| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第10-20页 |
| 1.1 课题背景 | 第10-11页 |
| 1.2 研究目的及意义 | 第11-13页 |
| 1.3 国内外相关技术发展现状 | 第13-16页 |
| 1.3.1 DNA结合蛋白识别研究现状 | 第13-14页 |
| 1.3.2 蛋白质远程同源性检测研究现状 | 第14-16页 |
| 1.4 本文的主要研究内容和内容安排 | 第16-20页 |
| 1.4.1 主要研究内容 | 第16-18页 |
| 1.4.2 本文内容安排 | 第18-20页 |
| 第2章 基于伪氨基酸组成的DNA结合蛋白识别方法 | 第20-32页 |
| 2.1 引言 | 第20页 |
| 2.2 伪氨基酸组成 | 第20-21页 |
| 2.3 氨基酸索引数据库 | 第21页 |
| 2.4 预测方法 | 第21-28页 |
| 2.4.1 全局氨基酸组成（OAAC） | 第21-22页 |
| 2.4.2 伪氨基酸组成（Pse AAC） | 第22-23页 |
| 2.4.3 氨基酸物理化学距离转换（PDT） | 第23-24页 |
| 2.4.4 基于三种序列特征的向量化方法 | 第24-26页 |
| 2.4.5 分类模型建立 | 第26-27页 |
| 2.4.6 留一评价方法 | 第27-28页 |
| 2.5 实验结果与分析 | 第28-31页 |
| 2.5.1 DNA结合蛋白数据集 | 第28-29页 |
| 2.5.2 性能评价指标 | 第29页 |
| 2.5.3 性能评估 | 第29-31页 |
| 2.6 本章小结 | 第31-32页 |
| 第3章 基于距离对和缩减字母表的DNA结合蛋白识别方法 | 第32-45页 |
| 3.1 引言 | 第32页 |
| 3.2 距离对 | 第32-33页 |
| 3.3 预测方法 | 第33-37页 |
| 3.3.1 蛋白质向量化方法 | 第33-37页 |
| 3.3.2 分类模型和评价 | 第37页 |
| 3.4 实验结果与分析 | 第37-43页 |
| 3.4.1 DNA结合蛋白数据集 | 第37-38页 |
| 3.4.2 性能评价指标 | 第38-39页 |
| 3.4.3 性能评估 | 第39-43页 |
| 3.5 本章小结 | 第43-45页 |
| 第4章 基于距离对的蛋白质远程同源性检测方法 | 第45-54页 |
| 4.1 引言 | 第45页 |
| 4.2 Top-n-gram距离对 | 第45-46页 |
| 4.3 预测方法 | 第46-48页 |
| 4.3.1 蛋白质向量化方法 | 第46-48页 |
| 4.3.2 分类模型建立 | 第48页 |
| 4.4 实验结果与分析 | 第48-53页 |
| 4.4.1 同源性检测数据集 | 第48-49页 |
| 4.4.2 ROC分数指标 | 第49页 |
| 4.4.3 性能评估 | 第49-53页 |
| 4.5 本章小结 | 第53-54页 |
| 第5章 基于距离对伪氨基酸组成的蛋白质远程同源性检测方法 | 第54-64页 |
| 5.1 引言 | 第54页 |
| 5.2 距离对伪氨基酸组成 | 第54-55页 |
| 5.3 预测方法 | 第55-59页 |
| 5.3.1 蛋白质向量化方法 | 第55-58页 |
| 5.3.2 主成分分析 | 第58-59页 |
| 5.4 实验结果与分析 | 第59-63页 |
| 5.4.1 分类模型和数据集 | 第59页 |
| 5.4.2 性能评估 | 第59-63页 |
| 5.5 本章小结 | 第63-64页 |
| 结论 | 第64-66页 |
| 参考文献 | 第66-75页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文及其它成果 | 第75-77页 |
| 致谢 | 第77页 |