第48页
        3.2.3 磷酸化多肽富集第48页
        3.2.4 磷酸化样品DDA建库分析第48-49页
        3.2.5 磷酸化样品DIA数据分析第49-50页
        3.2.6 蛋白质鉴定与数据分析第50页
        3.2.7 生物信息学分析第50-51页
    3.3 实验结果第51-58页
        3.3.1 被长角血蜱叮咬后兔皮肤蛋白的定量磷酸化蛋白质组第51-52页
        3.3.2 长角血蜱叮咬造成兔皮肤磷酸化位点的差异表达第52-55页
        3.3.3 磷酸化GO注释第55页
        3.3.4 差异表达蛋白KEGG通路分析第55-57页
        3.3.5 差异表达蛋白的相互作用分析第57-58页
    3.4 讨论第58-63页
参考文献第63-73页
致谢第73-75页
攻读学位期间取得的科研成果第75页

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