| 摘要 | 第6-7页 |
| abstract | 第7-8页 |
| 英文缩略表 | 第13-14页 |
| 第一章 绪论 | 第14-35页 |
| 1.1 引言 | 第14页 |
| 1.2 植物抗病基因研究 | 第14-23页 |
| 1.2.1 植物抗病基因概述 | 第14-18页 |
| 1.2.2 NBS-LRR类抗病基因研究进展 | 第18-21页 |
| 1.2.3 棉花黄萎病抗病基因研究进展 | 第21-23页 |
| 1.3 植物抗病性遗传规律研究 | 第23-28页 |
| 1.3.1 植物抗病性遗传规律概述 | 第23-24页 |
| 1.3.2 棉花黄萎病抗性遗传规律研究进展 | 第24-26页 |
| 1.3.3 棉花抗黄萎病QTL定位研究进展 | 第26-28页 |
| 1.4 植物全基因组关联分析研究 | 第28-34页 |
| 1.4.1 植物全基因组关联分析概述 | 第28-30页 |
| 1.4.2 植物全基因组关联分析研究进展 | 第30-33页 |
| 1.4.3 棉花全基因组关联分析研究进展 | 第33-34页 |
| 1.5 本研究目的与意义 | 第34-35页 |
| 第二章 棉花抗黄萎病关联群体构建及群体结构分析 | 第35-43页 |
| 2.1 实验材料、试剂和仪器 | 第35页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第35页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第35页 |
| 2.1.3 主要仪器 | 第35页 |
| 2.2 实验方法 | 第35-36页 |
| 2.2.1 基因组DNA提取及质量检测 | 第35页 |
| 2.2.2 SLAF酶切方案预测 | 第35-36页 |
| 2.2.3 样品建库测序分析 | 第36页 |
| 2.2.4 生物信息学分析 | 第36页 |
| 2.3 实验结果 | 第36-41页 |
| 2.3.1 种质收集与评估 | 第36-37页 |
| 2.3.2 样品DNA质量评估 | 第37页 |
| 2.3.3 SLAF标签及SNPs信息统计 | 第37-38页 |
| 2.3.4 个体间亲缘关系评估 | 第38-39页 |
| 2.3.5 群体结构分析 | 第39-40页 |
| 2.3.6 群体遗传关系分析 | 第40-41页 |
| 2.3.7 群体连锁不平衡分析 | 第41页 |
| 2.4 讨论 | 第41-43页 |
| 第三章 棉花抗黄萎病全基因组关联分析 | 第43-52页 |
| 3.1 实验材料、试剂和仪器 | 第43页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第43页 |
| 3.1.2 主要试剂 | 第43页 |
| 3.1.3 主要仪器 | 第43页 |
| 3.2 实验方法 | 第43-44页 |
| 3.2.1 棉花病圃种植 | 第43页 |
| 3.2.2 棉花温室种植 | 第43-44页 |
| 3.2.3 棉花抗黄萎病性状调查 | 第44页 |
| 3.2.4 生物信息学分析 | 第44页 |
| 3.3 实验结果 | 第44-48页 |
| 3.3.1 黄萎病抗性表型分析 | 第44-45页 |
| 3.3.2 棉花抗黄萎病全基因组关联分析 | 第45-47页 |
| 3.3.3 关联SNPs标记与QTLs比较分析 | 第47页 |
| 3.3.4 黄萎病抗性相关优异SNPs鉴定 | 第47-48页 |
| 3.3.5 单倍型模块及候选基因分析 | 第48页 |
| 3.4 讨论 | 第48-52页 |
| 第四章 候选抗性位点VwRL3内抗病基因鉴定 | 第52-62页 |
| 4.1 实验材料、试剂和仪器 | 第52页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第52页 |
| 4.1.2 主要试剂 | 第52页 |
| 4.1.3 主要仪器 | 第52页 |
| 4.2 实验方法 | 第52-54页 |
| 4.2.1 VwRL3位点内候选基因VIGS沉默分析 | 第52-53页 |
| 4.2.2 ZZM2沉默后对大丽轮枝菌的抗性鉴定 | 第53页 |
| 4.2.3 VwRL3位点内候选基因表达分析 | 第53页 |
| 4.2.4 拟南芥遗传转化及纯系筛选 | 第53页 |
| 4.2.5 拟南芥对大丽轮枝菌的抗性鉴定 | 第53-54页 |
| 4.3 实验结果 | 第54-60页 |
| 4.3.1 VwRL3位点内候选基因VIGS沉默分析 | 第54-55页 |
| 4.3.2 ZZM2沉默植株黄萎病抗性鉴定 | 第55页 |
| 4.3.3 VwRL3位点内候选基因表达模式分析 | 第55-57页 |
| 4.3.4 GhTNL1拟南芥过表达株系黄萎病抗性鉴定 | 第57-58页 |
| 4.3.5 GhTNL1拟南芥同源突变体黄萎病抗性鉴定 | 第58页 |
| 4.3.6 同源突变体tnl1异源回补株系黄萎病抗性鉴定 | 第58-60页 |
| 4.4 讨论 | 第60-62页 |
| 第五章 GhTNL1基因抗黄萎病功能解析 | 第62-75页 |
| 5.1 实验材料、试剂和仪器 | 第62-63页 |
| 5.1.1 实验材料 | 第62页 |
| 5.1.2 主要试剂 | 第62页 |
| 5.1.3 主要仪器 | 第62-63页 |
| 5.2 实验方法 | 第63-64页 |
| 5.2.1 GhTNL1基因序列比对及进化树构建 | 第63页 |
| 5.2.2 GhTNL1基因激素诱导及不同组织表达模式分析 | 第63页 |
| 5.2.3 GhTNL1基因亚细胞定位研究 | 第63页 |
| 5.2.4 拟南芥中JA途径相关基因表达检测 | 第63页 |
| 5.2.5 烟草叶片农杆菌介导的瞬时转化 | 第63-64页 |
| 5.2.6 拟南芥及烟草中DAB染色观察 | 第64页 |
| 5.3 实验结果 | 第64-72页 |
| 5.3.1 GhTNL1基因系统发育分析及序列比对 | 第64-66页 |
| 5.3.2 GhTNL1基因表达模式分析 | 第66-67页 |
| 5.3.3 GhTNL1基因亚细胞定位研究 | 第67-68页 |
| 5.3.4 GhTNL1基因影响信号通路分析 | 第68-69页 |
| 5.3.5 GhTNL1基因影响ROS活性分析 | 第69-70页 |
| 5.3.6 不同棉花材料GhTNL1基因型分析 | 第70-71页 |
| 5.3.7 不同基因型GhTNL1基因烟草瞬时转化 | 第71-72页 |
| 5.4 讨论 | 第72-75页 |
| 第六章 全文总结 | 第75-77页 |
| 参考文献 | 第77-94页 |
| 附录 | 第94-107页 |
| 致谢 | 第107-108页 |
| 作者简历 | 第108页 |
