小鼠脑中基因调控网络的构建及功能分析
论文摘要 | 第6-9页 |
ABSTRACT | 第9-12页 |
第一章 绪论 | 第15-18页 |
第二章 基因芯片数据的获取和处理 | 第18-23页 |
第一节 基因芯片背景知识 | 第18-19页 |
第二节 基因芯片数据的获取 | 第19-20页 |
第三节 基因芯片数据的质量控制 | 第20-21页 |
第四节 差异性表达基因的挑选 | 第21-23页 |
第三章 转录因子调控网络的构建 | 第23-28页 |
第一节 转录因子调控网络的构建方法的回顾 | 第23页 |
第二节 ARACNE方法 | 第23-24页 |
第三节 ARACNE的优缺点 | 第24-26页 |
第四节 小鼠大脑中转录因子调控网络的构建 | 第26-28页 |
第四章 网络的拓扑学分析 | 第28-33页 |
第一节 背景介绍 | 第28-29页 |
第二节 本文所构建转录因子调控网络是SF网络 | 第29-31页 |
第三节 转录因子调控网络的直径 | 第31页 |
第四节 网络模体寻找 | 第31-33页 |
第五章 网络中枢纽基因的分析 | 第33-40页 |
第一节 枢纽基因的识别 | 第33-36页 |
第二节 功能注释富集分析 | 第36-40页 |
第六章 Sox10子网络 | 第40-55页 |
第一节 Sox10基因回顾 | 第40-41页 |
第二节 Sox10子网络 | 第41-55页 |
第七章 总结 | 第55-57页 |
附录 | 第57-116页 |
附录A 枢纽基因列表 | 第57-94页 |
附录B 枢纽基因GOEA分析 | 第94-114页 |
附录C 硕士期间发表及在投文章以及专利成果 | 第114-116页 |
参考文献 | 第116-127页 |
后记 | 第127页 |