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Enterobacter aerogenes sp.GXE3组氨酸脱羧酶hdc1基因的克隆及功能特征研究

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-8页
第一章 前言第14-29页
    1.1 氨基酸脱羧酶第14页
    1.2 生物胺第14-16页
        1.2.1 生物胺的生理作用第15-16页
        1.2.2 生物胺的毒性第16页
    1.3 组胺与组氨酸脱羧酶第16-17页
    1.4 组胺的形成机制及代谢途径第17-25页
        1.4.1 产组胺的微生物第18-22页
            1.4.1.1 微生物学法第18-19页
            1.4.1.2 分子生物学法第19-20页
            1.4.1.3 化学法第20-21页
            1.4.1.4 其它检测生物胺的方法第21-22页
        1.4.2 组氨酸脱羧酶第22-25页
            1.4.2.1 组氨酸脱羧酶蛋白结构及基因调控机制第22-24页
            1.4.2.2 影响组氨酸脱羧酶活性的因素第24页
            1.4.2.3 氨基酸和氨基酸/胺转运蛋白第24-25页
        1.4.3 生物胺的代谢途径第25页
    1.5 组胺的控制与消除第25-26页
        1.5.1 使用无氨基酸脱羧酶活性的生产菌株第25-26页
        1.5.2 生物胺降解酶第26页
            1.5.2.1 胺氧化酶(Amine oxidase)第26页
            1.5.2.2 胺脱氢酶(Amine dehydrogenases)第26页
    1.6 课题研究目的和意义第26-28页
    1.7 技术路线第28-29页
第二章 材料与方法第29-51页
    2.1 实验材料第29-34页
        2.1.1 样品来源第29页
        2.1.2 菌株和质粒第29-30页
        2.1.3 菌株保存第30页
        2.1.4 抗生素第30页
        2.1.5 常用药品与酶制剂第30-31页
        2.1.6 主要仪器及设备第31页
        2.1.7 实验试剂的配制第31-34页
            2.1.7.1 常用培养基第32页
            2.1.7.2 常用溶液第32-34页
    2.2 实验方法第34-51页
        2.2.1 微生物法筛选分离产组氨酸脱羧酶菌株第34页
        2.2.2 分子生物学法鉴定产组氨酸脱羧酶菌株第34-36页
            2.2.2.1 细菌基因组的提取第34-35页
            2.2.2.2 hdc基因验证引物的选择第35页
            2.2.2.3 PCR法检测hdc基因第35-36页
        2.2.3 化学法检验产组胺菌合成组胺的能力第36页
        2.2.4 产组胺微生物的生理生化鉴定第36页
        2.2.5 产组胺微生物16S rDNA鉴定第36-37页
        2.2.6 细菌生长曲线和pH值变化第37页
        2.2.7 质粒DNA提取第37-38页
        2.2.8 琼脂糖凝胶电泳第38页
        2.2.9 PCR产物纯化第38-39页
        2.2.10 DNA酶切与连接第39-40页
            2.2.10.1 DNA双酶切第39页
            2.2.10.2 DNA的连接第39-40页
        2.2.11 质粒DNA(连接产物)的转化第40-41页
            2.2.11.1 E.coli感受态细胞制备(电转化法)第40页
            2.2.11.2 外源DNA的电转化第40-41页
        2.2.12 hdc1基因在大肠杆菌中表达与蛋白检测及生物信息学分析第41-44页
            2.2.12.1 PCR扩增目的基因片段第41-42页
            2.2.12.2 表达重组质粒的构建第42页
            2.2.12.3 hdc1基因的生物信息学分析第42-43页
            2.2.12.4 目的蛋白的诱导表达与纯化第43-44页
        2.2.13 SDS-PAGE配制及电泳第44-45页
        2.2.14 组氨酸脱羧酶产生菌粗酶液的制备第45页
            2.2.14.1 菌体培养收集第45页
            2.2.14.2 酶液的制备第45页
        2.2.15 蛋白浓度测定第45-46页
        2.2.16 组氨酸脱羧酶酶学性质的测定第46-51页
            2.2.16.1 酶活测定原理第46页
            2.2.16.2 组胺标准曲线的制作第46-48页
            2.2.16.3 组氨酸脱羧酶酶活测定第48-49页
            2.2.16.4 组氨酸脱羧酶最适温度的测定第49页
            2.2.16.5 组氨酸脱羧酶最适pH的测定第49页
            2.2.16.6 组氨酸脱羧酶的热稳定性第49页
            2.2.16.7 组氨酸脱羧酶的pH稳定性第49页
            2.2.16.8 金属离子对组氨酸脱羧酶酶活的影响第49-50页
            2.2.16.9 化学试剂和EDTA对组氨酸脱羧酶酶活的影响第50页
            2.2.16.10 组氨酸脱羧酶的动力学参数测定第50-51页
第三章 结果与讨论第51-78页
    3.1 组氨酸脱羧酶活性菌株的鉴定第51-58页
        3.1.1 微生物法筛选分离组氨酸脱羧酶产生菌第51-52页
        3.1.2 分子生物学法鉴定组氨酸脱羧酶产生菌第52-54页
            3.1.2.1 基因组的提取第52-53页
            3.1.2.2 组氨酸脱羧酶的PCR扩增结果第53-54页
        3.1.3 化学法检验组胺的合成量第54页
        3.1.4 产组胺微生物的生理生化鉴定第54-55页
        3.1.5 产组胺微生物16S rDNA鉴定第55-57页
        3.1.6 细菌生长曲线和pH值变化第57-58页
    3.2 组氨酸脱羧酶基因的克隆第58-59页
        3.2.1 PCR扩增hdc1基因第58页
        3.2.2 hdc1基因重组质粒的构建第58-59页
    3.3 hdc1基因的生物信息学分析第59-66页
        3.3.1 pET-30a(+)/hdc1测序结果分析第59-61页
        3.3.2 多重序列比对第61-63页
        3.3.3 进化树的构建第63页
        3.3.4 Hdc1蛋白亲疏水性分析第63-64页
        3.3.5 Hdc1跨膜结构预测第64-65页
        3.3.6 Hdc1的功能结构域预测第65页
        3.3.7 Hdc1的活性位点预测第65-66页
        3.3.8 Hdc1蛋白的二级结构预测第66页
    3.4 hdc1基因的诱导表达与纯化第66-67页
    3.5 HDC及Hdc1重组蛋白的酶学性质研究第67-78页
        3.5.1 最适温度的测定第67-68页
        3.5.2 最适pH的测定第68-70页
        3.5.3 酶热稳定性的测定第70-71页
        3.5.4 酶pH稳定性的测定第71-72页
        3.5.5 金属离子对酶活的影响第72-73页
        3.5.6 化学试剂对酶活的影响第73-75页
        3.5.7 酶的动力学参数测定第75-78页
第四章 讨论第78-84页
    4.1 产组胺微生物的鉴定第78-79页
    4.2 Hdc1重组蛋白的表达第79-80页
    4.3 酶学性质第80-81页
    4.4 酶的底物谱与活性功能位点第81-84页
第五章 总结与展望第84-86页
    5.1 结论第84-85页
    5.2 展望第85-86页
参考文献第86-97页
致谢第97-98页
硕士阶段发表论文情况第98-99页
附录第99-100页

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