中文摘要 | 第5-6页 |
英文摘要 | 第6-7页 |
第一章 绪论 | 第8-17页 |
1.1 结核病简介 | 第8-9页 |
1.1.1 结核病概况 | 第8-9页 |
1.1.2 结核病的致病机制 | 第9页 |
1.2 结核病相关研究进展 | 第9-12页 |
1.2.1 结核病的相关诊断方法 | 第9-10页 |
1.2.2 结核病标志物的研究现状 | 第10-12页 |
1.3 研究目的和意义 | 第12页 |
1.4 本文所涉及的主要理论基础知识 | 第12-17页 |
1.4.1 基因芯片数据 | 第12-13页 |
1.4.2 基因差异表达分析 | 第13页 |
1.4.3 生物信息学 | 第13-14页 |
1.4.4 分类算法 | 第14-17页 |
第二章 基于结核病基因表达谱芯片数据挖掘识别易感基因 | 第17-25页 |
2.1 数据和方法 | 第17-19页 |
2.1.1 芯片数据的来源 | 第17页 |
2.1.2 特征基因的选取 | 第17-18页 |
2.1.3 模型的构造 | 第18页 |
2.1.4 模型的验证 | 第18-19页 |
2.2 结果 | 第19-23页 |
2.2.1 芯片数据的预处理 | 第19页 |
2.2.2 特征基因的选取 | 第19页 |
2.2.3 模型的构造 | 第19-21页 |
2.2.4 模型的验证 | 第21-22页 |
2.2.5 易感候选基因的生物验证 | 第22-23页 |
2.3 讨论 | 第23-24页 |
2.4 小结 | 第24-25页 |
第三章 结核病患者外周血液中分子标志物生物信息学分析 | 第25-37页 |
3.1 数据与方法 | 第25-27页 |
3.1.1 微阵列数据来源 | 第25页 |
3.1.2 差异共表达基因筛选 | 第25-26页 |
3.1.3 GO功能与KEGG通路分析 | 第26-27页 |
3.1.4 蛋白互作网络与模块分析 | 第27页 |
3.1.5 诊断支持模型的构建 | 第27页 |
3.2 分析结果 | 第27-34页 |
3.2.1 差异共表达基因筛选 | 第27-28页 |
3.2.2 差异共表达基因的GO功能与KEGG通路分析 | 第28-32页 |
3.2.3 差异共表达基因对应的蛋白互作网络与模块分析 | 第32-34页 |
3.2.4 差异表达候选生物标志物的验证 | 第34页 |
3.3 讨论 | 第34-36页 |
3.4 小结 | 第36-37页 |
第四章 讨论和展望 | 第37-38页 |
参考文献 | 第38-44页 |
攻读硕士学位期间的研究成果 | 第44-45页 |
致谢 | 第45页 |