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基于结核病的基因芯片数据挖掘及生物信息学分析

中文摘要第5-6页
英文摘要第6-7页
第一章 绪论第8-17页
    1.1 结核病简介第8-9页
        1.1.1 结核病概况第8-9页
        1.1.2 结核病的致病机制第9页
    1.2 结核病相关研究进展第9-12页
        1.2.1 结核病的相关诊断方法第9-10页
        1.2.2 结核病标志物的研究现状第10-12页
    1.3 研究目的和意义第12页
    1.4 本文所涉及的主要理论基础知识第12-17页
        1.4.1 基因芯片数据第12-13页
        1.4.2 基因差异表达分析第13页
        1.4.3 生物信息学第13-14页
        1.4.4 分类算法第14-17页
第二章 基于结核病基因表达谱芯片数据挖掘识别易感基因第17-25页
    2.1 数据和方法第17-19页
        2.1.1 芯片数据的来源第17页
        2.1.2 特征基因的选取第17-18页
        2.1.3 模型的构造第18页
        2.1.4 模型的验证第18-19页
    2.2 结果第19-23页
        2.2.1 芯片数据的预处理第19页
        2.2.2 特征基因的选取第19页
        2.2.3 模型的构造第19-21页
        2.2.4 模型的验证第21-22页
        2.2.5 易感候选基因的生物验证第22-23页
    2.3 讨论第23-24页
    2.4 小结第24-25页
第三章 结核病患者外周血液中分子标志物生物信息学分析第25-37页
    3.1 数据与方法第25-27页
        3.1.1 微阵列数据来源第25页
        3.1.2 差异共表达基因筛选第25-26页
        3.1.3 GO功能与KEGG通路分析第26-27页
        3.1.4 蛋白互作网络与模块分析第27页
        3.1.5 诊断支持模型的构建第27页
    3.2 分析结果第27-34页
        3.2.1 差异共表达基因筛选第27-28页
        3.2.2 差异共表达基因的GO功能与KEGG通路分析第28-32页
        3.2.3 差异共表达基因对应的蛋白互作网络与模块分析第32-34页
        3.2.4 差异表达候选生物标志物的验证第34页
    3.3 讨论第34-36页
    3.4 小结第36-37页
第四章 讨论和展望第37-38页
参考文献第38-44页
攻读硕士学位期间的研究成果第44-45页
致谢第45页

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